分子建模軟件
關注創建者：匿名 創建時間：2021-08-30
分子建模軟件的視頻教程
J-OCTA分子動力學軟件概述
作為一種全球趨勢，不僅化工制造商，汽車、航空航天和電氣制造商也在將分子到微米尺度的模擬應用于材料設計。 本視頻我們將討論模擬方法和應用案例。J-OCTA是基于OCTA系統的，OCTA系統是20年前在日本作為國家項目開發的。J-OCTA與機器學習相結合，稱為材料信息學。與大家分享了J-OCTA的歷史、用戶趨勢和最新技術。
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【J-OCTA教程】1.1 J-OCTA分子動力學軟件概述.mp4
J-Octa分子動力學軟件概述 多尺度仿真技術是新材料研發的有效手段。作為一種全球趨勢，不僅化工制造商，汽車、航空航天和電氣制造商也在將分子到微米尺度的模擬應用于材料設計。 本視頻我們將討論模擬方法和應用案例。J-OCTA是基于OCTA系統的，OCTA系統是20年前在日本作為國家項目開發的。J-OCTA與機器學習相結合，稱為材料信息學。
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DTAS 3D尺寸公差分析及尺寸鏈計算軟件Python腳本自動化自定義測量，突破軟件限制,實現建模自由！
摘要：公差分析軟件、尺寸鏈計算、尺寸公差分析、公差仿真分析、尺寸工程、尺寸鏈校核 在上期內容中，我們對DTAS Python腳本自動化建模-專治建模界的 "二高" 問題（高重復、高耗時）進行了深入探討。
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分子建模軟件的實例教程
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SCIGRESS 先進的分子建模和可視化功能使得研究者可以方便的導入多種實驗方法所得的分子結構，也可以輕松的建立一個新的結構。除了豐富的建模工具外， SCIGRESS也提供了強大的計算引擎和全面的分析工具。
分子動力學計算引擎Materials Explorer是由日本FUJITSU公司開發的一種高效的商業化的多用途分子動力學軟件包。Materials Explorer功能非常強大，有63個力場供選擇，可以用來研究有機物、高聚物、生物大分子、金屬、陶瓷材料、半導體等晶體、非晶體、溶液、流體、液體 和氣體的相變、膨脹、壓縮系數、抗張強度、粘度、熱導率、缺陷等。小分子藥物與生物大分子的對接以及小分子藥物的構效關系一直是計算機輔助藥物設計中兩項 非常重要的內容。Scigress繼承了CAChe的功能，提供了這兩項計算功能。此外，Scigress還包括了使用廣泛的半經驗量化計算模塊。通過 Scigress，研究者可以完成掃描分子勢能面，確定化學反應機理，尋找反應過渡態，分析紅外紫外光譜，明確分子軌道中的電子躍遷，常規分子動力學模 擬，計算眾多材料體系的力學與熱力學性質，模擬晶體的外延生長與表面吸附的動態行為，預測小分子在多孔材料中的分布情況，列舉分子的低能構象，建立藥物分 子的構效關系模型，完成小分子藥物與生物靶標的對接等多種科研任務。
SCIGRESS 實現了Client-Server 構架。研究者可以簡便的利用位于Microsoft Windows 平臺下的界面進行建模和結果分析，把大量的計算任務分配到服務器或計算集群中進行。這樣就使得研究者可以對更大的體系進行更精確的模擬計算。
展開 腔體內顆粒粒子追蹤He氣體分子的運動，如圖3所示。由圖可知，最終在吸附壁面上吸附了一定數量的氣體分子顆粒。
圖1 幾何模型
圖2 數密度分布
圖3 He氣體分子顆粒的運動分布
感興趣的朋友可下載模型源文件，歡迎合作交流
Schrodinger分子動力模擬與建模工作站配置探討
Schrodinger是計算化學領域為生命科學和材料研究提供解決方案領先者，是世界一流的分子建模、藥物設計和材料科學軟件集合，由AutoQSAR，Demond，FEP+、Maesrto 、MS Combi、MS Jaguar、Bioluminate、KNIME Extensions、Canvas、Glide、WaterMap等軟件組合而成.其中：
藥物發現：包含從頭設計、虛擬篩選、等級順序化合物、結構細化和準備、可視化和工作流程、生物制劑建模等，
材料科學：原子級仿真可以幫助您在開始合成和測試之前確定最有前途的結構和成分，從而可以加快新材料的開發。從有機電子產品到特種化學品再到聚合物制造
Schrodinger Desmond高性能分子動力學模擬
Desmond結合了速度和準確性，可以進行長時間的分子動力學模擬，從而使用戶可以檢查具有重要生物學和藥學意義的事件。Desmond與Maestro無縫集成，可提供全面的設置，仿真和分析工具，支持GPU加速
FEP +用于藥物發現的高性能自由能計算FEP +結合了非常精確的力場（OPLS3e）和改進的采樣算法，這些采樣算法利用GPU的高性能提供了前所未有的精度來提供結合自由能，為啟用結構的藥物發現項目提供了重要價值。
展開 1、分子動力學簡介：
分子動力學方法是一種計算機模擬實驗方法，是研究凝聚態系統的有力工具。該技術不僅可以得到原子的運動軌跡，還可以觀察到原子運動過程中各種微觀細節。它是對理論計算和實驗的有力補充。廣泛應用于材料科學、生物物理和藥物設計等。經典MD模擬，其系統規模在一般的計算機上也可達到數萬個原子，模擬時間為納秒量級。2006年進行了三千二百億個原子的模擬（IBM lueGene/L）。
分子動力學總是假定原子的運動服從某種確定的描述，這種描敘可以牛頓方程、拉格朗日方程或哈密頓方程所確定的描述，也就是說原子的運動和確定的軌跡聯系在一起。在忽略核子的量子效應和Born-Oppenheimer絕熱近似下，分子動力學的這一種假設是可行的。所謂絕熱近似也就是要求在分子動力學過程中的每一瞬間電子都處于原子結構的基態。要進行分子動力學模擬就必須知道原子間的相互作用勢。
在分子動力學模擬中，我們一般采用經驗勢來代替原子間的相互作用勢，如Lennard-Jones勢 、Mores勢、EAM原子嵌入勢、F-S多體勢。然而采用經驗勢必然丟失了局域電子結構之間存在的強相關作用信息，即不能得到原子動力學過程中的電子性質。
詳細介紹請見附件。
2、分子模擬的三步法和大致分類
三步法：
第一步：建模。包括幾何建模，物理建模，化學建模，力學建模。初始條件的設定，這里要從微觀和宏觀兩個方面進行考慮。
第二步：過程。這里就是體現所謂分子動力學特點的地方。包括對運動方程的積分的有效算法。對實際的過程的模擬算法。關鍵是分清楚平衡和非平衡，靜態和動態以及準靜態情況。
第三步：分析。這里是做學問的關鍵。你需要從以上的計算的結果中提取年需要的特征，說明你的問題的實質和結果。因此關鍵是統計、平均、定義、計算。
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分子建模軟件的相關專題、標簽、搜索
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QuantumATK
QuantumATK是一套完整的原子級仿真工具包，由全球領先的原子尺度建模專家團隊開發并提供技術支持。QuantumATK通過在新材料篩選過程中實現更高效的仿真工作流程，顯著減少材料研發時間與成本。這些工作流程可替代或指導實驗，來選擇和優化產品系統中的材料。
QuantumATK提供先進的圖形用戶界面與獨特的方法完備性，使用戶能夠在一個集成框架內計算各種基本材料屬性
Techwiz LCD 2D新的Lens掩膜結構
1. 摘要
Techwiz LCD 2D新增Lens掩膜結構，可以方便快捷的對LC 透鏡進行建模分析。 LC透鏡由于體積小、焦距可變等優點，被認為是光學系統中一個很有前景的研究領域。在有限的空間內改變焦距是可能的，因為LC材料的折射率可以通過施加電壓來調節。在LC透鏡結構中，可以通過TechWiz LCD 2D進行光程差和焦距的計算，以及包括施加電壓的
一 案例背景
帶隔板破甲戰斗部侵徹靶板是裝甲防護與反裝甲技術領域的核心研究方向，其仿真分析對戰斗部結構優化、毀傷效能評估具有關鍵意義。傳統試驗方法存在成本高、周期長、難以捕捉瞬態侵徹細節的問題，而數值仿真技術可精準復現破甲戰斗部從爆轟驅動、金屬射流形成到侵徹靶板的全流程，成為該領域的主流研究手段。帶隔板結構是破甲戰斗部的關鍵設計，隔板的材質
GEOVIA Surpac軟件掌握塊體建模所需的地質統計估值方法
2026年1月
授課語言：英語（附字幕）
課程時長：13個課時（總計2小時）
課程大小：1.3GB
核心方向：掌握塊體建模所需的地質統計估值方法
課程學習目標
地質統計學基礎入門
掌握向
天洑智能數據建模軟件DTEmpower在2025R2版本基礎上，新增大量更新和Bug修復，持續提升軟件性能，改善用戶體驗。
現DTEmpower 2025R3版已正式上線天洑軟件官網，歡迎下載體驗！
R3版本主要更新：
一、新增趨勢分析功能
數據管理模塊新增時間序列分析板塊，可從中進入趨勢、突變分析功能。該功能內置曼肯德爾檢驗等分析方法，專門用于檢驗時間序列數據中的趨勢特征，適配于金融
天洑智能數據建模軟件DTEmpower在2025R1版本基礎上，新增大量更新和Bug修復，持續提升軟件性能，改善用戶體驗。
現DTEmpower 2025R2版已正式上線天洑軟件官網，歡迎下載體驗！
R2版本相比R1主要更新：
一、智能檢測功能
新增智能檢測功能，可自動對數據進行白噪聲、平穩性、季節性和異方差性檢測。在輸出結果中，針對不同的檢測方法，智能檢測提供了對應的檢測結論
<p>不管是CAD等圖紙文件，還是Solidworks等3D建模軟件，還是Abaqus等包含建模模塊的仿真軟件，都是同一種通用底層邏輯，即：草圖+特征。</p><p><br></p><p>草圖主要就是，二維草圖，空間草圖。</p><p><br></p><p>特征就是，如：拉伸、旋轉、掃掠。等等這些對草圖進行的操作。</p>
4月8日，CAESES 5.3版本培訓會議于上海順利舉辦。來自702所、708所、RINA、BV、上海船舶設計研究院、江南造船、滬東中華、大連船舶重工、外高橋造船、黃埔文沖等十余家企業近70名工程師參會。
FRIENDSHIP公司總經理Heinrich介紹了CAESES 5.3新版本的功能、未來開發方向及歐洲船舶行業的新技術進展。
天洑軟件CAESES技術支持工程師張永興就CAESES
DTEmpower是天洑軟件自主研發的一款智能數據建模軟件，能夠深度挖掘分析工業領域中的仿真、試驗、測量等多元化數據，幫助用戶構建高品質的數據模型，實現快速設計評估、實時仿真預測、系統參數預警以及設備狀態監測等工程應用。軟件內置圖形化、零編碼的數據分析建模環境，圍繞數據清理、特征生成、敏感性分析和模型訓練等關鍵環節提供了豐富的AI算法支持，具備從模型搭建到模型管理與部署的一站式解決方案，零基礎用戶也能快速挖掘得到優秀的數據模型
