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整個交聯反應通過Python調用Lammps，進行弛豫、交聯的循環計算，可一次性達到目標交聯度，并得到直接用于Lammps的data文件，完整的交聯反應過程如圖4所示。 圖4 交聯過程最后,有需要歡迎通過微信公眾號聯系我們.微信公眾號:320科技工作室

本文介紹如何從構建工件-軋輥組合模型，然后在不同的溫度(中高溫(300k以上)、常溫(300k)和低溫(77k)模擬工件被軋制的過程。建立組合的模型的具體in文件如下：1、首先,采用atomsk平臺建立FCC結構的NiCrCo多晶結構。

關鍵詞：循環載荷；Cu單晶，塑性變形，位錯，lammps循環載荷是指在外力作用下，材料或結構經歷周期性應力或應變變化的現象。這種周期性變化通常是由于機械振動、疲勞測試、交變工作環境等因素引起的。循環載荷的大小和方向隨時間呈規律性變化，可以是正弦波、方波或其他形式的波形。循環載荷的影響一般采用應力-應變曲線或疲勞壽命實驗來確定。

7.8 模擬步驟：包括能量最小化NVT平衡，對研究目標的性質進行長時間軌跡平衡-輸出研究所關心的性質。

到目前為止，我做電工工作就整整三十年了，修理各類電氣故障不計其數，在修理的過程中，也總是有人問“師傅，大概多長時間能修好啊？”說句心里話，確實挺煩人的，人家正在滿腦子思考問題的時候，讓他一句話把整個思路都給打斷了。更有甚者，竟然在旁邊一個勁的冷嘲熱諷，說你什么都不行，這么小的毛病，到現在還處理不好等等。

圖4 驅替過程中有機孔隙內的模擬快照 圖5 不同時間下(a)烷烴在有機孔隙內X方向密度分布；(b)烷烴在X方向運移距離計算烷烴質心在x方向的變化值，可以代表一類烷烴流體的運移距離，在相同時間內流體較長的運移距離也代表著孔隙內CO2對該流體產生較大的驅替速度。

在lammps中位錯線的可視化提取可以觀測位錯的移動情況，但是無法得到文本數據，所以需要憑借編程程序進行提取。主要使用的是Julia對文本數據進行處理。而提取的主要依據就是晶格畸變參數，位錯的位置就是晶體晶格畸變參數明顯的原子組的定位，在lammps模擬過程中，我們添加了晶格畸變參數的計算，以便對數據文本的處理。提取后的效果是比較明顯的，模型中最后只留下了產生位錯的原子組合。

整個分子動力學過程通過Lammps實現，其中部分壁面需要在MS中進行調整。

圖1(a)彎曲載荷，圖1(b)三點彎曲；圖1(c)彎曲載荷分子動力學模型；圖1(d)三點彎曲分子動力學模型如圖1所示，本模擬根據實際加載狀況創建了Cu-Al合金模型。模型被構造為規則的面心立方（FCC）晶格，其晶體取向[100]、[010]和[001]分別平行于X、Y和Z軸方向。模擬過程中，首先在LAMMPS代碼中設置金屬單位制，并施加周期性邊界條件，并設定時間步長為0.001皮秒。

黏度的倒數平均值隨時間的變化。最后附上計算代碼 最后，有相關模擬需求歡迎通過公眾號“320科技工作室”與我們聯絡

關鍵詞：頁巖油，分子動力學，lammps，gromacs，界面張力，最小混相壓力摘要：分子模擬方法在探究納米尺度下分子間相互作用方面展現出巨大的技術優勢。因此，本文采用分子動力學模擬方法，研究體相CO2/原油的混相機理。通過我這套LAMMPS, GROMACS代碼，你可以實現不同氣體，不同油種類，不同溫度下的油氣界面張力和最小混相壓力計算。

2.2.模型描述對單晶鋁納米壓痕的分子動力學模擬通過原子/分子大規模并行模擬器(LAMMPS)實現，模擬結果采用OVITO進行可視化和晶體結構缺陷分析，位錯運動由位錯提取分析方法（Dislocation extraction analysis，DXA）進行表征。圖1為FCC單晶鋁納米壓痕的分子動力學模擬模型，該模型由面心立方的單晶鋁樣品和半徑分別為40?的虛擬壓頭組成。

二 模型描述 對藍寶石（Al2O3）拋光的分子動力學模擬通過原子/分子大規模并行模擬器(LAMMPS)實現，模擬結果采用OVITO進行可視化和材料去除分析。圖1為單晶Al2O3的拋光分子動力學模擬模型，該模型由Al2O3樣品、半徑為20Å的虛擬壓頭以及15Å的水膜組成。

圖3初始模型采用LAMMPS進行分子動力學模擬時，將體系劃分為多個同心圓環，圓環的軸心沿著z方向，坐標（x,y）為納米水滴質心坐標，圓環在z方向的切塊厚度dz為1?，在xy平面內的最小半徑為1?，最大半徑為盒子邊長的一半，并劃分為該數目的小塊，運算過程中統計每個小圓環體內的水分子數密度，統計完成后計算出每個小體積元內水的密度，并以液滴底面的中心點為起始點由遠及近地統計不同半徑和不同高度的液滴密度

另一方面，只要使用通用計算機，可以處理的空間尺度約為10納米，時間尺度在使用最近的軟件和硬件（如GPU）時為100納秒量級。這對于處理聚合物的長時間松弛現象等是不夠的。圖2. 左圖：FAMD表示的聚異戊二烯分子結構，右圖：CGMD圖像3、粗粒度分子動力學在粗粒度分子動力學（CGMD）中，一個粒子代表幾個原子的一組（圖2，右）。

本文介紹如何從構建模型到模擬有機物（以葡萄糖分子為例）在高溫下裂解過程和最終產物。有如下步驟： 初始化結構;1.1 建模input一個葡萄糖分子（圖1），然后module AC caculation，我這里寫500個分子（如圖2），run之后得到圖3.

Lombardo等［44］在開源軟件LAMMPS上建立了粗分子動力學模型（CGMD）［45］，如圖5（e）所示，其對電極漿料在勻漿過程中的狀態變化進行了模擬仿真。由于CGMD模型考慮了活性材料顆粒（AM）和碳粘結劑顆粒（CBD）的空間位置［31］，Rucci等［46］進一步評估了CBD空間位置對鋰離子傳輸效果及電池整體電化學性能的影響。