ATOM
關(guān)注創(chuàng)建者：USim 創(chuàng)建時(shí)間：2019-05-25
ATOM的視頻教程
基于Abaqus-ATOM優(yōu)化模塊拓?fù)鋬?yōu)化控制臂實(shí)用仿真(附帶詳細(xì)cae模型)
（小提示：abaqus從6.11版本開(kāi)始，在Abaqus_CAE界面新增atom優(yōu)化模塊，標(biāo)志Abaqus開(kāi)始從分析向設(shè)計(jì)優(yōu)化進(jìn)軍）
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基于Abaqus-ATOM優(yōu)化模塊形貌優(yōu)化控制臂實(shí)用仿真（附帶詳細(xì)cae模型及inp文件）
本實(shí)例是基于Abaqus-ATOM優(yōu)化模塊對(duì)控制臂進(jìn)行形貌優(yōu)化實(shí)用仿真,本視頻包含全流程常規(guī)建模步驟涉及到分析步的設(shè)置,材料截面的設(shè)置,邊界載荷施加等,形貌優(yōu)化模塊涉及到應(yīng)力目標(biāo)和體積目標(biāo)的設(shè)置，脫模約束等,提交計(jì)算,結(jié)果查看等,附帶詳細(xì)涉及的模型,有需要的同學(xué)可自行下載查看。后面的步驟較為詳細(xì)，可以自行放慢視頻觀看學(xué)習(xí)，有問(wèn)題可以私聊咨詢，可以觀看視頻的同時(shí)對(duì)照模型自行建立。
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基于Abaqus-ATOM優(yōu)化模塊尺寸優(yōu)化控制臂實(shí)用仿真(附帶詳細(xì)cae模型文件)
本實(shí)例是基于Abaqus-ATOM優(yōu)化模塊對(duì)控制臂進(jìn)行尺寸優(yōu)化實(shí)用仿真,本期視頻所用的模型網(wǎng)格為殼單元,本視頻包含全流程常規(guī)建模步驟涉及到分析步的設(shè)置,材料截面的設(shè)置,邊界載荷施加等,尺寸優(yōu)化模塊涉及到應(yīng)變能目標(biāo)和體積目標(biāo)的設(shè)置，厚度尺寸的上下限約束等,提交計(jì)算,結(jié)果查看等,附帶詳細(xì)涉及的模型,有需要的同學(xué)可自行下載查看。
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ATOM的實(shí)例教程
1000 # 能量最小化參數(shù)，指數(shù)越大最小化程度越深
print "interstitial introduced, minimized: $N atoms, energy is $E"
fix 1 all nvt 100 100 100 drag 0.2 # nvt 系綜，原子數(shù)、體積和溫度保持不變;T=100K
timestep 0.005 # 步長(zhǎng) 0.005fs run 1000 # 運(yùn)行 1000 步
print "nvt performed, temperature up: $N atoms, total energy is $E"
fix 1 all nvt 100 0.0001 100 drag 0.2 # nvt 系綜，溫度由 100K 到 0.0001K
run 1000 # 運(yùn)行 1000 步
print "nvt performed, temperature down: $N atoms, total energy is $E" compute 3 all pe/atom # 計(jì)算每個(gè)原子的勢(shì)能
compute 4 all ke/atom # 計(jì)算每個(gè)原子的動(dòng)能
compute 5 all coord/atom 3.0 # 計(jì)算每個(gè)原子的近鄰原子數(shù)
dump 1 all custom 1 dump.atom id xs ys zs c_3 c_4 c_5 # 將信息寫入 dump.atom min_style sd
minimize 1.0e-12 1.0e-12 10000 10000 # 再次能量最小化
print "the final state: $N atoms, total energy is $E" # 打印信息
~
例二
boundary p s s # 邊界條件，拉伸方向
是周期性，其余是自由邊界；如果是薄膜拉伸則是兩個(gè)周期性
展開(kāi) roller
###刪除除軋輥之外的其他剩余原子
delete_atoms group mobile
##定義原子組的元素類型
#set group roller type 2
#set group mobile type 3
##定義原子質(zhì)量
mass 1 69 # C
##原子之間的相互作用勢(shì)
pair_style morse 9.0235
pair_coeff 1 1 0.3854 1.2718 2.8178
write_data roller.data
最后，我們，采用in文件對(duì)上述兩個(gè)原型進(jìn)行組合
##定義變量##
variable a equal 1.0 ##定義原子模型截?cái)喟霃?variable T_start equal 300
variable T_end equal 300
##模擬環(huán)境初始化##
units metal
atom_style atomic
boundary p p p
neigh_modify delay 0 every 1 check yes
##讀300k保溫后的原子模型
read_data NiCrCo.data(1) extra/atom/types 1 ##表示在Ni、Cr和Co原子的基礎(chǔ)上增加C原子
##軋輥原子模型的讀取
read_data roller.data add append offset 1 0 0 0 0 shift 0.0 0.0 -134
###定于原子質(zhì)量
mass 1 58.69 # Ni
mass 2 52
展開(kāi) [42] Ouyang X, Yang B, Deng J, et al.An effective pumping method for increasing atomic utilization in a compact cold atom clock[J].Chinese Physics B, 2021, 30(8): 083202.
[43] Ouyang X, Yang B, Hu Q, et al.Distortion of Rabi oscillations in a compact cold-atom clock[J].Physical Review A, 2021, 103: 043118.
[44] Esnault F X, Rossetto N, Holleville D, et al.HORACE: a compact cold atom clock for Galileo[J].Advances in Space Research, 2011, 47(5): 854-858.
[45] Pelle B, Desruelle B, Szmuk R, et al.Cold-atom-based commercial microwave clock at the 10-15 level[C]//Proceedings of 2018 IEEE International Frequency Control Symposium(IFCS).IEEE, 2018: 1-5.
展開(kāi) lost ignore
dump 1 all atom 1000 gp_tension.lammpstrj
run 10000
模擬最終結(jié)果如下圖所示，本例比較簡(jiǎn)單，沒(méi)有加入應(yīng)力應(yīng)變的統(tǒng)計(jì)，如要輸出應(yīng)力和應(yīng)變，可用fix或者thermo語(yǔ)句輸出pxx、pyy、pzz三個(gè)方向上的應(yīng)力。
, atom= 547
Step= 9, Dmax= 4.3e-02 nm, Epot= -4.21615e+05 Fmax= 2.83858e+04, atom= 547
Step= 11, Dmax= 2.6e-02 nm, Epot= -4.26495e+05 Fmax= 6.89298e+03, atom= 547
Step= 12, Dmax= 3.1e-02 nm, Epot= -4.27186e+05 Fmax= 3.75623e+04, atom= 1785
Step= 13, Dmax= 3.7e-02 nm, Epot= -4.33871e+05 Fmax= 1.81256e+04, atom= 1785
Step= 15, Dmax= 2.2e-02 nm, Epot= -4.35813e+05 Fmax= 1.54546e+04, atom= 1785
Step= 16, Dmax= 2.7e-02 nm, Epot= -4.37056e+05 Fmax= 2.45185e+04, atom= 1785
利用如下命令檢查是否有效的能量最小化：
echo 10 0 | gmx energy -f em.edr -o potential.xvg
利用xmgrace打開(kāi)potential.xvg文件，結(jié)果如如下所示：
體系勢(shì)能隨時(shí)間變化曲線
07
NVT平衡
NVT系綜(粒子數(shù), 體積和溫度都是恒定的)系綜也被稱為等溫等容系綜或正則系綜。
展開(kāi) 
ATOM的相關(guān)專題、標(biāo)簽、搜索
ATOM的最新內(nèi)容
激光空間相干性調(diào)控 | 超表面全息偽影抑制的新策略2個(gè)月前
超表面全息相干偽影的產(chǎn)生主要源于三個(gè)核心因素，具體如下：
?納米單元的近場(chǎng)耦合串?dāng)_
超表面由數(shù)萬(wàn)計(jì)的納米柱（超原子，meta-atoms）構(gòu)成，設(shè)計(jì)過(guò)程中通常假設(shè)單個(gè)納米柱獨(dú)立工作，但實(shí)際應(yīng)用中，納米柱間距極小，會(huì)通過(guò)近場(chǎng)耦合產(chǎn)生“串?dāng)_”現(xiàn)象，導(dǎo)致納米柱實(shí)際光學(xué)相位響應(yīng)偏離預(yù)設(shè)設(shè)計(jì)值，進(jìn)而引發(fā)偽影。
顯示平均應(yīng)變對(duì)金屬疲勞壽命影響的Haigh圖（左）和Wohler曲線（右）
橡膠材料與金屬材料有許多不同之處
1.在原子尺度上
At the atomic scale
橡膠由長(zhǎng)鏈分子組成，這些分子經(jīng)歷恒定的熱運(yùn)動(dòng)，同時(shí)以永久的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)相互連接。這種結(jié)構(gòu)允許發(fā)生大的彈性/可逆應(yīng)變。
DPM|03Injection設(shè)置9個(gè)月前
, pressureswirl atomizer, air-blast-atomizer, flat-fanatomizer, effervescent-atomizer, file, condensate
Particle Types包括：Massless, Inert, Droplet, Combusting, Multicomponent
湍流設(shè)置
Eleven
本文復(fù)現(xiàn)一篇題為“Anapole Meta-Atoms: Nonradiating Electric and Magnetic Sources”的PRL [1]。復(fù)現(xiàn)選擇使用和文中相同的軟件CST MICROWAVE STUDIO。首先進(jìn)行簡(jiǎn)單的背景介紹。
經(jīng)典非輻射電磁源是否存在？一直是令人困惑的問(wèn)題。
工具和助力創(chuàng)新</strong></p><p>Fatma Kocer 博士 I Altair 數(shù)據(jù)科學(xué)工程副總裁</p><p>Viji Krishnamurthy 博士 I 甲骨文云基礎(chǔ)設(shè)施 (OCI) 生成 AI 解決方案副總裁</p><p>Melzak Marques da Silva I 福特汽車公司 VE NVH、機(jī)器學(xué)習(xí)與優(yōu)化高級(jí)專家</p><p>Duann Scott I Bits to Atoms
鑒于每個(gè)超元胞（meta-atom）都被相鄰的超元胞所包圍，因此矩陣分析并非針對(duì)單個(gè)孤立的超元胞進(jìn)行，而是基于周期性重復(fù)的超元胞進(jìn)行分析。這種周期性重復(fù)形成了一個(gè)亞波長(zhǎng)光柵，其中超元胞作為周期單元用于分析。
3.圓桌對(duì)話-工程 2030：AI 將如何重塑團(tuán)隊(duì)、工具和助力創(chuàng)新
Fatma Kocer 博士 I Altair 數(shù)據(jù)科學(xué)工程副總裁
Viji Krishnamurthy 博士 I 甲骨文云基礎(chǔ)設(shè)施 (OCI) 生成 AI 解決方案副總裁
Melzak Marques da Silva I 福特汽車公司 VE NVH、機(jī)器學(xué)習(xí)與優(yōu)化高級(jí)專家
Duann Scott I Bits to Atoms
RESP電荷方法，即Kollman等人在其開(kāi)創(chuàng)性論文《A well-behaved electrostatic potential based method using charge restraints for deriving atomic charges: the RESP model》中提出的技術(shù)，是當(dāng)前最適合用于柔性小分子模擬的電荷模型。
在GaussView菜單欄中點(diǎn)“select All atoms”按鈕(見(jiàn)圖2箭頭指向的選項(xiàng)），選中所有原子。
進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算時(shí)選擇NVT系綜，溫度控制選擇NHL，求解牛頓運(yùn)動(dòng)方程應(yīng)用Velocity Verlet 算法，靜電力描述選擇Ewald 方法，范德華作用力求解選擇Atom-based 方法，截?cái)喟霃綖?.5??？偰M時(shí)間為1500 ps，每一步驟時(shí)間為1fs，總的模擬步驟為1500000。
