AWS ParallelCluster
關注創建者：匿名 創建時間：2026-01-04
AWS ParallelCluster的實例教程
?Current latest version of AWS ParallelCluster is 3.3.0
-We have tested Linux node on-premises with CentOS 7 and RHEL 8, and both of them can only get latest AWS ParallelCluster as version 3.1.4.
?We have installed AWS ParallelCluster on EC2 instance with Amazon Linux 2 as the operating system. In this environment the latest AWS ParallelCluster installed is 3.3.0.
-This guide is based on AWS ParallelCluster 3.3.0, therefore use Amazon Linux 2 to install AWS ParallelCluster is strongly recommended.
(1)Create EC2 instance for installing AWS ParallelCluster (Create VPC)
?Log in AWS Console --> Search VPC --> Create VPC
?Set Name tag auto-generation as "amazonlinux"
?Number of Availability Zones (AZs) set to 1. Number of private subnets set to 0.
展開 三．AWS ParallelCluster
4. Workflow to create Linux cluster on AWS
(4) Modify AWS ParallelCluster configuration file for creating Linux cluster
?Go to console of EC2 instance: amazonlinux
?Edit cluster configuration file
-Enter: nano -w ~/cluster-config.yaml
?Please modify the yaml file as the figure below.
展開 三．AWS ParallelCluster
4. 其他注意事項 (Additional Notes)
1.請勿直接刪除或變更由Moldex3D AWS-Connect 透過AWS CloudFormation模板方式布署的任何資源. 當您想要調整計算節點的數量與EC2實例類型時, 請透過MDXAWSDeploymentConsole.exe來完成.
2.頭節點不參與計算也不會出現在Node列表中, 這也是我們建議的架構.
3.當您移除或重新安裝Moldex3D AWS-Connect 2023之后, 授權mlc檔與之前成功布署Cluster的配置文件仍會備份在%Appdata%\CoreTechSystem\Moldex3D AWS-Connect 2023\backup目錄下. 若有需要, 您可自行復制到C:\Moldex3D\AWS-Connect 2023\Config目錄下.
4.Computing Manager顯示的Max.Task數量即為(NMaxComputeNode * 該種類EC2對應的vCPU數量)
例如配置文件中的EC2InstanceType_ComputeNode是m5a.4xlarge且HyperThread關閉, 則每臺計算節點的vCPU是8. 而NMaxComputeNode=4, 因此Max. Tasks即為32.
5.當您提交的工作所需資源大于常駐計算節點數量時, 計算節點會被動態啟動, 最多有總數為NMaxComputeNode的計算節點存在. 當被動態啟動的計算節點完成Moldex3D安裝時, 您可在Moldex3D Job Scheduler觀察它的狀態. 它的名稱固定是ComputeNode_ASG, AutoScaling屬性為Dynamic (見下圖).
展開 北鯤云平臺和AWS ParallelCluster的對比
AWS ParallelCluster
CLOUDAM Platform
數據安全
數據在自己云賬號下
不保留用戶數據，數據落地都在用戶自己云賬號下，無需擔心數據安全
成本
EC2, 網絡，存儲都需要收費
僅收取EC2按量使用費用
功能
僅提供基礎計算能力，并且都是基于命令行操作
除了基礎計算能力還提供了一系列可視化功能例如文件傳輸，鏡像中心，數據集，團隊協作，配額管理，操作審計，賬單報表，安全管理，系統管理等功能，并提供完善的技術支持服務
易用性
IT人員需要手動配置和維護集群，需要單獨安裝軟件和配置使用環境，僅支持命令行操作
配置簡單，IT人員無需手動配置集群，無需安裝計算軟件，提供命令行提交，可視化作業提交和圖形界面提交等多種作業提交方式
結論
在這篇博文中，我們演示了如何使用北鯤云平臺在AWS來提交基因分析任務。快速訪問北鯤云用戶手冊并親自試用演示。有關北鯤云的更多信息，請查看主頁和文檔。
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1.請勿直接刪除或變更由Moldex3D AWS-Connect 透過AWS CloudFormation模板方式布署的任何資源.
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-This guide is based on AWS ParallelCluster 3.3.0, therefore use Amazon Linux 2 to install AWS ParallelCluster is strongly recommended.
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數據在自己云賬號下
不保留用戶數據，數據落地都在用戶自己云賬號下，無需擔心數據安全
