北鯤云abaqus計(jì)算的案例
北鯤云：淺談云計(jì)算與高性能計(jì)算的區(qū)別與聯(lián)系
近年來，隨著人工智能、AI智藥等科技領(lǐng)域的火熱，以及阿里云、騰訊云、華為云等互聯(lián)網(wǎng)大廠在各種場(chǎng)景下的成功應(yīng)用。高性能計(jì)算、云計(jì)算這類科技領(lǐng)域的詞匯也也逐漸進(jìn)入人們的日常生活。那么，什么是云計(jì)算呢？云計(jì)算為什么這么火？云計(jì)算與高性能計(jì)算又有著什么樣的淵源?今天我們就詳細(xì)說一下云計(jì)算與高性能計(jì)算的區(qū)別與聯(lián)系。
在說云計(jì)算就不得不提到傳統(tǒng)的高性能計(jì)算，高性能計(jì)算是也就是許多人都聽說過的HPC（High Performance Computing)。傳統(tǒng)高性能計(jì)算的范疇是十分寬泛的，包括并行計(jì)算、分布式計(jì)算、計(jì)算機(jī)集群以及網(wǎng)格計(jì)算。
并行計(jì)算，是指一種能夠讓多條指令同時(shí)進(jìn)行的計(jì)算模式。可分為時(shí)間上的并行和空間上的并行。 時(shí)間上的并行就是指流水線技術(shù)，而空間上的并行則是指用多個(gè)處理器并發(fā)的執(zhí)行計(jì)算。并行計(jì)算的目的就是提供單處理器無法提供的性能（處理器能力或存儲(chǔ)器），使用多處理器求解單個(gè)問題。 可以說，并行計(jì)算是云計(jì)算的初始階段或者說是萌芽期，它為云計(jì)算的發(fā)展提供了理論支持。
分布式計(jì)算，是研究如何把一個(gè)需要非常巨大的計(jì)算能力才能解決的問題分成許多小的部分，然后把這些部分分配給許多計(jì)算機(jī)進(jìn)行處理，最后把這些計(jì)算結(jié)果綜合起來得到最終的結(jié)果。在分布式計(jì)算的算法中，我們更加關(guān)注的是計(jì)算機(jī)間的通信而不是算法的步驟，因?yàn)榉植际?em>計(jì)算的通信代價(jià)比起單節(jié)點(diǎn)對(duì)整體性能的影響權(quán)重要大得多。所以說，分布式計(jì)算是網(wǎng)絡(luò)發(fā)展的產(chǎn)物，是由并行計(jì)算演化出的新模式：網(wǎng)絡(luò)并行計(jì)算。如果說并行計(jì)算為云計(jì)算奠定了理論基礎(chǔ)，那么分布式計(jì)算則是云計(jì)算實(shí)現(xiàn)的網(wǎng)絡(luò)技術(shù)支持。
計(jì)算機(jī)集群，是指將一組松散集成的計(jì)算機(jī)軟件和/或硬件連接起來高度緊密地協(xié)作完成計(jì)算工作。簡單來說，我們可以把這一組松散的集成的計(jì)算機(jī)看作是一臺(tái)計(jì)算機(jī)。
展開 2021可信云大會(huì)順利召開，北鯤云踐行云計(jì)算六大發(fā)展趨勢(shì)
近日，2021可信云大會(huì)在京舉行，中國信息通信研究院（簡稱“信通院”）在2021年可信云大會(huì)上正式發(fā)布《云計(jì)算白皮書》，此次白皮書明確了云計(jì)算對(duì)軟件架構(gòu)、融合新技術(shù)、算力服務(wù)、管理模式、安全體系、數(shù)字化轉(zhuǎn)型等六個(gè)方面帶來深刻變革。
北鯤云超算平臺(tái)作為努力將高性能計(jì)算在云環(huán)境下可行性提高的一個(gè)平臺(tái)，不僅在軟件架構(gòu)方面，同時(shí)在算力服務(wù)和管理模式以及安全體系方面都取得了成功的嘗試。
從軟件架構(gòu)方便來說，北鯤云超算平臺(tái)本身是一個(gè)云算力SaaS平臺(tái)，在北鯤云超算平臺(tái)上預(yù)安裝了許多高性能計(jì)算的常用軟件。例如ANASYS系列，ABAQUS,GROMACS,VirtualFlow等，軟件類型覆蓋了分子生物、生物信息、工業(yè)仿真、材料科學(xué)、氣象海洋、人工智能等多個(gè)行業(yè)。而北鯤云超算平臺(tái)企業(yè)版是為企業(yè)提供解決方案的一套完整的應(yīng)用。
北鯤云超算平臺(tái)曾為深圳大學(xué)某智能機(jī)器人實(shí)驗(yàn)室，部署了專屬的解決方案，在與北鯤云超算平臺(tái)合作之前，該智能器人實(shí)驗(yàn)室配置的是8臺(tái)4卡的深度學(xué)習(xí)服務(wù)器，隨著智能機(jī)器人的應(yīng)用場(chǎng)景增加，更多更頻繁的訓(xùn)練和使用人數(shù)的上升嗎，使得該智能器人實(shí)驗(yàn)室對(duì)GPU及CPU算力規(guī)模需求越來越大，智能機(jī)器人算力資源調(diào)度管理問題也逐漸凸顯，通過接入北鯤云超算平臺(tái)，整合了實(shí)驗(yàn)室本地服務(wù)器資源和云上資源，當(dāng)實(shí)驗(yàn)室本地服務(wù)器算力資源不能滿足自身需求時(shí)，支持通過集群調(diào)度系統(tǒng)平臺(tái)自動(dòng)溢出到云上，與云上資源無縫對(duì)接，實(shí)現(xiàn)了作業(yè)無需排隊(duì)，從而提高計(jì)算效率。
在管理模式上，北鯤云超算平臺(tái)為企業(yè)用戶研發(fā)了一套專屬管理系統(tǒng)，企業(yè)的HPC管理員通過管理后臺(tái)可配置、監(jiān)控集群實(shí)時(shí)狀況，能夠靈活分配資源、設(shè)置收費(fèi)模式及查看報(bào)表。
展開 北鯤云探索云計(jì)算在生命科學(xué)領(lǐng)域更多的應(yīng)用場(chǎng)景
北鯤云超算平臺(tái)全面考慮到了用戶在操作過程之中的各種“痛點(diǎn)問題”。譬如，北鯤云超算平臺(tái)就曾經(jīng)幫助某上市藥企CADD部門提供云計(jì)算服務(wù)，建立專屬計(jì)算區(qū)，用戶可以并行調(diào)動(dòng)200-400 Nvidia v100卡，將計(jì)算時(shí)間從數(shù)周計(jì)算降至2小時(shí)，計(jì)算效率提高數(shù)百倍。
北鯤云在云計(jì)算領(lǐng)域有著多年的技術(shù)積累與沉淀，自主研發(fā)的北鯤云超算平臺(tái)也在不斷的完善，讓用戶在使用的過程中有更好的體驗(yàn)，同時(shí)也為云計(jì)算提供更多應(yīng)用場(chǎng)景。
展開 AlphaFold2“登陸”北鯤云平臺(tái)，云計(jì)算助力科研大放異彩
“工欲善其事，必先利其器”，作為將云計(jì)算與生命科學(xué)領(lǐng)域研究相結(jié)合的倡導(dǎo)者，北鯤云超算平臺(tái)已經(jīng)安裝了AlphaFold2，并且開放了Nvidia Tesla A100、 Nvidia Tesla V100 的GPU資源，幫助研究人員解析新蛋白結(jié)構(gòu)。
目前，為了讓用戶進(jìn)一步為體驗(yàn)AlphaFold2使用便利，北鯤云從行業(yè)發(fā)展的實(shí)際情況出發(fā)，正式部署上線了AlphaFold2。在北鯤云的平臺(tái)之上，用戶無需安裝AlphaFold2，僅需花費(fèi)短短一分鐘的實(shí)踐，在瀏覽器火鶴北鯤云客戶端都可以登錄北鯤云超算平臺(tái)，啟動(dòng)工作站，并加載AlphaFold2模板，即可啟用AlphaFold2進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。便捷的使用環(huán)境，進(jìn)一步減少了各種冗余步驟，為用戶有效節(jié)省操作時(shí)間，深入探索生命科研領(lǐng)域的奧妙之處。
不僅如此，北鯤云堅(jiān)持以“提升算力”為發(fā)展目標(biāo)，通過并行AI云通過云主機(jī)平臺(tái)和裸金屬云服務(wù)等多平臺(tái)，提供A100\V100等多型號(hào)海量算力資源，支持多機(jī)多卡調(diào)度，免費(fèi)使用3TB數(shù)據(jù)集，一鍵賬號(hào)登錄，全面考慮廣大用戶的操作痛點(diǎn)問題，不斷優(yōu)化平臺(tái)使用的便捷程度。
在使用AlphaFold2的過程當(dāng)中，北鯤云技術(shù)支持員表示，仍有許多的研究人員，會(huì)遇到操作問題，以及軟件運(yùn)行問題，北鯤云也繼續(xù)堅(jiān)持用戶體驗(yàn)為重，為用戶提供為7*24小時(shí)在線技術(shù)支持，為科研工作者提供更多便捷的服務(wù)。
展開 
北鯤云探索醫(yī)藥研發(fā),云計(jì)算再添新應(yīng)用場(chǎng)景
北鯤云超算平臺(tái)擁有280萬IOPS和20GB/s吞吐能力的并行文件系統(tǒng),高IOPS、高吞吐,高速的計(jì)算能力將大幅度提升企業(yè)工作效率,幫助企業(yè)縮短藥物篩選的時(shí)間,加快藥物研發(fā)的進(jìn)程;同時(shí),北鯤云擁有海量云端異構(gòu)資源,最大化提高本地資源的利用率,當(dāng)本地算力資源不能滿足企業(yè)需求時(shí),資源能夠自動(dòng)溢到云上,能按需擴(kuò)展資源,來實(shí)現(xiàn)不同數(shù)據(jù)庫的并行計(jì)算；北鯤云最低僅需0.08元/核時(shí),超低的計(jì)費(fèi)價(jià)格,按需付費(fèi)靈活的方式,大大降低了藥物篩選的成本。
除虛擬篩選外,北鯤云還提供了基因測(cè)序、蛋白折疊、蛋白結(jié)構(gòu)模擬、分子對(duì)接、分子動(dòng)力學(xué)模擬等應(yīng)用場(chǎng)景的高性能計(jì)算解決方案,助力生命科學(xué)領(lǐng)域的研究和發(fā)展。
展開 云計(jì)算深度挖掘“創(chuàng)新潛力”，北鯤云深耕生命科學(xué)領(lǐng)域
面對(duì)快速發(fā)展的當(dāng)今社會(huì)，唯有借助尖端技術(shù)，才能取得革命性的突破，從而助推人類社會(huì)不斷超前發(fā)展，而云計(jì)算技術(shù)，無疑就是這樣一種尖端技術(shù)。深圳北鯤云計(jì)算有限公司（以下簡稱 “北鯤云”）認(rèn)為，云計(jì)算技術(shù)的強(qiáng)大之處，不僅僅在于突出的實(shí)用功能，以及內(nèi)斂的創(chuàng)新力量等方面。更體現(xiàn)在于其較為廣泛的適應(yīng)力之上，能夠運(yùn)用于許多行業(yè)，并且發(fā)揮重要價(jià)值。譬如說，時(shí)下大熱的生命科學(xué)、生物制藥領(lǐng)域當(dāng)中，就經(jīng)常出現(xiàn)云計(jì)算技術(shù)的身影。
解決數(shù)據(jù)難題，提供藥物治療“最優(yōu)解”方案
北鯤云指出，云計(jì)算技術(shù)“不務(wù)虛、只務(wù)實(shí)”，在生命科學(xué)領(lǐng)域成功取得了實(shí)打?qū)嵉陌寥顺煽儭Ｆ┤?，基因技術(shù)可以對(duì)孕婦進(jìn)行無創(chuàng)傷的產(chǎn)前先天遺傳缺陷檢測(cè)，并且根據(jù)基因特征片段提早預(yù)防癌癥。但很顯然，基因數(shù)據(jù)的產(chǎn)出量無疑是一個(gè)“天文數(shù)字”，并且一直保持增長狀態(tài)。常規(guī)測(cè)序儀無法承擔(dān)如此數(shù)量級(jí)的管理任務(wù)，并且對(duì)計(jì)算力擁有很高的要求。在這種情況之下，必須要依靠云計(jì)算技術(shù)的幫助，才能真正為萬千用戶提供藥物治療的“最優(yōu)解”方案。此外，云計(jì)算技術(shù)還將在“蛋白設(shè)計(jì)”年代當(dāng)中，持續(xù)發(fā)揮創(chuàng)新價(jià)值，讓人類得以從最微觀的地方解釋各種疾病發(fā)生的實(shí)質(zhì)原因。
如今，北鯤云基于基因測(cè)序、靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)、虛擬篩選、分子動(dòng)力學(xué)模擬等應(yīng)用場(chǎng)景，為生命科學(xué)行業(yè)用戶提供一站式的生物信息學(xué)及計(jì)算化學(xué)領(lǐng)域整體解決方案，切實(shí)解決棘手的數(shù)據(jù)難題，助推基因技術(shù)領(lǐng)域不斷發(fā)展。
解決使用痛點(diǎn)問題，切實(shí)做到“想用戶之所想”
為了能夠幫助生物科學(xué)領(lǐng)域的廣大客戶，切實(shí)解決各種使用過程當(dāng)中的各種痛點(diǎn)問題，北鯤云針對(duì)性地優(yōu)化服務(wù)方案，推出了許多創(chuàng)新措施。譬如，服務(wù)一體化功能，可提供從數(shù)據(jù)、軟件到算力的全流程服務(wù)，為用戶打造一體化的生物信息、計(jì)算化學(xué)等科研環(huán)境；硬件自動(dòng)更新功能，接入北鯤云資源后，硬件持續(xù)更新，用戶可實(shí)時(shí)調(diào)用最新硬件資源。
展開 云計(jì)算重塑生命科學(xué)行業(yè)，北鯤云加速生物制藥企業(yè)轉(zhuǎn)型
科技的發(fā)展加速了許多行業(yè)的發(fā)展，云計(jì)算的日漸成熟也在不斷地重塑著生命科學(xué)行業(yè)，從而使得傳統(tǒng)的藥物研發(fā)企業(yè)面臨著從研發(fā)成本到藥物供應(yīng)途徑乃至專利到期等諸多問題，不斷攀升的研發(fā)成本，導(dǎo)致藥物供應(yīng)途徑減少，進(jìn)一步導(dǎo)致研發(fā)效率降低，甚至最終影響到?？频狡谇澳芊駥⒀邪l(fā)成本收回。
因此，許多藥物研發(fā)企業(yè)不得不考慮如何協(xié)作創(chuàng)新,降低藥物研發(fā)的復(fù)雜性，這也是云計(jì)算給生命科學(xué)行業(yè)帶來的變革。北鯤云超算平臺(tái)作為一個(gè)將云上的高性能計(jì)算平臺(tái)，準(zhǔn)確把握住生命科學(xué)行業(yè)所面臨的困局，能夠結(jié)合生命科學(xué)領(lǐng)域的不同場(chǎng)景制定企業(yè)專屬的解決方案。借助北鯤云的行業(yè)解決方案。,企業(yè)能夠加快藥物研發(fā)的進(jìn)程，進(jìn)而加快上市時(shí)間，同時(shí)，提升企業(yè)的算力集群功能。方便企業(yè)進(jìn)行資源分配及管理。
對(duì)于高校用戶來說，如果沒有獨(dú)立的高性能計(jì)算集群，用戶也可以在北鯤云平臺(tái)直接使用軟件進(jìn)行計(jì)算。比如最近備受業(yè)界關(guān)注的AlphaFold2，據(jù)悉，DeepMind不僅公開了 AlphaFold2的源代碼，而且還免費(fèi)開放了AlphaFold數(shù)據(jù)集。
面對(duì)已經(jīng)開源的AlphaFold2，許多從事生物大分子研究的同學(xué)肯定想嘗試一些這個(gè)能夠高度準(zhǔn)確預(yù)測(cè)人類98.5%蛋白質(zhì)的軟件。然而，AlphaFold2對(duì)于硬件設(shè)備的要求卻相當(dāng)高，專業(yè)人事給出的參考配置如下：
Nvidia A100售價(jià)高達(dá)7萬，硬件設(shè)備價(jià)格都差不多，當(dāng)然你還需要人力來配置，人工費(fèi)用另算。當(dāng)然，你也可以直接在北鯤云超算平臺(tái)使用GPU核時(shí)。
在存儲(chǔ)方面來說，AlphaFold2訓(xùn)練好的模型加數(shù)據(jù)庫下載下來是428 GB大小的文件，解壓后需要2.2T的空間，因此用戶至少需要3T的存儲(chǔ)空間，而北鯤云超算平臺(tái)能夠?yàn)橛脩籼峁㏄B級(jí)別的存儲(chǔ)空間。
展開 北鯤云超算平臺(tái)如何將云計(jì)算與高性能計(jì)算結(jié)合
近幾年，隨著“上云“概念的普及，而且云計(jì)算技術(shù)逐漸趨于成熟，許多有自建機(jī)房或者集群的高性能計(jì)算行業(yè)企業(yè)都開始上云。但是因?yàn)閷?duì)于云技術(shù)的不了解，這些企業(yè)非常需要一個(gè)完善的企業(yè)上云方案。北鯤云計(jì)算有限公司就是的能夠?yàn)楦咝阅?em>計(jì)算行業(yè)企業(yè)提供一站式上云解決方案的公司。
那么北鯤云如何將云計(jì)算與高性能計(jì)算結(jié)合起來呢?在北鯤云年初獲得Pre-A輪融資時(shí)，談及為何選擇云超算作為創(chuàng)業(yè)方向時(shí)，創(chuàng)始人馮建新表示，在多年的工作中發(fā)現(xiàn)當(dāng)前的云計(jì)算市場(chǎng)上企業(yè)在云資源管理方面有很多可以提高和優(yōu)化的工作。從需求側(cè)來看，企業(yè)內(nèi)部通常通過預(yù)定系統(tǒng)來申請(qǐng)和釋放云服務(wù)器資源，但資源申請(qǐng)無法實(shí)時(shí)匹配，經(jīng)常會(huì)出現(xiàn)資源過剩，亦或不足導(dǎo)致大量計(jì)算任務(wù)排隊(duì)，工作效率較低。 從供給端來看，公有云廠商有大量的云服務(wù)器處于空閑當(dāng)中，據(jù)統(tǒng)計(jì)云服務(wù)器平均空閑比高達(dá)50%左右。北鯤云基于此打造了北鯤云一站式云超算平臺(tái)，當(dāng)用戶提交任務(wù)時(shí)，無需提前購買資源，從北鯤云超算平臺(tái)里自動(dòng)匹配到最合適的公有云資源去執(zhí)行高性能計(jì)算任務(wù)，當(dāng)任務(wù)執(zhí)行完畢的時(shí)候自動(dòng)釋放資源，大幅提高了公有云廠商云服務(wù)器的利用率。并且北鯤云針對(duì)國內(nèi)市場(chǎng)的特點(diǎn)，最早提出了競(jìng)價(jià)服務(wù)器管理方案，通過此機(jī)制，企業(yè)可以提供比同行更低報(bào)價(jià)的算力解決方案。
企業(yè)可以通過北鯤云超算平臺(tái)提供的私有模式、混合模式以及云上模式將企業(yè)異構(gòu)的資源整合，并隨之將業(yè)務(wù)遷移上云。北鯤云超算平臺(tái)在這個(gè)階段重塑了硬件資源層，解決了硬件資源彈性伸縮問題，并且能夠?qū)⑸蠈討?yīng)用開發(fā)和運(yùn)維產(chǎn)生根本變革，將云上的彈性、敏捷性等云的特性釋放。從而大幅提高企業(yè)的工作效率。
北鯤云超算平臺(tái)通過那幾種模式將云計(jì)算與高性能計(jì)算結(jié)合呢？有以下三種方式：
北鯤云SaaS模式：為所有有高性能計(jì)算需求的客戶提供算力SaaS服務(wù)。
展開 北鯤云超算平臺(tái)如何將云計(jì)算與高性能計(jì)算結(jié)合
近幾年，隨著“上云“概念的普及，而且云計(jì)算技術(shù)逐漸趨于成熟，許多有自建機(jī)房或者集群的高性能計(jì)算行業(yè)企業(yè)都開始上云。但是因?yàn)閷?duì)于云技術(shù)的不了解，這些企業(yè)非常需要一個(gè)完善的企業(yè)上云方案。北鯤云計(jì)算有限公司就是的能夠?yàn)楦咝阅?em>計(jì)算行業(yè)企業(yè)提供一站式上云解決方案的公司。
那么北鯤云如何將云計(jì)算與高性能計(jì)算結(jié)合起來呢?在北鯤云年初獲得Pre-A輪融資時(shí)，談及為何選擇云超算作為創(chuàng)業(yè)方向時(shí)，創(chuàng)始人馮建新表示，在多年的工作中發(fā)現(xiàn)當(dāng)前的云計(jì)算市場(chǎng)上企業(yè)在云資源管理方面有很多可以提高和優(yōu)化的工作。從需求側(cè)來看，企業(yè)內(nèi)部通常通過預(yù)定系統(tǒng)來申請(qǐng)和釋放云服務(wù)器資源，但資源申請(qǐng)無法實(shí)時(shí)匹配，經(jīng)常會(huì)出現(xiàn)資源過剩，亦或不足導(dǎo)致大量計(jì)算任務(wù)排隊(duì)，工作效率較低。 從供給端來看，公有云廠商有大量的云服務(wù)器處于空閑當(dāng)中，據(jù)統(tǒng)計(jì)云服務(wù)器平均空閑比高達(dá)50%左右。北鯤云基于此打造了北鯤云一站式云超算平臺(tái)，當(dāng)用戶提交任務(wù)時(shí)，無需提前購買資源，從北鯤云超算平臺(tái)里自動(dòng)匹配到最合適的公有云資源去執(zhí)行高性能計(jì)算任務(wù)，當(dāng)任務(wù)執(zhí)行完畢的時(shí)候自動(dòng)釋放資源，大幅提高了公有云廠商云服務(wù)器的利用率。并且北鯤云針對(duì)國內(nèi)市場(chǎng)的特點(diǎn)，最早提出了競(jìng)價(jià)服務(wù)器管理方案，通過此機(jī)制，企業(yè)可以提供比同行更低報(bào)價(jià)的算力解決方案。
企業(yè)可以通過北鯤云超算平臺(tái)提供的私有模式、混合模式以及云上模式將企業(yè)異構(gòu)的資源整合，并隨之將業(yè)務(wù)遷移上云。北鯤云超算平臺(tái)在這個(gè)階段重塑了硬件資源層，解決了硬件資源彈性伸縮問題，并且能夠?qū)⑸蠈討?yīng)用開發(fā)和運(yùn)維產(chǎn)生根本變革，將云上的彈性、敏捷性等云的特性釋放。從而大幅提高企業(yè)的工作效率。
北鯤云超算平臺(tái)通過那幾種模式將云計(jì)算與高性能計(jì)算結(jié)合呢？有以下三種方式：
北鯤云SaaS模式：為所有有高性能計(jì)算需求的客戶提供算力SaaS服務(wù)。
展開 「北鯤云」連續(xù)完成B和B+輪融資，驅(qū)動(dòng)云上高性能計(jì)算新引擎
「北鯤云」作為高性能計(jì)算服務(wù)平臺(tái)，針對(duì)不同行業(yè)客戶，提供具有行業(yè)針對(duì)性HPC Cloud服務(wù)，能夠高效協(xié)同多個(gè)云平臺(tái)，綜合調(diào)配各家資源，為客戶提供高性能低成本的計(jì)算服務(wù)，對(duì)提高國內(nèi)HPC計(jì)算效率和業(yè)內(nèi)服務(wù)質(zhì)量具有深遠(yuǎn)意義?！?/span>
北鯤云助力生命科學(xué)，高性能計(jì)算突破屏障
北鯤云高性能運(yùn)算平臺(tái)幫助生命科學(xué)領(lǐng)域?qū)嶋H解決客觀問題，把研究成果落實(shí)下去，而不是停留表面，突破現(xiàn)階段限制生命科學(xué)研究發(fā)展的客觀屏障。北鯤云以多年的云計(jì)算領(lǐng)域的經(jīng)驗(yàn)和沉淀打造的高性能運(yùn)算平臺(tái)為生命科學(xué)主力，同時(shí)也為可以應(yīng)有到更多的場(chǎng)景中而努力。
北鯤云計(jì)算，用技術(shù)成就生物科學(xué)領(lǐng)域發(fā)展
高性能計(jì)算的應(yīng)用在生命科學(xué)領(lǐng)域的研究和發(fā)展當(dāng)中起到了至關(guān)重要的作用，輔助學(xué)科發(fā)展的同時(shí)也讓很多沒有可靠超算平臺(tái)的機(jī)構(gòu)受到了限制。
生命科學(xué)的研究的主要內(nèi)容是生物信息，通過采集、處理、存儲(chǔ)、傳播、分析和解釋等，再通過綜合利用生物學(xué)，計(jì)算機(jī)科學(xué)和信息技術(shù)從而揭開數(shù)據(jù)龐大而復(fù)雜的生物數(shù)據(jù)所隱藏的生物學(xué)奧秘。生物的基因數(shù)量是數(shù)以億萬計(jì)的，在這個(gè)龐大的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上，無論是儲(chǔ)存還是分析運(yùn)算都是一個(gè)挑戰(zhàn)。
北鯤云超算平臺(tái)能有效地解決這個(gè)問題，用戶通過超算平臺(tái)，使用瀏覽器就可以直接登錄簡單方便，同時(shí)利用北鯤云跨地區(qū)的GBPS級(jí)別專線，可以直接下載云端儲(chǔ)存的數(shù)據(jù)，同時(shí)為了保障數(shù)據(jù)的安全性，在傳輸?shù)倪^程中會(huì)增加多種安全保障措施，加密，審計(jì)，監(jiān)控，防火墻等等，最重要的是北鯤云超算平臺(tái)降低成本可達(dá)90%左右，讓科研在不增加資金的基礎(chǔ)上，能夠進(jìn)行更多的項(xiàng)目研究。
深圳北鯤云計(jì)算有限公司用了3年的時(shí)間完成了從誕生到蛻變的過程，深耕云計(jì)算領(lǐng)域，實(shí)際上在生命科學(xué)領(lǐng)域的云計(jì)算應(yīng)用就是把算法、程序、生物信息高科技技術(shù)相結(jié)合并且應(yīng)用于生產(chǎn)當(dāng)中，大數(shù)據(jù)云計(jì)算需要很多技術(shù)支持，也需要可靠的平臺(tái)。
任何事物的誕生和發(fā)展都需要一定的前提和條件，對(duì)社會(huì)發(fā)展，人類發(fā)展起著關(guān)鍵作用得生命科學(xué)在北鯤云超算平臺(tái)得協(xié)助下有了突破性的進(jìn)展。而這近幾年是開始，在未來越來越多生物信息還會(huì)被發(fā)掘，更多的數(shù)據(jù)被堆積，屆時(shí)云計(jì)算就是連接計(jì)算機(jī)和生物基因組數(shù)據(jù)的橋梁，有北鯤云超算平臺(tái)的協(xié)助可能計(jì)算只是一瞬間的事情，而北鯤云也在不斷地創(chuàng)新技術(shù)，為生命科學(xué)領(lǐng)域提供更強(qiáng)有力的助力，加快實(shí)驗(yàn)進(jìn)程成果轉(zhuǎn)化，更好地造福人類，推動(dòng)社會(huì)發(fā)展。
展開 北鯤云計(jì)算：為藥企研發(fā)的飛速發(fā)展提供助力
基于這些真實(shí)存在的問題，北鯤云研發(fā)團(tuán)隊(duì)專門研發(fā)了北鯤云計(jì)算平臺(tái)。來為用戶提供從數(shù)據(jù)、軟件到算力的全流程服務(wù)，打造專業(yè)一體化的生物信息、計(jì)算化學(xué)等科研環(huán)境。同時(shí)，為了提高工作效率北鯤云超算平臺(tái)還預(yù)裝了300+行業(yè)主流應(yīng)用軟件。無需手動(dòng)安裝開箱即用且兼容多種作業(yè)模式，省時(shí)省力。更值得一提的是，接入北鯤云資源后，由于硬件更新及時(shí)用戶能快速的獲取生物信息。由于北鯤云計(jì)算的先進(jìn)技術(shù)引領(lǐng)，那些傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)問題都將統(tǒng)統(tǒng)被解決。
目前，北鯤云計(jì)算平臺(tái)還在不斷創(chuàng)新技術(shù)，為生命科學(xué)領(lǐng)域提供更強(qiáng)有力的支持和幫助。加快實(shí)驗(yàn)進(jìn)程成果轉(zhuǎn)化，將來更好地造福人類，促進(jìn)生命科學(xué)不斷向前發(fā)展。
展開 北鯤云超算平臺(tái)如何成為就生命科學(xué)云計(jì)算領(lǐng)域先行者？
北鯤云超算平臺(tái)如何成為就生命科學(xué)云計(jì)算領(lǐng)域先行者？
盡管云計(jì)算在國內(nèi)已經(jīng)發(fā)展了十余年之久，但仍然是個(gè)相對(duì)新穎的事物。近幾年隨著互聯(lián)網(wǎng)大廠對(duì)于公有云的建設(shè)，以及“新基建”的提出，國內(nèi)云計(jì)算公司迅速發(fā)展，北鯤云超算平臺(tái)作為在云計(jì)算領(lǐng)域、國內(nèi)生命科學(xué)行業(yè)的SaaS應(yīng)用的先行者，北鯤云成立于歐洲硅谷—斯德哥爾摩Kista，致力于為全球生命科學(xué)行業(yè)提供基于云計(jì)算模式的商業(yè)解決方案。
如今，分子生物學(xué)根本離不開計(jì)算機(jī)的幫助。很多研究機(jī)構(gòu)都建立了專門的計(jì)算中心，處理過多的數(shù)據(jù)。然而，隨著越來越多的生物分子數(shù)據(jù)被解析，生物信息學(xué)專家不得不借用計(jì)算機(jī)行業(yè)的另一套策略，也就是云計(jì)算（或分布式計(jì)算）?；?em>云計(jì)算的系統(tǒng)不同于本地化的存儲(chǔ)和分析數(shù)據(jù)，它將強(qiáng)度很大的工作程序化地按需分派到成百上千的遠(yuǎn)程服務(wù)器上。當(dāng)然，云計(jì)算的另一個(gè)優(yōu)勢(shì)在于能夠幫助研究機(jī)構(gòu)避免更多的花費(fèi)。
作為Cloud-HPC的先行者北鯤云已經(jīng)成功服務(wù)中國數(shù)千家企業(yè)、研究所及高校。北鯤云現(xiàn)有業(yè)務(wù)和產(chǎn)品包括Cloud-HPC SaaS平臺(tái)、以及生命科學(xué)行業(yè)解決方案。北鯤云超算SaaS平臺(tái)主要為個(gè)人用戶提供算力服務(wù)，而鯤云超算行業(yè)解決方案是為高校及企業(yè)用戶量身定制的，針對(duì)企業(yè)不同的上云情況，為企業(yè)提供云上、混合云、以及私有云等模式。
北鯤云超算平臺(tái)除了能夠?yàn)橛脩籼峁┐罅康倪h(yuǎn)程服務(wù)器外，還可以為生命科學(xué)行業(yè)用戶提供基礎(chǔ)軟件，幫助用戶執(zhí)行復(fù)雜的計(jì)算任務(wù)，并在成千上萬臺(tái)服務(wù)器間進(jìn)行有效分配。并且能夠提供高速的每臺(tái)服務(wù)器和網(wǎng)絡(luò)間的基礎(chǔ)通信。
北鯤云計(jì)算的另一大優(yōu)勢(shì)在于操作的簡便性，至少是對(duì)熟悉計(jì)算機(jī)編程的研究人員來說?！爸灰c(diǎn)Java編程就足以在非常大的集群中運(yùn)行大規(guī)模的分析任務(wù)，即便不擅長使用命令行，研究人員同樣可以通過北鯤云超算平臺(tái)提供的圖形界面進(jìn)行作業(yè)。
展開 北鯤云告訴你足夠的存儲(chǔ)空間在高性能計(jì)算有多重要
對(duì)于很多有高性能計(jì)算需求的用戶來說，通常比較關(guān)注的是計(jì)算的硬件配置是否是最新的，因?yàn)檫@往往關(guān)系到計(jì)算效率。但性能計(jì)算與任何一項(xiàng)技術(shù)一樣，都需要分步驟完成，除了計(jì)算速度，在高性能完成一項(xiàng)計(jì)算任務(wù)后，所用到的存儲(chǔ)空間最終了決定這項(xiàng)任務(wù)是否能夠成功執(zhí)行。北鯤云計(jì)算小編就帶你一起來了解一下存儲(chǔ)的重要性。
隨著異構(gòu)計(jì)算越來越多的應(yīng)用，包括傳統(tǒng)高性能計(jì)算和新興的云計(jì)算都開始大規(guī)模的采用異構(gòu)計(jì)算方式，包括GPU、FPGA、ARM等諸多架構(gòu)芯片的出現(xiàn)，讓整個(gè)計(jì)算市場(chǎng)呈現(xiàn)出“百花齊放”的情形。
網(wǎng)絡(luò)層面上，北鯤云小編注意到，從每年兩屆的超算TOP500榜單的數(shù)據(jù)來看，100G網(wǎng)絡(luò)是以太網(wǎng)的“標(biāo)配”；而在注重傳輸效率和低延遲的InfiniBand網(wǎng)絡(luò)中，200G的HDR標(biāo)準(zhǔn)則成為主流。從這個(gè)角度來說，高性能計(jì)算的發(fā)展可謂是突飛猛進(jìn)，從計(jì)算到網(wǎng)絡(luò)的變化使得數(shù)據(jù)的處理和傳輸越發(fā)效率，在這樣飛速發(fā)展的狀態(tài)下，存儲(chǔ)空間就成為高性能計(jì)算發(fā)展中另一個(gè)不可忽視的重要環(huán)節(jié)。
存儲(chǔ)對(duì)于高性能計(jì)算有多重要？
以往在談到高性能計(jì)算的時(shí)候，我們更在意計(jì)算的速度，因?yàn)槟菚r(shí)候計(jì)算能力還有較大的提升空間；而如今，異構(gòu)計(jì)算的出現(xiàn)讓計(jì)算效率呈指數(shù)級(jí)提升，而高速網(wǎng)絡(luò)也讓這些計(jì)算成果讓數(shù)據(jù)本身能夠發(fā)揮更大的價(jià)值，在高性能計(jì)算主體升級(jí)后，作為高性能計(jì)算重要組成部分的存儲(chǔ)環(huán)節(jié)，如果沒有隨之升級(jí)，就會(huì)成為制約高性能計(jì)算發(fā)展瓶頸。
從上個(gè)世紀(jì)90年代提出的生物基因工程測(cè)序到最近大火出圈的AlphaFold2模型，無一不說明高性能計(jì)算在生命科學(xué)領(lǐng)域的成功應(yīng)用。無論是計(jì)算過程中出現(xiàn)的臨時(shí)數(shù)據(jù)，還是計(jì)算完成后的結(jié)果輸出，都是相當(dāng)龐大的數(shù)據(jù)。因此，如果存儲(chǔ)不足，也就意味著計(jì)算不得不中斷，當(dāng)然，如果沒有足夠的存儲(chǔ)空間，計(jì)算結(jié)果數(shù)據(jù)同樣不能順利地發(fā)揮其價(jià)值。
展開 