北鯤云告訴你足夠的存儲空間在高性能計(jì)算有多重要
對于很多有高性能計(jì)算需求的用戶來說,通常比較關(guān)注的是計(jì)算的硬件配置是否是最新的,因?yàn)檫@往往關(guān)系到計(jì)算效率。但性能計(jì)算與任何一項(xiàng)技術(shù)一樣,都需要分步驟完成,除了計(jì)算速度,在高性能完成一項(xiàng)計(jì)算任務(wù)后,所用到的存儲空間最終了決定這項(xiàng)任務(wù)是否能夠成功執(zhí)行。北鯤云計(jì)算小編就帶你一起來了解一下存儲的重要性。
隨著異構(gòu)計(jì)算越來越多的應(yīng)用,包括傳統(tǒng)高性能計(jì)算和新興的云計(jì)算都開始大規(guī)模的采用異構(gòu)計(jì)算方式,包括GPU、FPGA、ARM等諸多架構(gòu)芯片的出現(xiàn),讓整個計(jì)算市場呈現(xiàn)出“百花齊放”的情形。
網(wǎng)絡(luò)層面上,北鯤云小編注意到,從每年兩屆的超算TOP500榜單的數(shù)據(jù)來看,100G網(wǎng)絡(luò)是以太網(wǎng)的“標(biāo)配”;而在注重傳輸效率和低延遲的InfiniBand網(wǎng)絡(luò)中,200G的HDR標(biāo)準(zhǔn)則成為主流。從這個角度來說,高性能計(jì)算的發(fā)展可謂是突飛猛進(jìn),從計(jì)算到網(wǎng)絡(luò)的變化使得數(shù)據(jù)的處理和傳輸越發(fā)效率,在這樣飛速發(fā)展的狀態(tài)下,存儲空間就成為高性能計(jì)算發(fā)展中另一個不可忽視的重要環(huán)節(jié)。
存儲對于高性能計(jì)算有多重要?
以往在談到高性能計(jì)算的時候,我們更在意計(jì)算的速度,因?yàn)槟菚r候計(jì)算能力還有較大的提升空間;而如今,異構(gòu)計(jì)算的出現(xiàn)讓計(jì)算效率呈指數(shù)級提升,而高速網(wǎng)絡(luò)也讓這些計(jì)算成果讓數(shù)據(jù)本身能夠發(fā)揮更大的價值,在高性能計(jì)算主體升級后,作為高性能計(jì)算重要組成部分的存儲環(huán)節(jié),如果沒有隨之升級,就會成為制約高性能計(jì)算發(fā)展瓶頸。
從上個世紀(jì)90年代提出的生物基因工程測序到最近大火出圈的AlphaFold2模型,無一不說明高性能計(jì)算在生命科學(xué)領(lǐng)域的成功應(yīng)用。無論是計(jì)算過程中出現(xiàn)的臨時數(shù)據(jù),還是計(jì)算完成后的結(jié)果輸出,都是相當(dāng)龐大的數(shù)據(jù)。因此,如果存儲不足,也就意味著計(jì)算不得不中斷,當(dāng)然,如果沒有足夠的存儲空間,計(jì)算結(jié)果數(shù)據(jù)同樣不能順利地發(fā)揮其價值。
以國內(nèi)著名的基因公司——華大基因?yàn)槔@個為全球基因發(fā)展提供重大貢獻(xiàn)的公司擁有數(shù)百臺測序儀,由此每月產(chǎn)生的數(shù)據(jù)高達(dá)300TB-1PB。如此一來,僅僅是存儲這些數(shù)據(jù)就是一個讓人頭疼的問題,更何況還需要對數(shù)據(jù)進(jìn)行后續(xù)的分析和利用。這其中動用的存儲資源可謂是“天文數(shù)字”。此時,北鯤云超算平臺能夠?yàn)橛脩籼峁㏄B級別存儲空間的優(yōu)勢就凸顯出來了。
縱觀當(dāng)下的存儲市場,多種存儲協(xié)議的并存一直是困擾行業(yè)升級與迭代的難題。除了多協(xié)議共存之外,多協(xié)議互通也同樣是整個行業(yè)關(guān)心的問題。比如NAS就是常見的多協(xié)議互通的典型。而北鯤云采用的就是NAS轉(zhuǎn)存。
容量: 10PB HDD + 1PB SSD
并行文件系統(tǒng):帶寬20GB/s, IOPS: 280 萬,時延:0.2ms
單作業(yè)臨時高速存儲(按需):Enhanced SSD, 容量500G – 500TB, 單盤 4GB/s吞吐, RDMA over RoCE, 25Gbps網(wǎng)絡(luò)
對于普通用戶而言,這樣的存儲空間是足夠的,而且是免費(fèi)開放的。
對于傳統(tǒng)高性能計(jì)算應(yīng)用來說,無論是生物基因、高能物理還是流體力學(xué)、視頻處理等等多種科研應(yīng)用都會利用到海量數(shù)據(jù),而提升數(shù)據(jù)的存儲空間和利用率就能夠更好的提升高性能計(jì)算的發(fā)展。
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