分子對(duì)接技術(shù)的案例
如何在云計(jì)算平臺(tái)上完成分子對(duì)接
輸入
vina--config 6njs.conf
回車，即可執(zhí)行分子對(duì)接計(jì)算。
等待計(jì)算完成，一共得到10個(gè)模型結(jié)果，包括對(duì)接結(jié)合能分?jǐn)?shù)，RMSD值，我們可以看到有多個(gè)結(jié)果的RMSD都小于2埃，說明本次分子對(duì)接結(jié)果還是比較可靠的。
在北鯤云超算平臺(tái)完成分子對(duì)接計(jì)算的過程還是比較簡(jiǎn)單的，只要按照上述步驟即可完成，中途如果遇到問題可以隨機(jī)聯(lián)系我們的技術(shù)支持，技術(shù)支持隨時(shí)在線解決大家的疑惑。
除了簡(jiǎn)便的操作之外，在平臺(tái)上還有海量資源供大家選擇，不用擔(dān)心要排隊(duì)或者ddl趕不上啦！
結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)分子對(duì)接大師班--帶案例 ￥10
1-1 概述
2-1-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能組成
2-2-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能肽鍵和相互作用
2-3-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能α螺旋和β片
2-4-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能肽鍵和Ramachandran圖
2-5-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能結(jié)合能
2-6-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能蛋白質(zhì)如何折疊
2-7-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能結(jié)構(gòu)水平
2-8-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能功能水平
2-9-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能酶動(dòng)力學(xué)基本概念
3-1-可用的蛋白質(zhì)制備結(jié)構(gòu)
3-2-制備的蛋白質(zhì)制備結(jié)構(gòu)
3-3-蛋白質(zhì)制備同源性建模
3-4-蛋白制備穿線法
3-5-蛋白質(zhì)制備α折疊
3-6-PDB結(jié)構(gòu)的6-蛋白制備選擇
3-7-蛋白質(zhì)制劑缺失殘留問題
3-8-蛋白質(zhì)制備結(jié)構(gòu)驗(yàn)證
4-1-分子對(duì)接算法
4-2-分子對(duì)接類型
4-3-分子對(duì)接模式
4-4-分子對(duì)接軟件
4-5-分子對(duì)接自動(dòng)對(duì)接VINA高分子制劑
4-6-分子對(duì)接自動(dòng)對(duì)接VINA配體制備
4-7-分子對(duì)接自動(dòng)對(duì)接VINA網(wǎng)格制備
5-1-自動(dòng)對(duì)接VINA腳本
5-2-自動(dòng)對(duì)接VINA分析-I
5-3-Autodock VINA分析- II
6-1-虛擬篩選為什么它很重要
6-2-虛擬篩選簡(jiǎn)要信息
6-3-虛擬篩選大分子和配體的制備
6-4-虛擬篩選網(wǎng)格準(zhǔn)備
6-5-虛擬篩選ADMET分析
6-6-虛擬篩查L(zhǎng)ipinksi五規(guī)則
6-7-虛擬篩查結(jié)果分析
6-8-虛擬篩選腳本
7-1-故障診斷問題
7-2-出版質(zhì)量圖制備
展開 基于AutoDock進(jìn)行全局分子對(duì)接篩選最佳結(jié)合位點(diǎn)
我們通過實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)一系列小分子對(duì)該酶有抑制作用，但其具體相互作用于哪一個(gè)位點(diǎn)卻是未知，因此我們通過全局分子對(duì)接的方法去對(duì)其優(yōu)勢(shì)結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行一個(gè)理論預(yù)測(cè)。
2 分子對(duì)接
2.1 受體結(jié)構(gòu)準(zhǔn)備
人凝血酶蛋白結(jié)構(gòu)從蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫（Protein data bank, PDB）中獲取，PDB代碼為1DWC。對(duì)蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)行加氫處理，并將處理后的結(jié)構(gòu)作為分子對(duì)接的初始模型，采用AutoDockTools 1.5.6進(jìn)行處理，保存蛋白原有電荷，并生成pdbqt文件用于對(duì)接。
2.2 配體結(jié)構(gòu)準(zhǔn)備
化合物結(jié)構(gòu)使用chemdraw繪制，采用MOPAC程序優(yōu)化分子結(jié)構(gòu)，計(jì)算PM3原子電荷，采用AutoDock Tools 1.5.6處理配體結(jié)構(gòu)，生成相應(yīng)的pdbqt文件用于后續(xù)對(duì)接。
2.3 分子對(duì)接方法
分子對(duì)接采用AutoDock 4.2.6軟件包實(shí)現(xiàn)，設(shè)定1DWC晶體結(jié)構(gòu)中心的位置為活性位點(diǎn)，將小分子對(duì)接到活性位點(diǎn)，對(duì)接盒子的中心坐標(biāo)設(shè)為（36.99, 41.25, 43.45），XYZ各方向的格點(diǎn)數(shù)設(shè)為120×120×120，格點(diǎn)間距為0.5 Å，對(duì)接次數(shù)設(shè)為100，其余參數(shù)采用默認(rèn)值
3 分子對(duì)接結(jié)果
首先通過分子對(duì)接結(jié)果，我們發(fā)現(xiàn)化合物結(jié)合到了不同位點(diǎn)上，結(jié)果如下圖所示，該結(jié)果表明，上述小分子的確能結(jié)合到四個(gè)不同的結(jié)合位點(diǎn)上。
隨后，為了進(jìn)一步判定哪一個(gè)位點(diǎn)是其結(jié)合的優(yōu)勢(shì)位點(diǎn)，我們將其結(jié)合到不同位點(diǎn)的小分子與蛋白之間的分子對(duì)接能量打分結(jié)果以及預(yù)測(cè)的抑制活性值進(jìn)行了對(duì)比分析，結(jié)果如表1所示。通過結(jié)果對(duì)比分析，我們發(fā)現(xiàn)，該類分子在活性位點(diǎn)處的結(jié)合能以及預(yù)測(cè)的活性都是最低的，因此我們判定該處位點(diǎn)為該類分子結(jié)合到該蛋白靶標(biāo)上的優(yōu)勢(shì)結(jié)合位點(diǎn)，并以此為位點(diǎn)作為其他同類分子在該蛋白上的結(jié)合位點(diǎn)。
展開 利用auto dock軟件做單個(gè)蛋白-小分子對(duì)接
最后，有分子對(duì)接或者分子動(dòng)力學(xué)相關(guān)需求，歡迎通過微信公眾號(hào)聯(lián)系我們。
微信公眾號(hào)：320科技工作室。
CADD蛋白結(jié)構(gòu)分析、虛擬篩選、分子對(duì)接（蛋白-蛋白、蛋白-多肽）
分子對(duì)接用于虛擬篩選（Autodock）
3.1 虛擬篩選定義、流程構(gòu)建及演示
3.2 靶點(diǎn)蛋白選擇、化合物庫獲取
3.3虛擬篩選
3.4 結(jié)果分析（打分值、能量及相互作用分析）
實(shí)例講解與練習(xí)：Bcr/Abl靶點(diǎn)抑制劑的虛擬篩選
小分子格式轉(zhuǎn)換
1. openbabel的介紹和使用
1.1 openbabel軟件介紹
1.2 小分子結(jié)構(gòu)類型
1.3 小分子結(jié)構(gòu)類型轉(zhuǎn)換
答疑
針對(duì)前三天學(xué)習(xí)問題的答疑
第四天上午
拓展對(duì)接使用場(chǎng)景（上）
1.蛋白-蛋白大分子對(duì)接
1.1蛋白-蛋白對(duì)接的應(yīng)用場(chǎng)景
1.2相關(guān)程序的介紹
1.3 受體和配體蛋白前期優(yōu)化準(zhǔn)備1.4 載入受體和配體分子
1.5蛋白蛋白相互作用對(duì)接位點(diǎn)設(shè)定
1.6蛋白蛋白對(duì)接結(jié)果分析與解讀
實(shí)例講解與練習(xí)：新冠病毒Spike蛋白及宿主蛋白ACE2的對(duì)接
2.蛋白-多肽對(duì)接
2.1蛋白-多肽相互作用簡(jiǎn)介
2.2蛋白-多肽分子預(yù)處理
2.3蛋白-多肽分子對(duì)接
2.4對(duì)接結(jié)果展示與分析
實(shí)例講解與練習(xí)：新冠靶點(diǎn)3CL與多肽/類多肽抑制劑的對(duì)接
3.含金屬離子的蛋白靶點(diǎn)與小分子對(duì)接
3.1 金屬酶蛋白-配體的相互作用介紹
3.2相關(guān)蛋白及配體分子的收集與預(yù)處理
3.3金屬離子的處理與準(zhǔn)備
3.4金屬輔酶蛋白-配體的對(duì)接
3.5對(duì)接結(jié)果展示與分析
實(shí)例講解與練習(xí)：基質(zhì)金屬蛋白酶MMP及其抑制劑對(duì)接
第四天下午
拓展對(duì)接使用場(chǎng)景（下）
4.小分子與小分子對(duì)接
4.1小分子-小分子相互作用簡(jiǎn)介
4.2小分子結(jié)構(gòu)預(yù)處理
4.3小分子-小分子對(duì)接
4.4對(duì)接結(jié)果展示與分析
實(shí)例講解與練習(xí)：環(huán)糊精與藥物小分子的對(duì)接
5.核酸-小分子對(duì)接
5.1核酸-小分子的應(yīng)用場(chǎng)景
展開 譜尼測(cè)試科技成果成功入選2023年 “高影響力論文”
譜尼測(cè)試集團(tuán)發(fā)展的引擎，近日，《中國學(xué)術(shù)期刊》和中國科學(xué)文獻(xiàn)計(jì)量評(píng)價(jià)研究中心發(fā)布2023年高影響力論文，譜尼測(cè)試集團(tuán)聯(lián)合譜尼集團(tuán)研究院、北京譜尼醫(yī)學(xué)在我國自然科學(xué)核心期刊《中草藥》上發(fā)表科技成果：《基于UPLC-Q-TOF-MS指紋圖譜和分子對(duì)接技術(shù)篩選藿香正氣水抗新冠病毒潛在質(zhì)量標(biāo)志物》并成功入選中國知網(wǎng)學(xué)術(shù)精要（2023年11-12月）高影響力論文
“高影響力論文”是以中國知網(wǎng)收錄的近十年論文數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，分別按照被引頻次、下載頻次、PCSI指數(shù)（論文引證標(biāo)準(zhǔn)化指數(shù)）遴選出學(xué)科前1％的論文，即高被引論文、高下載論文及高PCSI論文。
《基于UPLC-Q-TOF-MS指紋圖譜和分子對(duì)接技術(shù)篩選藿香正氣水抗新冠病毒潛在質(zhì)量標(biāo)志物》該論文基于UPLC-Q-TOF-MS，融合指紋圖譜、分子對(duì)接以及化學(xué)計(jì)量學(xué)等技術(shù)，通過挖掘與鑒定藿香正氣水中抗新型冠狀病毒的潛在質(zhì)量標(biāo)志物，為藿香正氣水的質(zhì)量控制與評(píng)價(jià)提供了科學(xué)依據(jù)，為新冠肺炎藥物防治以及新靶向藥物篩選提供了新思路。藿香正氣系列中成藥是《新型冠狀病毒肺炎診療方案》中醫(yī)學(xué)觀察期表現(xiàn)為乏力伴胃腸不適者的推薦用藥，已在抗疫一線初顯成效，但其防治機(jī)制尚不明確。
展開 譜尼測(cè)試科技成果成功入選2023年 “高影響力論文”
譜尼測(cè)試集團(tuán)發(fā)展的引擎，近日，《中國學(xué)術(shù)期刊》和中國科學(xué)文獻(xiàn)計(jì)量評(píng)價(jià)研究中心發(fā)布2023年高影響力論文，譜尼測(cè)試集團(tuán)聯(lián)合譜尼集團(tuán)研究院、北京譜尼醫(yī)學(xué)在我國自然科學(xué)核心期刊《中草藥》上發(fā)表科技成果：《基于UPLC-Q-TOF-MS指紋圖譜和分子對(duì)接技術(shù)篩選藿香正氣水抗新冠病毒潛在質(zhì)量標(biāo)志物》并成功入選中國知網(wǎng)學(xué)術(shù)精要（2023年11-12月）高影響力論文
“高影響力論文”是以中國知網(wǎng)收錄的近十年論文數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，分別按照被引頻次、下載頻次、PCSI指數(shù)（論文引證標(biāo)準(zhǔn)化指數(shù)）遴選出學(xué)科前1％的論文，即高被引論文、高下載論文及高PCSI論文。
《基于UPLC-Q-TOF-MS指紋圖譜和分子對(duì)接技術(shù)篩選藿香正氣水抗新冠病毒潛在質(zhì)量標(biāo)志物》該論文基于UPLC-Q-TOF-MS，融合指紋圖譜、分子對(duì)接以及化學(xué)計(jì)量學(xué)等技術(shù)，通過挖掘與鑒定藿香正氣水中抗新型冠狀病毒的潛在質(zhì)量標(biāo)志物，為藿香正氣水的質(zhì)量控制與評(píng)價(jià)提供了科學(xué)依據(jù)，為新冠肺炎藥物防治以及新靶向藥物篩選提供了新思路。藿香正氣系列中成藥是《新型冠狀病毒肺炎診療方案》中醫(yī)學(xué)觀察期表現(xiàn)為乏力伴胃腸不適者的推薦用藥，已在抗疫一線初顯成效，但其防治機(jī)制尚不明確。
譜尼測(cè)試集團(tuán)作為大型綜合性檢測(cè)認(rèn)證集團(tuán)，高度重視科技創(chuàng)新，聚焦科研前沿追蹤、創(chuàng)新技術(shù)研發(fā)、技術(shù)成果落地轉(zhuǎn)化、專注于科研及檢驗(yàn)檢測(cè)分析方向的研究，尤其關(guān)注生物醫(yī)藥領(lǐng)域的技術(shù)研發(fā)與突破。譜尼測(cè)試集團(tuán)是經(jīng)國家發(fā)改委、科技部、海關(guān)總署聯(lián)合發(fā)文認(rèn)定的國家企業(yè)技術(shù)中心、是北京市批準(zhǔn)的生物醫(yī)藥類工程實(shí)驗(yàn)室、北京市科委認(rèn)定的工程技術(shù)研究中心、擁有多個(gè)掛牌的博士后科研工作站。多次承擔(dān)國家各部委重要檢驗(yàn)檢測(cè)任務(wù)及國家重要科研項(xiàng)目，已參與完成863計(jì)劃、自然科學(xué)基金、攀登計(jì)劃等多個(gè)重點(diǎn)科研課題項(xiàng)目
展開 頂尖技術(shù)展示、精準(zhǔn)資源對(duì)接，萬事俱備，就等你來赴約
AI 精講堂：
打造“AI智能課堂”，邀請(qǐng)AI領(lǐng)域頂尖專家學(xué)者坐鎮(zhèn)，圍繞技術(shù)底層邏輯、產(chǎn)業(yè)落地實(shí)踐、前沿趨勢(shì)研判等方面，為AI愛好者、行業(yè)從業(yè)者等不同群體，帶來兼具深度與實(shí)用性的系統(tǒng)講解。
金融對(duì)接：
設(shè)立“金融服務(wù)展區(qū)”，聚焦產(chǎn)業(yè)融資需求，搭建資本與項(xiàng)目精準(zhǔn)對(duì)接的服務(wù)平臺(tái)。
商機(jī)無限：
國內(nèi)外50000+專業(yè)觀眾參會(huì)，主流采購商現(xiàn)場(chǎng)洽談對(duì)接；
創(chuàng)領(lǐng)尖品：
“首發(fā)首創(chuàng)展區(qū)”，集中展示具有突破性、引領(lǐng)性的“全球首發(fā)”“中國首秀”等前沿科技產(chǎn)品，凸顯創(chuàng)新突破的標(biāo)桿價(jià)值。
媒體賦能：
海內(nèi)外全媒體渠道覆蓋，提供更多宣傳增值服務(wù)，全面賦能參展品牌形象塑造及傳播。
AI Show 誠邀您加入
AI Show 立足北京，面向全球，將云集全球頂尖的人工智能及機(jī)器人科技企業(yè)，全面呈現(xiàn)行業(yè)最新科研成果與前沿技術(shù)應(yīng)用，助力AI產(chǎn)業(yè)在各行業(yè)普及落地。
參展聯(lián)系
聯(lián)系人：張小薇
聯(lián)系電話：18513030510
北京國際人工智能應(yīng)用與機(jī)器人創(chuàng)新博覽會(huì)
暨2026人工智能與機(jī)器人產(chǎn)業(yè)大會(huì)
（AI Show 2026）
?2026年3月18日-20日
??中國國際展覽中心朝陽館
?
展開 板對(duì)接仰位加障礙焊條電弧焊焊接，滿滿的都是技術(shù)
本文以12mm厚Q235鋼板堿性焊條仰位加單個(gè)障礙單面焊雙面成形焊接操作技術(shù)為例，闡述整個(gè)焊接過程工藝參數(shù)的合理選擇及各層的焊接要點(diǎn)，通過調(diào)整參數(shù)和優(yōu)化操作手法，使焊工在規(guī)定的時(shí)間內(nèi)，完成試件焊接，且焊件成形美觀，內(nèi)部質(zhì)量?jī)?yōu)良。培訓(xùn)和操作過程中重點(diǎn)解決以上問題，經(jīng)過反復(fù)試驗(yàn)和練習(xí)，達(dá)到了預(yù)定目標(biāo)，保證了選手在近年來的比賽中屢次取得好成績(jī)。
1. 焊前準(zhǔn)備
（1）焊接設(shè)備及材料 焊接電源選用具有陡降外特性的奧太ZX7—400STGⅣ型直流弧焊機(jī)。母材牌號(hào)為Q235，焊條型號(hào)為E5015。
（2）試件尺寸及坡口形式?試件尺寸為300mm×125mm×12mm，采用V形坡口單側(cè)30°±1°，打磨鈍邊0.5~1mm，如圖1所示。
圖1?試件尺寸及坡口形式
注：L=300mm；B=250mm；S=12mm；α=30°±1°；b、p自定。
（3）障礙板夾具要求 具體要求如圖2所示。
圖2?障礙板夾具
（4）焊前清理 裝配前應(yīng)將試件的坡口及坡口正反兩側(cè)15~20mm以內(nèi)的表面油污及氧化物等雜質(zhì)清除干凈，直至露出金屬光澤，以防止在焊接過程中產(chǎn)生氣孔、夾雜等焊接缺陷，影響焊縫質(zhì)量。
2. 焊接參數(shù)
（1）試件組對(duì)?為了防止焊縫的縱向收縮，造成打底焊時(shí)終焊端坡口間隙變小影響焊接，要求定位焊時(shí)焊縫的終焊端間隙要比始焊端間隙大0.5mm左右。試件組對(duì)采用坡口內(nèi)點(diǎn)固，始焊端間隙3.2mm左右，定位焊長(zhǎng)度為15mm左右，終焊端間隙3.7mm左右，定位焊長(zhǎng)度為10mm左右，并且終焊端定位焊點(diǎn)加厚一些以防止焊接時(shí)收縮。
（2）焊條角度?焊條角度與焊接方向夾角75°~85°，與試件兩側(cè)夾角為90°，如圖3所示。
圖3?焊條角度
（3）焊接參數(shù)?對(duì)試件擬定的焊接參數(shù)如附表所示。
3.
展開 solidThinking Inspire對(duì)接增材制造技術(shù)， 設(shè)計(jì)制造全新方程式賽車轉(zhuǎn)向柱底座
行業(yè)：汽車/方程式賽車
挑戰(zhàn)：設(shè)計(jì)和制造一個(gè)全新的方程式 賽車轉(zhuǎn)向柱底座
Altair 解決方案：使用 solidThinking Inspire 進(jìn)行設(shè)計(jì)，使用電子束熔融技術(shù) 制造新部件，以節(jié)省設(shè)計(jì)時(shí)間， 減少材料成本，提升產(chǎn)品性能。
優(yōu)點(diǎn)：基于增材制造方式重新設(shè)計(jì)了 轉(zhuǎn)向柱底座 ； 將必要部件數(shù)量從四個(gè)減少為 一個(gè) ； 節(jié)省了 35%的重量（從 500g 減少至 330g） ； 新部件提升了 5 倍剛度 ； 減少了 50%的設(shè)計(jì)時(shí)間 ； 使用新的制造流程，浪費(fèi)的材 料節(jié)省了 90%
背景介紹
MICHAEL Sü? 是德國德累斯頓工業(yè)大學(xué)（Technische Universit?t Dresden）的研究員，目前他的博士學(xué)位研究專注于增材制造/電子束熔融技術(shù)。 除此之外，Michael 還與德國 Fraunhofer 增材制造技術(shù)和先進(jìn)材料研究所 （IFAM）合作密切。Fraunhofer IFAM 是歐洲領(lǐng)先的粘合技術(shù)、材料科學(xué)和制 造技術(shù)領(lǐng)域研究機(jī)構(gòu)之一。
Michael試圖尋找一個(gè)案例，應(yīng)用于他的研究報(bào)告。此時(shí)他回想起了曾經(jīng)參 與學(xué)生方程式賽車隊(duì)時(shí)的經(jīng)歷。Michael說，“我曾在一個(gè)方程式賽車隊(duì)中工作， 并希望能夠幫助到德累斯頓大學(xué)的在校車隊(duì)。我請(qǐng)ELBFLORACE電動(dòng)方程式 賽車隊(duì)推薦一個(gè)從事該項(xiàng)目的志愿者，以便深入合作。由此，Michael遇到了德 累斯頓工業(yè)大學(xué)在校學(xué)生Lucas Hofman。
挑戰(zhàn)
Michael 和 Lucas 一起，開始在汽車上尋找一個(gè)最有重新設(shè)計(jì)必要的部件， 并以增材制造/電子束熔融方式生產(chǎn)。最終，他們選定的部件是方程式賽車的轉(zhuǎn) 向柱底座。Lucas 指出，“當(dāng)前的轉(zhuǎn)向柱底座有四個(gè)不同的區(qū)域，彼此之間有著不同的角度。
展開 前瞻技術(shù)｜從物理性質(zhì)逆推分子結(jié)構(gòu)
眾所周知，采用機(jī)器學(xué)習(xí)方法，基于定量結(jié)構(gòu)-性質(zhì)關(guān)系(QSPR)，可以從分子和晶體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)物理性質(zhì)。現(xiàn)在，「J-OCTA軟件」1可以進(jìn)行逆分析，利用京都大學(xué)長(zhǎng)町實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的mol-infer數(shù)據(jù)接口，可以實(shí)現(xiàn)從物理性質(zhì)逆推分子結(jié)構(gòu)。這是一種非常新穎的分子結(jié)構(gòu)生成方法，具有廣闊的應(yīng)用前景。
第一，利用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Artificial Neural Network, ANN)從分子結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)物理性質(zhì)。第二，通過混合整數(shù)線性規(guī)劃(Mixed Integer Linear Programming, MILP)求解人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的逆運(yùn)算，能夠在相反的方向上執(zhí)行快速而準(zhǔn)確的運(yùn)算，這是單獨(dú)使用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)所不可能實(shí)現(xiàn)的。
首先，基于1297組數(shù)據(jù)集訓(xùn)練分子結(jié)構(gòu)和物理性質(zhì)之間的關(guān)系。圖1展示的是測(cè)試過程中使用的分配系數(shù)。
圖1. mol-infer的訓(xùn)練數(shù)據(jù)集和目標(biāo)性質(zhì)（分配系數(shù)=10.0）
其次，使用MILP執(zhí)行逆運(yùn)算。設(shè)目標(biāo)分配系數(shù)為10.0，生成種子分子的圖結(jié)構(gòu)和對(duì)應(yīng)官能團(tuán)的樹結(jié)構(gòu)（見圖2），用來預(yù)測(cè)分子結(jié)構(gòu)。
通過「J-OCTA軟件」1預(yù)測(cè)的分子結(jié)構(gòu)如圖3所示，得到了4種同分異構(gòu)體。對(duì)于預(yù)測(cè)的分子結(jié)構(gòu)，再次采用正向方法計(jì)算其物理性質(zhì)，結(jié)果表明其分配系數(shù)為9.8，證明預(yù)測(cè)的分子結(jié)構(gòu)基本滿足目標(biāo)物性。
【1】J-OCTA分子動(dòng)力學(xué)軟件 —— 通過對(duì)材料從原子級(jí)別到微米級(jí)別的模擬計(jì)算，從本質(zhì)上理解元素組成和性能之間的關(guān)系。軟件可以滿足幾乎所有材料的分析，比如橡膠、塑料、薄膜、涂料及電解質(zhì)材料等。可將其作為“ 知識(shí)發(fā)現(xiàn)工具 ”進(jìn)行靈活運(yùn)用。
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LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)技術(shù)與應(yīng)用
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LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)核心技術(shù)實(shí)戰(zhàn)
LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)核心技術(shù)實(shí)戰(zhàn)培訓(xùn)班
2020年10月30日—— 2020年11月2日 (線上直播)
課程目標(biāo)：
1. LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)理論與軟件操作培訓(xùn)，邊講解邊實(shí)踐操作。
2. 通過本課程的學(xué)習(xí)，學(xué)員熟練掌握LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)的原理、方法、軟件操作。
3. 學(xué)員基本具備獨(dú)立完成LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)的論文及實(shí)際科研工程的能力。
課程大綱
一、Lammps基礎(chǔ)與原理
MD模擬的基本邏輯思路
Lammps軟件學(xué)習(xí)框架
Lammps研究的幾方面重要資源
二、In文件的基本邏輯框架、基本命令
三、Lammps建模與進(jìn)階
四、用Lammps模擬具體物理問題（應(yīng)用中存在的問題）
五、用Lammps輸出研究所需要的數(shù)據(jù)信息
六，Lammps大量實(shí)例練習(xí)賞析（已發(fā)表文章）
七、LAMMPS高級(jí)研修及案例操作
有意者隨時(shí)聯(lián)系！
【咨詢電話】報(bào)名聯(lián)系方式：
李連杰(老師) 手機(jī)：13311241619 電話：010-56129268
lammps分子動(dòng)力學(xué)QQ群號(hào):753267868
（加群備注：李連杰老師邀請(qǐng)）
展開 LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)核心技術(shù)實(shí)
LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)核心技術(shù)實(shí)戰(zhàn)培訓(xùn)班
2020年10月30日—— 2020年11月2日 (線上直播)
課程目標(biāo)：
1. LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)理論與軟件操作培訓(xùn)，邊講解邊實(shí)踐操作。
2. 通過本課程的學(xué)習(xí)，學(xué)員熟練掌握LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)的原理、方法、軟件操作。
3. 學(xué)員基本具備獨(dú)立完成LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)的論文及實(shí)際科研工程的能力。
課程大綱
一、Lammps基礎(chǔ)與原理
MD模擬的基本邏輯思路
Lammps軟件學(xué)習(xí)框架
Lammps研究的幾方面重要資源
二、In文件的基本邏輯框架、基本命令
三、Lammps建模與進(jìn)階
四、用Lammps模擬具體物理問題（應(yīng)用中存在的問題）
五、用Lammps輸出研究所需要的數(shù)據(jù)信息
六，Lammps大量實(shí)例練習(xí)賞析（已發(fā)表文章）
七、LAMMPS高級(jí)研修及案例操作
另有
《分子動(dòng)力學(xué)材料模擬》10月15---10月18日
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