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基于GROMACS的有機物萃取
過程
分子
動力
學
模擬
隨著分子
動力
學
模擬
技術的發展,基于GROMACS的有機物萃取
過程
分子
模擬
為我們提供了新的研究手段。本文將探討基于GROMACS的有機物萃取
過程
的分子
模擬
技術及其應用前景。一、分子
動力
學
模擬
與GROMACS簡介分子
動力
學
模擬
(MD)是一種通過數值計算解決分子和原子間相互作用的經典力學方程的方法。
2579
2
1
320科技工作室
??? 10月前
帖子
Cadence CFD:用計算流體
動力
學
增強生物
模擬
研究的確定性
我們還意識到流體
動力
學
在改變設計以在各自環境中茁壯成長方面具有優勢。沿著這條線,計算流體
動力
學
(CFD)
模擬
可以提供很多不同流體的流動如何影響藥物輸送
過程
或其他用于先導化合物發現的生物
模擬
研究的頂層視圖。生物
模擬
研究中的 CFD在以下兩種情況下,CFD 提高了生物
模擬
研究的結果: 使用 CFD了解藥代
動力
學
非醫學背景的人可能想知道什么是藥代
動力
學
。
2556
Fidelity CFD
??? 2年前
帖子
MATLAB/FORTRAN | 鍵基近場
動力
學
(BBPD)動態松弛法實現準靜態單軸壓縮
模擬
(含預制裂隙),反力計算應力應變曲線
一套基于 MATLAB/Fortran 編寫的二維鍵基近場
動力
學
(Bond-based Peridynamics)數值仿真代碼。程序采用經典的動態松弛算法(Dynamic Relaxation),將
動力
學
方程轉化為解決準靜態問題的工具,
模擬
二維材料在單軸壓縮載荷下的響應及裂紋擴展
過程
。
2297
Zyax
??? 1月前
帖子
轉子
動力
學
系列(十):不平衡激勵下的啟動
過程
瞬態轉子
動力
學
分析
轉子
動力
學
系列(九):基于ANSYS Workbench的多軸轉子臨界轉速轉子
動力
學
系列(八):軸對稱實體單元Solid272/Solid273的應用轉子
動力
學
系列(七):帶支承結構的復雜轉子分析轉子
動力
學
系列(六):考慮預應力的轉子
動力
學
分析轉子
動力
學
系列(五):隨轉速變剛度和變阻尼的
模擬
轉子
動力
學
系列(四):不同軸承單元對比(COMBIN14和COMBI214)
5172
3
3
鐘偉良
??? 3年前
帖子
Abaqus顯示
動力
學
模擬
臺球撞擊案例教學
一、案例概述1.1 案例目的本案例旨在幫助學習者掌握利用Abaqus顯示
動力
學
模塊
模擬
臺球撞擊
過程
的完整流程,包括幾何建模、材料定義、接觸設置、分析步參數配置、網格劃分及結果后處理等核心操作。通過本案例的學習,學習者能夠深入理解顯示
動力
學
在解決瞬態撞擊問題中的應用原理,掌握撞擊
過程
中速度、應力、接觸力等關鍵物理量的提取與分析方法。
3019
2
3
Abaqus_JUN
??? 5月前
帖子
基于GROMACS的冰的拉伸分子
動力
學
模擬
還可以考察冰拉伸
過程
中的能量變化,可以看到拉伸
過程
中系統的能量一直在升高,如圖5所示。圖4 拉伸
過程
冰晶胞的變化圖5 拉伸
過程
冰晶胞的能量變化結語通過GROMACS分子
動力
學
模擬
,本案例成功探究了冰晶胞拉伸的演變
過程
。
1327
320科技工作室
??? 2月前
帖子
BCC點陣結構梁單元Abaqus壓縮仿真
模擬
-顯示
動力
學
質量縮放
本文通過abaqus顯示
動力
學
的方法對BCC結構進行壓縮仿真
模擬
,同時為減小計算量,采用梁單元
模擬
點陣結構,壓頭設置為剛性面,添加質量縮放,加快運算速度,為點陣結構壓縮
模擬
提供一種便捷方法。1. 建立BCC點陣模型,以單胞尺寸5X5X5為例。a.首先建立立方體實體,然后對實體進行處理,得到點陣單胞點陣結構。
4612
25
7
工科小師妹
??? 1年前
帖子
【流固耦合】翼傘后緣偏轉
過程
的流固耦合
動力
學
特性
翼傘后緣偏轉的操縱
過程
會顯著改變翼面的整體氣動布局,同時需要多根操縱繩精確協同控制,是典型的氣動與結構緊耦合問題,涉及到的
動力
學
問題復雜多變。對于翼傘系統操縱
過程
的
動力
學
機理問題研究一直是降落傘領域的關鍵技術和熱點問題。本文基于 Structured ALE(S-ALE)流固耦合方法對翼傘后緣偏轉
過程
進行
動力
學
建模和仿真分析。
4745
5
1
云數仿真
??? 2年前
帖子
神經元相互作用方式解析解描述突破,
模擬
大腦
動力
學
效率提升。(轉載)
牽一發而動全身,論文第一作者還放話稱: 由數十億個神經元和數萬億個突觸組成的大腦
動力
學
,我們現在也可以
模擬
了!還有網友表示: 這將會改善神經網絡對大規模數據計算的適應能力。點個贊!
3723
27
琳泓comsol
??? 3年前
帖子
基于GROMACS的小分子自組裝分子
動力
學
模擬
關鍵詞:GROMACS;小分子;自組裝;分子
動力
學
;回轉半徑背景介紹小分子自組裝
過程
廣泛存在于材料、生命與能源體系中,其微觀機理關乎膠束/囊泡形成、層狀有序相的出現以及功能納米結構的穩定性。相比僅觀察宏觀現象,分子
動力
學
(MD)能在原子尺度直接揭示小分子的自組裝機理,直觀體現其自組裝
過程
,從而為藥物,納米材料設計提供理論依據。
722
320科技工作室
??? 17天前
帖子
基于GROMACS的油水自發相分離分子
動力
學
模擬
而GROMACS作為高性能的開源MD
模擬
軟件,為研究油水界面張力、乳化劑作用、納米顆粒輔助分離等提供了強大的技術支持。本案例基于GROMACS,建立油水混合體系的分子
動力
學
模型,
模擬
其在常溫下的自發相分離
過程
,并考察油分子的溶劑可及表面積的變化。初始模型的構建在本案例中,我們采用烷烴(正十六烷) 作為油相,構建一個油水混合初始體系。
3039
320科技工作室
??? 1年前
帖子
腐蝕介質擴散行為的分子
動力
學
模擬
模型參數和收斂和能量數據如圖所示: 分子
動力
學
過程
:腐蝕介質粒子在緩蝕劑膜中的擴散行為的
模擬
通過forcite模塊的正則系綜(NVT)來實現,
模擬
溫度為 298 K,溫度采用 Andersen方法控制,各分子起始速度由Maxwell-Boltzmann分布隨機產生,運用 velocityverlet 算法叫求解牛頓運動方程.
2568
1
320科技工作室
??? 1年前
帖子
基于GROMACS的電場下水球行為分子
動力
學
模擬
關鍵詞:GROMACS;電場;水球; 分子
動力
學
;packmol在材料科學、電氣工程以及生物醫學領域,水球行為在外加電場下的變化具有重要意義。電場對水分子的影響不僅關系到液體的表面張力,還與電介質的性能、微流控技術的應用及生物細胞的電場響應等問題密切相關。因此,通過分子
動力
學
(MD)
模擬
研究電場下水球行為成為一種有效且精確的手段。
2341
320科技工作室
??? 8月前
帖子
改良楔形葉片旋轉空化器水
動力
學
特性數值
模擬
分析
為了確定葉片改良帶來的影響,本文擬通過三維定常數值
模擬
計算對這一改良楔形葉片旋轉空化器的水
動力
學
特性開展深入研究,并與原型葉片的水
動力
學
特性進行對比分析,得到不同轉速下葉型對旋轉空化器水
動力
學
特性的影響規律,以為旋轉空化器的設計和應用提供參考。1 計算模型圖 1 所示為本文所研究旋轉空化器楔形葉片的原始葉型和改良葉型的橫截面。
3175
2
Infiniteelements
??? 2年前
帖子
結構力學分析(靜力、
動力
、疲勞)、多體系統仿真、鑄造/成型
過程
模擬
算法分析,及工作站硬件配置推薦
鑄造/成型
過程
模擬
涉及算法:- 核心算法: 計算流體
動力
學
(CFD) + 隱式有限元法 (FEM) 的多物理場耦合。- CFD部分 (有限體積法): 用于
模擬
熔融金屬/塑料的充填、流動
過程
。- FEM部分 (隱式有限元法): 用于
模擬
冷卻、凝固、相變
過程
,以及由此產生的熱應力、變形和殘余應力。計算特點:- 計算密度極高: 這是所有仿真中計算最密集的領域之一。
2842
UltraLAB
??? 6月前
帖子
基于MS對界面聚合分子
動力
學
模擬
:哌嗪 /芳酰胺纖維
關鍵詞:Materials Studio,分子
動力
學
模擬
,均方位移,界面聚合通過界面聚合制備納濾膜的方法廣泛應用與膜分離技術領域。該篇工作通過研究PIP單體在水中和PIP在PPTA水和中擴散的分子
動力
學
模擬
。
2696
320科技工作室
??? 1年前
帖子
【CAE案例】針對法國吉倫特河口灣大尺度地貌
動力
學
數值
模擬
研究
其復雜的河口條件以及巨大的面積使得該地區在數值
模擬
方面需要大量的計算資源,因此對該地區泥沙遷移以及地貌
動力
學
方面的研究直到最近都一直難以推進。鑒于吉倫特的典型性,我們將其作為我們此次的主要研究對象。本次的研究將涵蓋整個吉倫特河口灣,在其中我們將選取多個測量點以在模型輸出結果和觀測數據之間做出一個初步的比對。
3915
1
1
CAE璐姐
??? 3年前
帖子
手把手教你用Gromacs完成溶菌酶在水中的
動力
學
模擬
今天,將為大家介紹如何在北鯤云超算平臺上快速完成
動力
學
模擬
計算,
模擬
溶菌酶(lysozyme)在水相中的結構變化。北鯤云超算平臺是前段時間小伙伴安利的,經過一段時間測試,效果還不錯。只需要一臺上網本就可以在短時間內完成
動力
學
模擬
所有內容,而且還預裝了Gromacs在內的300+應用軟件,實現了開箱即用,非常的靈活便捷。接下來,就正式進入今天的主題。
3141
1
1
深圳北鯤云計算有限公司
??? 3年前
帖子
使用火災
動力
學
模擬
器(FDS)完成火災CFD
模擬
課程(英)
- 需要一臺能夠運行PyroSim和FDS
模擬
的計算機。 - 必須具備學習計算火災建模并應用工程判斷的意愿。 **課程描述** 火災建模在性能化消防安全設計中已不再是可選項 — 它是必不可少的。 這門關于火災
動力
學
模擬
器(FDS)的完整專業課程,將帶您從零基礎走向高級實際火災建模應用。
1211
仿真資料吧
??? 16天前
帖子
模擬
普利司通世界太陽能挑戰賽的旋轉輪空氣
動力
學
,太陽能汽車旋轉輪的空氣
動力
學
模擬
。KU Leuven,工程技術學院。碩士論文, 2019. Vandervelpen E., Uten J.,用于太陽能汽車空氣
動力
學
模擬
的湍流模型測試,KU Leuven,工程技術學院。碩士論文, 2018.文章來源:cadence博客
2148
Fidelity CFD
??? 3年前
20條/頁
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