北鯤云abaqus計算
關(guān)注創(chuàng)建者：王靖雯 創(chuàng)建時間：2023-02-27
北鯤云abaqus計算的實例教程
近年來，隨著人工智能、AI智藥等科技領(lǐng)域的火熱，以及阿里云、騰訊云、華為云等互聯(lián)網(wǎng)大廠在各種場景下的成功應(yīng)用。高性能計算、云計算這類科技領(lǐng)域的詞匯也也逐漸進入人們的日常生活。那么，什么是云計算呢？云計算為什么這么火？云計算與高性能計算又有著什么樣的淵源?今天我們就詳細(xì)說一下云計算與高性能計算的區(qū)別與聯(lián)系。
在說云計算就不得不提到傳統(tǒng)的高性能計算，高性能計算是也就是許多人都聽說過的HPC（High Performance Computing)。傳統(tǒng)高性能計算的范疇是十分寬泛的，包括并行計算、分布式計算、計算機集群以及網(wǎng)格計算。
并行計算，是指一種能夠讓多條指令同時進行的計算模式。可分為時間上的并行和空間上的并行。 時間上的并行就是指流水線技術(shù)，而空間上的并行則是指用多個處理器并發(fā)的執(zhí)行計算。并行計算的目的就是提供單處理器無法提供的性能（處理器能力或存儲器），使用多處理器求解單個問題。 可以說，并行計算是云計算的初始階段或者說是萌芽期，它為云計算的發(fā)展提供了理論支持。
分布式計算，是研究如何把一個需要非常巨大的計算能力才能解決的問題分成許多小的部分，然后把這些部分分配給許多計算機進行處理，最后把這些計算結(jié)果綜合起來得到最終的結(jié)果。在分布式計算的算法中，我們更加關(guān)注的是計算機間的通信而不是算法的步驟，因為分布式計算的通信代價比起單節(jié)點對整體性能的影響權(quán)重要大得多。所以說，分布式計算是網(wǎng)絡(luò)發(fā)展的產(chǎn)物，是由并行計算演化出的新模式：網(wǎng)絡(luò)并行計算。如果說并行計算為云計算奠定了理論基礎(chǔ)，那么分布式計算則是云計算實現(xiàn)的網(wǎng)絡(luò)技術(shù)支持。
計算機集群，是指將一組松散集成的計算機軟件和/或硬件連接起來高度緊密地協(xié)作完成計算工作。簡單來說，我們可以把這一組松散的集成的計算機看作是一臺計算機。
展開 近日，2021可信云大會在京舉行，中國信息通信研究院（簡稱“信通院”）在2021年可信云大會上正式發(fā)布《云計算白皮書》，此次白皮書明確了云計算對軟件架構(gòu)、融合新技術(shù)、算力服務(wù)、管理模式、安全體系、數(shù)字化轉(zhuǎn)型等六個方面帶來深刻變革。
北鯤云超算平臺作為努力將高性能計算在云環(huán)境下可行性提高的一個平臺，不僅在軟件架構(gòu)方面，同時在算力服務(wù)和管理模式以及安全體系方面都取得了成功的嘗試。
從軟件架構(gòu)方便來說，北鯤云超算平臺本身是一個云算力SaaS平臺，在北鯤云超算平臺上預(yù)安裝了許多高性能計算的常用軟件。例如ANASYS系列，ABAQUS,GROMACS,VirtualFlow等，軟件類型覆蓋了分子生物、生物信息、工業(yè)仿真、材料科學(xué)、氣象海洋、人工智能等多個行業(yè)。而北鯤云超算平臺企業(yè)版是為企業(yè)提供解決方案的一套完整的應(yīng)用。
北鯤云超算平臺曾為深圳大學(xué)某智能機器人實驗室，部署了專屬的解決方案，在與北鯤云超算平臺合作之前，該智能器人實驗室配置的是8臺4卡的深度學(xué)習(xí)服務(wù)器，隨著智能機器人的應(yīng)用場景增加，更多更頻繁的訓(xùn)練和使用人數(shù)的上升嗎，使得該智能器人實驗室對GPU及CPU算力規(guī)模需求越來越大，智能機器人算力資源調(diào)度管理問題也逐漸凸顯，通過接入北鯤云超算平臺，整合了實驗室本地服務(wù)器資源和云上資源，當(dāng)實驗室本地服務(wù)器算力資源不能滿足自身需求時，支持通過集群調(diào)度系統(tǒng)平臺自動溢出到云上，與云上資源無縫對接，實現(xiàn)了作業(yè)無需排隊，從而提高計算效率。
在管理模式上，北鯤云超算平臺為企業(yè)用戶研發(fā)了一套專屬管理系統(tǒng)，企業(yè)的HPC管理員通過管理后臺可配置、監(jiān)控集群實時狀況，能夠靈活分配資源、設(shè)置收費模式及查看報表。
展開 “工欲善其事，必先利其器”，作為將云計算與生命科學(xué)領(lǐng)域研究相結(jié)合的倡導(dǎo)者，北鯤云超算平臺已經(jīng)安裝了AlphaFold2，并且開放了Nvidia Tesla A100、 Nvidia Tesla V100 的GPU資源，幫助研究人員解析新蛋白結(jié)構(gòu)。
目前，為了讓用戶進一步為體驗AlphaFold2使用便利，北鯤云從行業(yè)發(fā)展的實際情況出發(fā)，正式部署上線了AlphaFold2。在北鯤云的平臺之上，用戶無需安裝AlphaFold2，僅需花費短短一分鐘的實踐，在瀏覽器火鶴北鯤云客戶端都可以登錄北鯤云超算平臺，啟動工作站，并加載AlphaFold2模板，即可啟用AlphaFold2進行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測。便捷的使用環(huán)境，進一步減少了各種冗余步驟，為用戶有效節(jié)省操作時間，深入探索生命科研領(lǐng)域的奧妙之處。
不僅如此，北鯤云堅持以“提升算力”為發(fā)展目標(biāo)，通過并行AI云通過云主機平臺和裸金屬云服務(wù)等多平臺，提供A100\V100等多型號海量算力資源，支持多機多卡調(diào)度，免費使用3TB數(shù)據(jù)集，一鍵賬號登錄，全面考慮廣大用戶的操作痛點問題，不斷優(yōu)化平臺使用的便捷程度。
在使用AlphaFold2的過程當(dāng)中，北鯤云技術(shù)支持員表示，仍有許多的研究人員，會遇到操作問題，以及軟件運行問題，北鯤云也繼續(xù)堅持用戶體驗為重，為用戶提供為7*24小時在線技術(shù)支持，為科研工作者提供更多便捷的服務(wù)。
展開 北鯤云超算平臺全面考慮到了用戶在操作過程之中的各種“痛點問題”。譬如，北鯤云超算平臺就曾經(jīng)幫助某上市藥企CADD部門提供云計算服務(wù)，建立專屬計算區(qū)，用戶可以并行調(diào)動200-400 Nvidia v100卡，將計算時間從數(shù)周計算降至2小時，計算效率提高數(shù)百倍。
北鯤云在云計算領(lǐng)域有著多年的技術(shù)積累與沉淀，自主研發(fā)的北鯤云超算平臺也在不斷的完善，讓用戶在使用的過程中有更好的體驗，同時也為云計算提供更多應(yīng)用場景。
展開 北鯤云超算平臺擁有280萬IOPS和20GB/s吞吐能力的并行文件系統(tǒng),高IOPS、高吞吐,高速的計算能力將大幅度提升企業(yè)工作效率,幫助企業(yè)縮短藥物篩選的時間,加快藥物研發(fā)的進程;同時,北鯤云擁有海量云端異構(gòu)資源,最大化提高本地資源的利用率,當(dāng)本地算力資源不能滿足企業(yè)需求時,資源能夠自動溢到云上,能按需擴展資源,來實現(xiàn)不同數(shù)據(jù)庫的并行計算；北鯤云最低僅需0.08元/核時,超低的計費價格,按需付費靈活的方式,大大降低了藥物篩選的成本。
除虛擬篩選外,北鯤云還提供了基因測序、蛋白折疊、蛋白結(jié)構(gòu)模擬、分子對接、分子動力學(xué)模擬等應(yīng)用場景的高性能計算解決方案,助力生命科學(xué)領(lǐng)域的研究和發(fā)展。
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北鯤云abaqus計算的最新內(nèi)容
「北鯤云」的多云互聯(lián)超性能超算平臺為全行業(yè)提供基于不同業(yè)務(wù)場景、研發(fā)環(huán)境的解決方案。
編輯｜張冰冰
深圳北鯤云計算有限公司（以下簡稱「北鯤云」）近期宣布連續(xù)完成B和B+兩輪融資，分別由君聯(lián)資本、中南資本投資，兩輪融資均由毅仁資本擔(dān)任獨家財務(wù)顧問。「北鯤云」將利用新資金加速產(chǎn)品創(chuàng)新，拓展行業(yè)廣度及深度
北鯤云超算平臺如何成為就生命科學(xué)云計算領(lǐng)域先行者？
盡管云計算在國內(nèi)已經(jīng)發(fā)展了十余年之久，但仍然是個相對新穎的事物。近幾年隨著互聯(lián)網(wǎng)大廠對于公有云的建設(shè)，以及“新基建”的提出，國內(nèi)云計算公司迅速發(fā)展，北鯤云超算平臺作為在云計算領(lǐng)域、國內(nèi)生命科學(xué)行業(yè)的SaaS應(yīng)用的先行者，北鯤云成立于歐洲硅谷—斯德哥爾摩Kista，致力于為全球生命科學(xué)行業(yè)提供基于云計算模式的商業(yè)解決方案。
如今，分子生物學(xué)根本離不開計算機的幫助
近幾年，隨著“上云“概念的普及，而且云計算技術(shù)逐漸趨于成熟，許多有自建機房或者集群的高性能計算行業(yè)企業(yè)都開始上云。但是因為對于云技術(shù)的不了解，這些企業(yè)非常需要一個完善的企業(yè)上云方案。北鯤云計算有限公司就是的能夠為高性能計算行業(yè)企業(yè)提供一站式上云解決方案的公司。
那么北鯤云如何將云計算與高性能計算結(jié)合起來呢?在北鯤云年初獲得Pre-A輪融資時，談及為何選擇云超算作為創(chuàng)業(yè)方向時，創(chuàng)始人馮建新表示
近幾年，隨著“上云“概念的普及，而且云計算技術(shù)逐漸趨于成熟，許多有自建機房或者集群的高性能計算行業(yè)企業(yè)都開始上云。但是因為對于云技術(shù)的不了解，這些企業(yè)非常需要一個完善的企業(yè)上云方案。北鯤云計算有限公司就是的能夠為高性能計算行業(yè)企業(yè)提供一站式上云解決方案的公司。
那么北鯤云如何將云計算與高性能計算結(jié)合起來呢?在北鯤云年初獲得Pre-A輪融資時，談及為何選擇云超算作為創(chuàng)業(yè)方向時，創(chuàng)始人馮建新表示
近年來高新技術(shù)迅速發(fā)展,以醫(yī)藥研究領(lǐng)域為例,傳統(tǒng)的研究方法和手段已經(jīng)發(fā)生了巨大變化,許多藥物研發(fā)企業(yè)不得不考慮如何協(xié)作創(chuàng)新、降低藥物研發(fā)的復(fù)雜性。藥物篩選作為新藥研究關(guān)鍵的一步,企業(yè)若能掌握和應(yīng)用新技術(shù),這將在很大程度上推動新藥的研究。北鯤云超算平臺作為一個云計算平臺,能夠幫助企業(yè)縮短藥物篩選的時間,加快藥物研發(fā)的進程。在傳統(tǒng)藥物研發(fā)過程中,藥物篩選量龐大,研發(fā)過程費時費力,效率低,成本高昂,這些限制常制約著藥物篩選的發(fā)展
近年來，隨著中國科技的飛速發(fā)展，云計算已成為當(dāng)前最具前沿的一項新興技術(shù)，被廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)、芯片設(shè)計、人工智能、智能制造、影視與動漫制作等領(lǐng)域，為各產(chǎn)業(yè)的蓬勃發(fā)展注入了新的活力。尤其在生命科學(xué)研究領(lǐng)域，云計算技術(shù)為各研發(fā)機構(gòu)的藥物研發(fā)提供了有力支撐。
說起云計算，阿里云、騰訊云、華為云這些大平臺都是被大家所熟知。此外，作為Cloud-HPC的先行者，北鯤云計算自2018年成立以來，憑借于尖端技術(shù)和應(yīng)用場景
對于很多有高性能計算需求的用戶來說，通常比較關(guān)注的是計算的硬件配置是否是最新的，因為這往往關(guān)系到計算效率。但性能計算與任何一項技術(shù)一樣，都需要分步驟完成，除了計算速度，在高性能完成一項計算任務(wù)后，所用到的存儲空間最終了決定這項任務(wù)是否能夠成功執(zhí)行。北鯤云計算小編就帶你一起來了解一下存儲的重要性。
隨著異構(gòu)計算越來越多的應(yīng)用，包括傳統(tǒng)高性能計算和新興的云計算都開始大規(guī)模的采用異構(gòu)計算方式，包括GPU
回顧科技革命的發(fā)展歷程，每一個技術(shù)突破、技術(shù)研發(fā)的“閃光點”，都代表著人類世界的轉(zhuǎn)型升級，代表著新領(lǐng)域、新產(chǎn)業(yè)的誕生與發(fā)展。如今，隨著一線研究學(xué)者的不斷攻堅、不斷探索，生物科研領(lǐng)域邁入至一個全新的發(fā)展階段：AlphaFold2不僅完成了98.5%人類蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測，并且做成數(shù)據(jù)集免費開源。
毫無疑問，這是一個令人振奮的消息，代表著生物科研技術(shù)的發(fā)展與創(chuàng)新，取得了可喜的突破。但免費開源也意味著會有更多的生命科學(xué)研究人員使用
科技的發(fā)展加速了許多行業(yè)的發(fā)展，云計算的日漸成熟也在不斷地重塑著生命科學(xué)行業(yè)，從而使得傳統(tǒng)的藥物研發(fā)企業(yè)面臨著從研發(fā)成本到藥物供應(yīng)途徑乃至專利到期等諸多問題，不斷攀升的研發(fā)成本，導(dǎo)致藥物供應(yīng)途徑減少，進一步導(dǎo)致研發(fā)效率降低，甚至最終影響到專科到期前能否將研發(fā)成本收回。
因此，許多藥物研發(fā)企業(yè)不得不考慮如何協(xié)作創(chuàng)新,降低藥物研發(fā)的復(fù)雜性，這也是云計算給生命科學(xué)行業(yè)帶來的變革。北鯤云超算平臺作為一個將云上的高性能計算平臺
經(jīng)過數(shù)年的發(fā)展，高性能計算在云環(huán)境下的使用也越來越成熟。在AWS、阿里云、騰訊云等這些大型的云服務(wù)供應(yīng)商已經(jīng)利用更為強大的網(wǎng)絡(luò)與處理器方案向高性能計算作出了試探性延伸的同時，諸如北鯤云、Rescale等公司也開始通過將軟件與高性能計算獨立軟件開發(fā)商相對接的方式，進而幫助高性能計算用戶更加地輕松使用高性能計算軟件。
與傳統(tǒng)的高性能計算集群（如，超算中心）相比，租賃云廠商資源確實會提高使用成本
