CADD蛋白結構分析、虛擬篩選、分子對接（蛋白-蛋白、蛋白-多肽） 
第五天下午 構效關系分析 1. 3D-QSAR模型構建（Sybyl軟件）1.1 小分子構建1.2 創建小分子數據庫1.3 小分子加電荷及能量優化1.4 分子活性構象確定及疊合1.5 創建3D-QSAR模型1.6 CoMFA和CoMSIA模型構建1.7 測試集驗證模型1.8 模型參數分析1.9 模型等勢圖分析1.10 3D-QSAR模型指導藥物設計
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。_4485 ??? 3年前
汽車結構膠仿真模型MAT_169材料卡片的制作 
內聚力模型通過定義內聚力與裂紋張開量之間的關系，能夠合理反映膠層失效界面附近的強度、韌度等物理屬性。MAT_169（MAT_ARUP_ADHESIVE）是仿真分析軟件中提供的一種內聚力模型，專門用于模擬結構膠的力學性能。該模型將膠層簡化為一系列的法向和切向彈簧，通過定義材料參數來描述膠層的力學行為。
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國高材高分子材料產業創新中心 ??? 1年前
這種部分微觀結構的ABAQUS有限元模型怎么建立？
是分別創建宏觀和微觀的部分，然后裝配到一起嗎，那怎么讓它們正確的連接到一起，過渡的網格怎么畫呢？
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嘩眾取寵 ??? 1年前
基于CP2K的沸石吸附小分子的結構優化 
A 3 (2015), 12890 報道了高 Si/Al 比 heulandite (HEU) 型沸石的合成，并以全硅 HEU 作為近似模型，探討其對有毒甲苯分子的吸附及結構響應。
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320科技工作室 ??? 9月前
基于GROMACS的小分子自組裝分子動力學模擬 
初始模型構建首先利用Packmol構建匹格列酮四聚體模型，盒子大小為3*3*3，packmol輸入文件如圖1所示： 圖1 Packmol 輸入文件所構建的匹格列酮四聚體初始模型結構如圖2所示： 圖2 匹格列酮四聚體初始模型結構首先進行能量最小化：gmx grompp -f em.mdp -c mix.gro
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320科技工作室 ??? 17天前
高分子材料的流變特性簡介 
而高分子熔體或溶液的彈性，或者處于黏流態下的高分 子的彈性，其發生總是伴隨不可逆的黏性流動，也因此稱之為黏彈性；其原理與高分子纏結形成的不完善的網絡結構有關，這種網絡也不同于交聯橡膠網絡。 所謂線性黏彈性，是指高分子在小變形下的流變行為。比如，用旋轉流變儀測試高分子的動態黏彈性（交變的 應力、應變），就是測試其在小振幅、小形變下的線性黏彈性。
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ACMT協會 ??? 2年前
Gaussian計算幾類典型小分子有機化合物鍵解離能 
溶劑的多樣性：有機分子可能在多種溶劑中表現出不同的反應性，因此，對于不同溶劑環境下的計算，需要采取不同的溶劑模型和方法，而這些模型的選擇和調優本身也需要大量的經驗和試探。3.電子結構的復雜性對于某些有機化合物，特別是那些含有共振結構、過渡態或者自由基中間體的分子，其電子結構非常復雜，計算起來具有較高的挑戰性。
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320科技工作室 ??? 12月前
腐蝕介質擴散行為的分子動力學模擬 
模擬體系由三層結構組成:第一層為 Fe(001)面；第二層為包含80個緩蝕劑分子和1個腐蝕介質粒子的無定形組織結構；第三層是厚度為 2nm的真空層。如圖為本文模擬所需的計算模型： 模型結構優化使用Forcite 模塊對上述模型分別進行結構優化，使其達到最佳的模型結構和穩定的能量體系。
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320科技工作室 ??? 1年前
切向電磁力對電動車動力總成振動噪聲的影響分析 
3 振動特性分析利用ANSYS有限元軟件建立該電機三維結構的有限元模型，再以時域瞬態電磁場分析得到的穩態電磁力作為激勵，進行電機結構的響應分析，得到在電磁力激勵下電機的振動特性。
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聲學工程師小吳 ??? 2年前
gaussian-cp2k-lammps-reaxff 專題 
4.2 掌握lammps計算導熱系數的幾種方法4.3 碳納米管等導熱系數的模擬計算 第三天 上午LAMMPS進階（多成分體系模擬專題） 5 LAMMPS進階實例操作，理解模擬對象的物理意義——從簡單例子走向文獻模型，舉一反三提高學習效率: 實例操作： 5.1 金屬、合金、高熵合金的摩擦模擬 5.2 材料切削模擬5.3 夾層結構
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hdpky ??? 3年前
COMSOL鋰電池技術仿真與應用(九)鋰電池電-熱-力-相全耦合模型搭建與應用 
熱力耦合 熱-力耦合模型基于電化學產熱反應而建立的耦合模型，在固體傳熱框架上耦合固體力學接口，主要用于模擬電池的內部由于溫度變化引起的應力變化。當固體材料的溫度上升時，其結構體積會因此而增加，這種現象稱為熱膨脹。受熱使得材料的動能增加，從而引發這一過程。固體分子通常是緊密排列的，因此固體具有一定的結構形狀。隨著溫度的上升，分子開始以更快的速度振動，并相互推擠。
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學時習 ??? 2年前
基于LAMMPS模擬巖石表面潤濕性 
圖2 石英單晶胞結構對于納米水滴，首先構建單個水分子并進行幾何優化，再建立密度為1g/cm3的含1000個水分子的立方體盒子，測量納米水滴質心，并將其置于表面模型之上構建初始模型，如圖3所示。
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320科技工作室 ??? 1年前
workbench瞬態結構中該怎么用子模型技術？
瞬態結構中用類似靜態結構分析中的子模型，在切割邊界位移映射的時間分別用了主模型生成結果的時間和主模型載荷步對應的時間，但都不行
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小K～ ??? 3年前
基于MS對界面聚合分子動力學模擬：哌嗪 /芳酰胺纖維 
圖1 不同物質的分子結構模型2、構建Amorphous cell模型利用Materials Studio (MS)中的Amorphous cell模塊，在COMMPASSII力場條件下構建兩個模型：（1）模型包含10個PIP分子和320個水分子；（2）10個PIP分子、40個TBP分子、1個含2重復單元PPTA。
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320科技工作室 ??? 1年前
基于GROMACS的氯化鈉氣液界面分子動力學模擬 
初始模型的構建 在本案例中，我們模擬對象為氯化鈉水溶液-真空體系，水分子采用spce水模型。
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320科技工作室 ??? 4月前
基于GROMACS的油水自發相分離分子動力學模擬 
正十六烷的結構可以用Gview或者Materials studio進行構建，如圖1所示： 圖1 正十六烷的分子結構用Packmol軟件構建800個水分子和50個正十六烷分子在5.0*5.0*5.0nm盒子中的均勻混合體系，Packmol輸入文件如圖2所示： 圖2 Packmol 輸入文件建好的初始模型如圖3所示： 圖
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320科技工作室 ??? 1年前
ls-prepost如何查看內部節點/切面上節點的速度曲線？
如何采用ls-prepost查看模型內部某個節點的速度、加速度曲線，比如用SPlane獲得某個切面上的速度云圖，但怎么通過history獲得該切面上節點的時程曲線，由于不知道切面上的節點編號也無法直接輸入編號獲取時程曲線
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haimu ??? 2年前
基于MS的forcite模塊進行抑制劑浮選煤泥分子動力學模擬 
本文主要講述抑制劑和煤泥及其雜質相互作用的分子動力學模擬。首先通過Visualizer對抑制劑糊精進行模型搭建，由于糊精為淀粉加熱分解的中間產物，故分子結構與淀粉分子結構一致，均由葡萄糖分子聚合而成。因此，模擬糊精結構為葡萄糖的聚合物。
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320科技工作室 ??? 2年前
切削液廢水的科學處理方法解析 
化學處理是降解切削液廢水有機污染物、降低 COD（化學需氧量）的核心環節，通過化學反應打破污染物分子結構，實現水質凈化。破乳處理是關鍵步驟，切削液廢水多為油水分散的乳化液，需添加破乳劑（如無機鹽類、有機高分子類），破壞乳液的穩定性，使油水快速分離，提升后續隔油、氣浮的處理效率。
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東莞市杉山潤滑油科技有限公司 ??? 2月前
細胞工程：免疫細胞趨化運動模式及分子機理 
相反，當分子不是向后平流(而只是擴散)時，內部必須沒有向前循環，因為細胞前端的源會產生外部的逆向流動。因此，這里的游泳模型暗示了肌動蛋白結合的內部順行循環的存在。為了進一步支持模型的相關性和一致性，通過在細胞前端進行方形FRAP實驗來驗證這兩個特性。肌動蛋白結合蛋白在細胞外進行逆行彈道運動，在細胞內進行順行囊泡運輸，而非肌動蛋白結合蛋白在細胞表面進行擴散而不進行內部循環。
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化工707 ??? 3年前
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