基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維

關鍵詞:

Materials Studio,分子動力學模擬,均方位移,界面聚合

通過界面聚合制備納濾膜的方法廣泛應用與膜分離技術領域。該篇工作通過研究PIP單體在水中和PIP在PPTA水和中擴散的分子動力學模擬。首先構建了含PIP單體的水模擬盒子,在此基礎上構建了PIP單體的PPTA-水凝膠模擬盒子,通過MSD曲線分析PPI純水體系和PPI-水凝膠體系中遷移速率。

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖1

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖2

DOI: 10.1039/c9ta12984g

以下內容分步驟對文獻模擬過程進行分析:

1、建立基礎模型

構建PIP、PPTA、H2O分子模型,如圖1所示。

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖3

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖4

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖5

圖1 不同物質的分子結構模型

2、構建Amorphous cell模型

利用Materials Studio (MS)中的Amorphous cell模塊,在COMMPASSII力場條件下構建兩個模型:(1)模型包含10個PIP分子和320個水分子;(2)10個PIP分子、40個TBP分子、1個含2重復單元PPTA。

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖6

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖7

(a) (b)

圖1 兩個模型(a:PPI)(b:PPI-PPTA)

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖8

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖9

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖10

(a)(b)(c)

圖2 兩個模型的AC參數(a:PPI)(b:PPI-PPTA)(c:模型參數)

2、模型結構優化

使用Forcite 模塊對上述混合有機相模型分別進行結構優化,使其達到最佳的模型結構和穩定的能量體系。模型參數如圖3所示。收斂和能量數據如圖5所示。

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖11

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖12

圖3兩個模型的Forcite 模型參數

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(a)

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖15

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖16

(b)

圖4 模型的收斂以及能量數據(a:PPI)(b:PPI-PPTA)

3、動力學優化

對上述結構優化后的模型繼續進行動力學優化。

1. NVT模式下100ps。動力學參數如圖5所示,動力學計算結果如圖6所示。

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖17

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖18

圖5 動力學優化參數

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基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖20

(a)

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖21

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖22

圖6 計算平衡后的能量和溫度數據(a:PPI)(b:PPI-PPTA)

2.NPT模式下100ps,動力學參數如圖7所示,動力學計算結果如圖8所示。

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖23

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖24

圖7 動力學優化參數

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖25

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(a)

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖27

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖28

圖8 計算平衡后的能量和密度數據(a:PPI)(b:PPI-PPTA)

3. NVT模式下100ps。動力學參數如圖9所示,動力學計算結果如圖10所示。

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖29

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖30

圖9 動力學優化參數

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖31

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(a)

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖33

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖34

(b)

圖10 計算平衡后的能量和溫度數據(a:PPI)(b:PPI-PPTA)

4、均方位移(MSD)計算

對上述優化后的模型進行MSD計算。模型及設置面板如下圖11所示。結果數據如圖12所示。

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖35

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖36

(a)

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖37

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖38

(b)

圖8 優化后模型及MSD參數(a:PPI)(b:PPI-PPTA(PPI-2))

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖39

基于MS對界面聚合分子動力學模擬:哌嗪 /芳酰胺纖維的圖40

圖9 MSD結果(a:PPI)(b:PPI-PPTA(PPI-2))

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