均方根偏差
關注創建者：320科技工作室 創建時間：2022-12-24
均方根偏差的視頻教程
Adams&insight懸架k&c和整車平順性加權加速度均方根值仿真優化分析實例視頻教程
road_profiles.tbl.zip 本課程主要介紹了以下三部分內容： 1、如何使用adams和insight軟件，對懸架系統的k&c特性進行多目標優化； 2、如何利用adams軟件，對整車進行平順性仿真分析，并計算加權加速度均方根值； 3、如何利用adams和insight，對整車平順性仿真結果的加權加速度均方根值進行仿真優化。
￥108 2小時19分鐘 351播放
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均方根偏差的實例教程
均方根偏差分析
1.5.旋轉半徑的變化
1.6.均方根波動分析
1.7.分子兩端的距離和原了距離的分析
1.8.分子內和分子間氫鍵數的變化
1.9.徑向分布函數分析
1.10.溶劑可及表面積分析
1.11.主成分分析
1.12.二面角分析
2. 均相與多相的模擬與計算(離子液體,小分子藥物自組裝，團簇)
2.1小分子與離子液體建模
2.2氣相分子，分子團簇與納米液滴的模擬
2..3復合物構象隨時間的變化
2.4. 均方根偏差分析
2.5.旋轉半徑的變化
2.6.均方根波動分析
2.7 分子間相互作用
3.細胞膜模型構建，小分子與細胞膜相互作用
3.1磷脂分子的選擇
3.2藥物分子的建模
3.3磷脂分子力場選擇
3.4雙層膜的構建方法
3.5藥物分子與雙層膜質心距離隨時間變化
3.6藥物分子與膜分子之間形成氫鍵已經氫鍵壽命
3.7藥物分子可及表面積變化
3.8 均方根偏差分析
圖1：蛋白質與配體各殘基能量貢獻圖
圖二，蛋白質主成分分析
圖3：離子通道模型構建
圖4：雙層膜模型構建
圖5.納米球的自組裝
圖6，蛋白均方根波動
五 時間及費用
1. 教學費用：根據每次培訓的人數定價,具體聯系客服獲取當前期培訓價格.
2. 付款方式：微信，支付寶，對公轉賬等
3. 發票信息：可出具正式發票（普票）
4.
展開 汽車平順性（加權加速度均方根值）計算 ￥29.9
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</div><p><br></p><p> 以上為標準中關于平順性評價方法的介紹，使用“<strong>頻譜分析法</strong>“進行計算，步驟如下：</p><p>（1）繪制已有的加速度曲線，進行FFT轉換，得到加速度自功率譜密度函數Ga(f)；</p><p>（2）繪制頻帶的加權系數曲線W(f)；</p><p>（3）計算總加權加速度均方根值，與標準內表進行對比得出舒適性感受。</p><p><br></p><p> 標準中計算內容有些晦澀難懂，本帖將簡化內容，清楚直白的介紹如何通過已有的<strong><u>加速度曲線</u></strong>得到<strong>總加權加速度均方根值</strong>的全流程步驟，方法簡單高效，僅使用ADAMS PostProcessor即可完成平順性評價指標分析，包括<strong>加速度自功率譜密度函數創建方法</strong>、<strong>加權系數曲線制作及使用</strong>、<strong>均方根值計算</strong>等，<u>按流程操作小白也可順利完成平順性分析</u>。</p><p> 計算前提：有自己的加速度數據，即可以在ADAMS PostProcessor中繪制自己的加速度曲線。
展開 坐標保存的頻率為每10ps保存一幀結果，整個軌跡共100個frame
輸入命令：gmx mdrun -s cubic_em_hot_sample.tpr -v -deffnm hot_sample
能量查看(temperature)，能量確實達到了300K（約等于）
gmx energy -f hot_sample.edr -o hot_sample.xvg
Step7:結果分析與討論
1、全體系的alpha-C原子的均方根偏差(RMSD)結果獲取及分析
輸入如下命令：gmx rms -s cubic_em_hot_sample.tpr -f hot_sample.trr -o rmsd.xvg
RMSD值可以反應出模擬過程中體系的穩定情況，將rmsd.xvg導入EXCEL表，繪折線圖，由圖可知動力學模擬逐漸達到平衡。
全體系的alpha-C原子的均方根漲落(RMSF)結果獲取及分析
輸入如下命令：gmx rmsf -s cubic_em_hot_sample.tpr -f hot.trr -o rmsf.xvg
RMSF計算每個原子相對于其平均位置的漲落, 表征了結構的變化對時間的平均, 給出了蛋白各個區域柔性的表征, 對應于晶體學中的b因子(溫度因子). 通常, 我們預期RMSF和溫度因子類似, 這可以用于考察模擬結果是否與晶體結構符合。
展開 基于matlab的BP神經網絡多輸入單輸出數據結果預測，輸出結果包括均方根誤差，決定系數。數據可更換自己的，程序已調通，可直接運行。
圖4 模型模擬的電池溫度與文獻結果的對比
圖 4（a）1D 模型在放電中后期溫度數據有較大偏差，這是由于 1D 模型假設內部溫度一致且不考慮極耳對電芯的熱效應而導致的。其中，3C 倍率偏差最大，最大平均偏差、絕對值平均偏差和均方根偏差分別為 7.4%、10.9%和14.3%。三者計算公式分別為
圖4（b）所示3D模型仿真數據與實驗接近，其3C 倍率下最大平均偏差、絕對值平均偏差和均方根偏差分別為 3.8%、4.5%和 7.8%。因此，3D 模型可反應電池內部溫度分布，提供溫升曲線。
本文來自：COMSOL仿真交流
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<p> 本貼探討如何實現<u>ISO 2361-1 1997</u>和<u>GB/T 4970-2009</u>中關于<strong>汽車平順性</strong>評價指標的計算方法，其它需要計算<strong>加權加速度均方根值</strong>的也可參考。</p><div contenteditable="false" width="100%
基于matlab的BP神經網絡多輸入單輸出數據結果預測，輸出結果包括均方根誤差，決定系數。數據可更換自己的，程序已調通，可直接運行。
均方根偏差分析
1.5.旋轉半徑的變化
1.6.均方根波動分析
1.7.分子兩端的距離和原了距離的分析
1.8.分子內和分子間氫鍵數的變化
1.9.徑向分布函數分析
1.10.溶劑可及表面積分析
1.11.主成分分析
1.12.二面角分析
2.
其中，3C 倍率偏差最大，最大平均偏差、絕對值平均偏差和均方根偏差分別為 7.4%、10.9%和14.3%。
圖2 VAMP2蛋白模型的Ramachandran plot
MD模擬收斂參數分析
均方根偏差(Root mean square deviation, RMSD)表示某一時刻的構象與目標構象所有原子偏差的加和，是衡量體系是否穩定的重要依據，可用于量化蛋白質三級結構的穩定性[21]。
全體系的alpha-C原子的均方根偏差(RMSD)結果獲取及分析，gmx rms 。
7.2. 全體系的alpha-C原子的均方根漲落(RMSF)結果獲取及分析, gmx rmsf。
7.3. 體系的總勢能變化曲線分析，采用g_energy命令。
7.4. 分析蛋白質的回旋半徑變化，采用g_gyrate命令
7.5. 將采樣最后的構象與初始構象進行疊加比較，分析構象的變化情況。
