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如何在云計算平臺上完成
分子
對接
分子
對接
的基本原理就是把配體
分子
放在受體活性位點的位置,然后按照幾何互補和能量互補的原則來實時評價配體與受體相互作用的優(yōu)劣,最終找到這兩個
分子
之間最佳的結合模式。
分子
對接
分為剛性、半柔性和柔性
對接
。不同的
對接
軟件又可以分為:商業(yè)軟件和學術軟件,而
分子
對接
的計算結果,則體現(xiàn)為打分函數(shù)的不同。
2490
1
深圳北鯤云計算有限公司
??? 3年前
帖子
CADD蛋白結構分析、虛擬篩選、
分子
對接
(蛋白-蛋白、蛋白-多肽)
3.5
對接
結果展示與分析實例講解與練習:基質金屬蛋白酶MMP及其抑制劑
對接
第四天下午 拓展
對接
使用場景(下) 4.小
分子
與小
分子
對接
4.1小
分子
-小
分子
相互作用簡介4.2小
分子
結構預處理4.3小
分子
-小
分子
對接
4.4
對接
結果展示與分析實例講解與練習:環(huán)糊精與藥物小
分子
的
對接
5.核酸-小
分子
對接
5.1核酸-小
分子
的應用場景5.2核酸-
2350
。_4485
??? 3年前
帖子
結構生物信息學
分子
對接
大師班--帶案例
4-2-
分子
對接
類型 4-3-
分子
對接
模式 4-4-
分子
對接
軟件 4-5-
分子
對接
自動
對接
VINA高
分子
制劑 4-6-
分子
對接
自動
對接
VINA配體制備 4-7-
分子
對接
自動
對接
VINA網(wǎng)格制備 5-1-自動
對接
VINA腳本 5-2-自動
對接
VINA分析-I 5-3-Autodock VINA分析- II
1306
1
仿真資料吧
??? 5月前
帖子
基于AutoDock進行全局
分子
對接
篩選最佳結合位點
2.3
分子
對接
方法
分子
對接
采用AutoDock 4.2.6軟件包實現(xiàn),設定1DWC晶體結構中心的位置為活性位點,將小
分子
對接到活性位點,
對接
盒子的中心坐標設為(36.99, 41.25, 43.45),XYZ各方向的格點數(shù)設為120×120×120,格點間距為0.5 Å,
對接
次數(shù)設為100,其余參數(shù)采用默認值3
分子
對接
結果首先通過
分子
對接
結果,我們發(fā)現(xiàn)化合物結合到了不同位點上
2815
320科技工作室
??? 4年前
帖子
基于Gromacs模擬軟件分析小
分子
配體與蛋白結合之后的穩(wěn)定性
對接
完成后,可以分析小
分子
的極性接觸。 如: 3.
2954
320科技工作室
??? 4年前
帖子
計算機輔助藥物設計(CADD)如何入手,速看(包含gromacs)...
第四天下午 拓展
對接
使用場景(下) 4.小
分子
與小
分子
對接
4.1小
分子
-小
分子
相互作用簡介4.2小
分子
結構預處理4.3小
分子
-小
分子
對接
4.4
對接
結果展示與分析實例講解與練習:環(huán)糊精與藥物小
分子
的
對接
5.核酸-小
分子
對接
5.1核酸-小
分子
的應用場景5.2核酸-小
分子
相互作用簡介5.3核酸-小
分子
的預處理5.4核酸-小
分子
對接
5.5相關結果的展示與分析
2031
。_4485
??? 3年前
帖子
【篇一】 生物醫(yī)藥領域發(fā)文難?(CADD、ROSETTA、多組學)一區(qū)SCI墊腳石已備好!
拓展
對接
使用場景(下) 4.小
分子
與小
分子
對接
4.1小
分子
-小
分子
相互作用簡介4.2小
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結構預處理4.3小
分子
-小
分子
對接
4.4
對接
結果展示與分析實例講解與練習:環(huán)糊精與藥物小
分子
的
對接
5.核酸-小
分子
對接
5.1核酸-小
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的應用場景5.2核酸-小
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相互作用簡介5.3核酸-小
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的預處理5.4核酸-小
分子
對接
5.5相關結果的展示與分析實例講解與練習
2225
。_4485
??? 3年前
帖子
生物醫(yī)藥領域發(fā)文難?(CADD、ROSETTA、多組學)一區(qū)SCI墊腳石已備好!
4、小
分子
與小
分子
對接
4.1 小
分子
-小
分子
相互作用簡介 4.2 小
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結構預處理 4.3 小
分子
-小
分子
對接
4.4
對接
結果展示與分析 實例講解與練習:環(huán)糊精與藥物小
分子
的
對接
5、核酸
2100
。_4485
??? 3年前
帖子
先導化合物藥物發(fā)現(xiàn)的途徑概述 PONY譜尼測試集團
三維藥效基團搜尋速度比較快,在
分子
對接
前對化合物數(shù)據(jù)庫進行預處理,可以提高對靶標生物大
分子
有活性的小
分子
的發(fā)現(xiàn)。 2) 基于
分子
對接
的虛擬篩選
分子
對接
技術是指
分子
模擬環(huán)境中,兩個或兩個以上的
分子
模型通過幾何形狀、化學環(huán)境及能量的匹配形成最佳結合的技術。
分子
對接
的虛擬篩選需要靶標生物大
分子
和小
分子
化合物的三維結構信息。
2123
PNCS
??? 3年前
帖子
基于Gromacs的蛋白質與小
分子
配體相互作用模擬教程
隨后,我們將詳細闡述模擬的具體步驟,包括結構準備(如蛋白質結構預測、小
分子
結構優(yōu)化等)、相互作用模擬(如
分子
對接
、
分子
動力學模擬等)以及結果分析(如相互作用能計算、軌跡分析等)。在每個步驟中,我們都會結合具體的案例和實例,詳細解釋操作步驟和注意事項,幫助讀者更好地理解和掌握。具體流程:一、預處理復合物1.
3067
320科技工作室
??? 1年前
帖子
Nature子刊:模擬天然模塊聚酮合酶的有序組裝提高人工細胞工廠的合成效率
天然的生物催化體系通常在微生物細胞這個微型工廠內會形成物理上、空間上組織有序的多酶復合體、酶
分子
腳手架或者反應微區(qū),這種類似機器組裝的高度組織性帶來了高效的催化能力。然而,人工構建的合成體系多不存在這種高效的組織性,由此引發(fā)的目標途徑合成效率低、代謝流不平衡等問題,很大程度上限制了人工合成體系的生物制造潛力。
2273
生物酶是什么丫
??? 3年前
帖子
譜尼測試科技成果成功入選2023年 “高影響力論文”
《基于UPLC-Q-TOF-MS指紋圖譜和
分子
對接
技術篩選藿香正氣水抗新冠病毒潛在質量標志物》該論文基于UPLC-Q-TOF-MS,融合指紋圖譜、
分子
對接
以及化學計量學等技術,通過挖掘與鑒定藿香正氣水中抗新型冠狀病毒的潛在質量標志物,為藿香正氣水的質量控制與評價提供了科學依據(jù),為新冠肺炎藥物防治以及新靶向藥物篩選提供了新思路。
2076
PNCS
??? 2年前
帖子
譜尼測試科技成果成功入選2023年 “高影響力論文”
《基于UPLC-Q-TOF-MS指紋圖譜和
分子
對接
技術篩選藿香正氣水抗新冠病毒潛在質量標志物》該論文基于UPLC-Q-TOF-MS,融合指紋圖譜、
分子
對接
以及化學計量學等技術,通過挖掘與鑒定藿香正氣水中抗新型冠狀病毒的潛在質量標志物,為藿香正氣水的質量控制與評價提供了科學依據(jù),為新冠肺炎藥物防治以及新靶向藥物篩選提供了新思路。
2092
PNCS
??? 2年前
帖子
GROMACS計算蛋白-配體相互作用以及力場構建
然后通過手動或者
對接
的方式將蛋白和小
分子
組合。這樣就可以初步得到蛋白-配體復合物的構象。如下圖: 之前的模擬介紹過如何生成蛋白質的力場。如果此時使用gmx pdb2gmx -f AA.pdb -o AA.gro命令來建立力場時,會發(fā)現(xiàn)gromacs無法識別小
分子
并產生相關的力場。
2589
1
320科技工作室
??? 3年前
帖子
結構與流體仿真 | Axiom Space利用仿真技術建造首個商用空間站
實現(xiàn)最高比沖量的步驟之一,是盡量充分地混合甲烷
分子
與氧
分子
。Ondler認為,旋動和混合這兩種
分子
的噴嘴固定板是藝術與科學的結合體。他指出:“我們通過運行Ansys Fluent獲得了仿真結果。我們構建解決方案、測試解決方案,觀察它的效果,然后多次迭代仿真與測試。推進器比沖的最大化能為整個系統(tǒng)帶來各種優(yōu)勢。比沖效率越高,燃料箱越小。燃料箱越小,空間站可用空間就越大。
2616
4
2
Ansys中國
??? 3年前
帖子
使用AmberTools24獲得Amber力場文件教程
RESP電荷在
分子
動力學、構象分析以及
分子
對接
等應用中展現(xiàn)出了卓越的效果。在此教程中,我們將帶您深入了解如何使用Gaussian和AmberTools進行結構優(yōu)化和電荷計算。首先,您將學習如何使用Gaussian軟件優(yōu)化
分子
結構,并計算得到esp電荷。接著,我們將介紹如何利用AmberTools對這些電荷進行RESP擬合,同時生成所需的Amber力場參數(shù)文件。
3150
320科技工作室
??? 1年前
帖子
2023山東醫(yī)療器械展|2023第49屆中國國際醫(yī)療器械(山東)博覽會
公司信息化水平在全國會展業(yè)也處領先水平,擁有獨立開發(fā)的管理系統(tǒng)、SOHO呼叫中心系統(tǒng)、C2M需求定制與精準
對接
平臺和完整的營銷推廣技術支撐體系。 山東新丞華展覽有限公司 憑借其良好的專業(yè)能力、資源和品牌影響力得到了政府和社會的高度評價,得到了行業(yè)合作者的廣泛贊譽。
2127
上海梵翡會展有限公司
??? 3年前
帖子
2023山東醫(yī)療器械展|2023山東醫(yī)療展
公司信息化水平在全國會展業(yè)也處領先水平,擁有獨立開發(fā)的管理系統(tǒng)、SOHO呼叫中心系統(tǒng)、C2M需求定制與精準
對接
平臺和完整的營銷推廣技術支撐體系。 山東新丞華展覽有限公司 憑借其良好的專業(yè)能力、資源和品牌影響力得到了政府和社會的高度評價,得到了行業(yè)合作者的廣泛贊譽。
2193
1
1
上海梵翡會展有限公司
??? 3年前
帖子
2023國際熱管理材料技術博覽會(導熱散熱展)誠邀您來!
精準邀請專業(yè)采購商完善市場化招商機制,強化撮合
對接
服務。邀請行業(yè)內大型、專精特新、中小企業(yè)及產業(yè)園區(qū)等采購商和參觀團參加供需
對接
、項目路演和同期活動,促成參展企業(yè)和采購商實現(xiàn)精準
對接
。新產品新技術首發(fā)平臺特設創(chuàng)新技術和產品展區(qū)及活動,薈聚高新技術企業(yè)精心發(fā)布新產品新技術新服務,展示最新產業(yè)成果、匯聚前沿領先技術。
2990
熱管理博覽會
??? 3年前
帖子
11月15-17日!2023國際熱管理材料技術博覽會邀您深圳相見!
鎳粉和鋁粉等;②封裝材料:鋁、銅(鍍銅)、鎢/銅、鉬/銅、硅/鋁、鈹/鋁、泡沫金屬/多孔金屬等,氧化鋁、氧化鋯、碳化物、硼化物、氮化物、硅化物;橡膠;玻璃等;③聚合物材料:有機硅、環(huán)氧樹脂、聚氨酯、丙烯酸樹脂、聚酰亞胺、酚醛樹脂等;導/散熱材料展示①熱界面材料:導熱硅膠、導熱硅脂、導熱凝膠、導熱墊/碳纖維導熱墊、聚合物基復合導熱材料,液態(tài)金屬,導熱灌封膠等;②導熱高
分子
2068
熱管理博覽會
??? 3年前
20條/頁
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分子動力學
焊接模擬-基礎課程(含高斯熱源平板對接全APDL實例)
對接焊縫
對接焊縫 力學
分子動力學模擬
公司簡介
服務條款
誠聘英才
聯(lián)系我們
技術鄰是深耕工科制造業(yè)領域的專業(yè)技術平臺,為企業(yè)提供項目培訓,分析和二次開發(fā)服務,為個人提供學習,認證,人脈積累和工作機會服務。找技術服務,就上技術鄰!
?2021
技術鄰
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浙公網(wǎng)安備 33010802005309號
增值電信業(yè)務經營許可證:浙B2-20250467
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