結(jié)構(gòu)生物學(xué)的案例
結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)分子對接大師班--帶案例 ￥10
1-1 概述
2-1-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能組成
2-2-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能肽鍵和相互作用
2-3-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能α螺旋和β片
2-4-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能肽鍵和Ramachandran圖
2-5-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能結(jié)合能
2-6-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能蛋白質(zhì)如何折疊
2-7-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能結(jié)構(gòu)水平
2-8-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能功能水平
2-9-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能酶動力學(xué)基本概念
3-1-可用的蛋白質(zhì)制備結(jié)構(gòu)
3-2-制備的蛋白質(zhì)制備結(jié)構(gòu)
3-3-蛋白質(zhì)制備同源性建模
3-4-蛋白制備穿線法
3-5-蛋白質(zhì)制備α折疊
3-6-PDB結(jié)構(gòu)的6-蛋白制備選擇
3-7-蛋白質(zhì)制劑缺失殘留問題
3-8-蛋白質(zhì)制備結(jié)構(gòu)驗證
4-1-分子對接算法
4-2-分子對接類型
4-3-分子對接模式
4-4-分子對接軟件
4-5-分子對接自動對接VINA高分子制劑
4-6-分子對接自動對接VINA配體制備
4-7-分子對接自動對接VINA網(wǎng)格制備
5-1-自動對接VINA腳本
5-2-自動對接VINA分析-I
5-3-Autodock VINA分析- II
6-1-虛擬篩選為什么它很重要
6-2-虛擬篩選簡要信息
6-3-虛擬篩選大分子和配體的制備
6-4-虛擬篩選網(wǎng)格準(zhǔn)備
6-5-虛擬篩選ADMET分析
6-6-虛擬篩查Lipinksi五規(guī)則
6-7-虛擬篩查結(jié)果分析
6-8-虛擬篩選腳本
7-1-故障診斷問題
7-2-出版質(zhì)量圖制備
展開 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會細(xì)胞工程與轉(zhuǎn)基因生物分會/陜西省細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會2018年年會在陜西師范大學(xué)成功召開
在學(xué)會第四屆理事會第一次會議上，邊惠潔理事長對新一屆理事會的工作進(jìn)行了部署，向積極參加科普活動的各單位頒發(fā)了“陜西省細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會科普活動優(yōu)秀獎”獎金和榮譽證書，并主持討論通過了成立學(xué)會第一個專業(yè)委員會的議題。崔洪勇副秘書長進(jìn)行了中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會2018年“諾貝爾獎解讀”活動的動員。
會議期間，中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會細(xì)胞工程與轉(zhuǎn)基因生物分會召開了第三屆委員會第三次會議。分會會長、空軍軍醫(yī)大學(xué)邊惠潔教授向委員們匯報了近年來分會的工作和取得的成績，傳達(dá)了中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會對分會工作的要求，向積極參加分會活動的各單位頒發(fā)了“科普活動優(yōu)秀獎”獎金和榮譽證書。分會秘書長孔令敏副教授傳達(dá)了中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會的科普工作精神和要求。
資料來源：中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會官網(wǎng)，11月5日
展開 發(fā)現(xiàn)G蛋白偶聯(lián)受體蛋白新的別構(gòu)位點
因此研究和理解GPCRs的結(jié)構(gòu)與功能，對當(dāng)今藥物設(shè)計至關(guān)重要。
一個蛋白質(zhì)的特有生理功能與活性，是由它特定的三維結(jié)構(gòu)決定的。因此從蛋白三維結(jié)構(gòu)來理解GPCRs的功能是當(dāng)今藥物設(shè)計中必不可少的一個環(huán)節(jié)。隨著結(jié)構(gòu)生物學(xué)技術(shù)突飛猛進(jìn)的發(fā)展，截止到2018年7月，已經(jīng)了50多個不同種類的GPCRs結(jié)構(gòu)被解析出來。這其中涵蓋了GPCRs 的A,B,C和F亞家族。在這些解析的結(jié)構(gòu)當(dāng)中，人們發(fā)現(xiàn)藥物小分子可以結(jié)合在GPCRs的不同部位，這其中包括傳統(tǒng)的正構(gòu)位點(orthosteric site)和多個別構(gòu)位點(allosteric site)，諸如：膜外ECL2 loop區(qū)域，第一、二跨膜螺旋區(qū)域，第二、三跨膜螺旋區(qū)域，第三、四跨膜螺旋區(qū)域，第四、五跨膜螺旋區(qū)域、膜內(nèi)G蛋白結(jié)合區(qū)域。不同的小分子結(jié)合位點所處的化學(xué)環(huán)境有所不同，這樣則給當(dāng)代藥物發(fā)現(xiàn)與設(shè)計提供了新的機遇。
盡管傳統(tǒng)結(jié)構(gòu)生物學(xué)對人們理解蛋白的生理功能提供了不可或缺的方法和信息，但它也有自己的缺陷。比如傳統(tǒng)結(jié)構(gòu)生物學(xué)不能告訴人們?yōu)槭裁碐PCRs結(jié)合激動劑(agonist)之后可以被激活，而結(jié)合拮抗劑(antagonist)的時候為什么信號通路會被阻斷。此外，單個GPCRs晶體結(jié)構(gòu)也不能告訴人們GPCRs具體的激活動態(tài)過程是怎樣的。與之相比，計算結(jié)構(gòu)生物學(xué)則很好的彌補了傳統(tǒng)結(jié)構(gòu)生物學(xué)的不足6,7。比如：通過在計算機上構(gòu)建磷脂雙層和溶劑模型，可以模擬GPCRs在細(xì)胞生理環(huán)境下的動態(tài)過程（圖一）。
圖一，分子動力學(xué)模擬GPCR膜蛋白體系。
本文工作通過計算生物學(xué)中分子動力學(xué)與系統(tǒng)分析的方法，找到GPCRs A家族的一個新的別構(gòu)位點。首先作者把天然激動劑乙酰膽堿（ACh）分子放在乙酰膽堿受體 (muscarinic acetylcholine receptors)膜外部分，然后實施長時間尺度的全原子分子動力學(xué)模擬。
展開 生物信息學(xué)與進(jìn)化分析及其生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用
生物信息學(xué)與進(jìn)化分析及其生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用2.pdf
生物信息學(xué)與進(jìn)化分析及其生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用1.pdf
CPCI會議推薦---計算生物學(xué)和生物醫(yī)學(xué)國際學(xué)術(shù)會議（CBBS 2023）
計算生物學(xué)和生物醫(yī)學(xué)國際學(xué)術(shù)會議（CBBS 2023）
會議官網(wǎng)：http://www.iccbbs.org/
會議時間：2023年8月12-14日
會議地點：湖北武漢
提交檢索：CPCI (WoS), CNKI, Google Scholar, WanFang Data, etc.
會議介紹
隨著計算機技術(shù)的發(fā)展，生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)和計算生物學(xué)越來越受到學(xué)術(shù)界和工業(yè)專家的關(guān)注。作為一個跨學(xué)科的學(xué)術(shù)會議，CBBS 2023聚焦生物醫(yī)學(xué)的熱門研究領(lǐng)域，如計算生物學(xué)，計算生物學(xué), 生物醫(yī)學(xué)機器人等， 旨在為計算生物學(xué)和生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的學(xué)者和行業(yè)專家提供一個專業(yè)的國際交流平臺，促進(jìn)行業(yè)內(nèi)，行業(yè)間的學(xué)術(shù)交流，共同探討解決新問題，迎接新挑戰(zhàn)，進(jìn)而激發(fā)新的想法和思路，提供更多的合作機會。
出版與檢索
CBBS 2023 錄用并展示的文章將由Atlantis Press出版, 并提交至CPCI (WoS), CNKI, Google Scholar, WanFang Data等數(shù)據(jù)庫檢索。
組委會成員
大會主席-陳銘教授，浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授，內(nèi)蒙古民族大學(xué)生命科學(xué)與食品學(xué)院特聘院長，有豐富的期刊編輯、審稿和會議經(jīng)驗。
大會主席-Y-h. Taguchi教授，來自日本東京中央大學(xué)，主要研究方向為主成分分析、基于張量分解的特征提取及其在生物信息學(xué)中的應(yīng)用。
投稿主題
計算生物學(xué)算法 / 人工關(guān)節(jié)和器官 / 生物電子學(xué) / 生物物理學(xué) / 計算醫(yī)學(xué)……
投稿方式
作者請將全文或摘要通過郵箱投稿至info@iccbbs.org，并備注投稿人姓名，職稱，單位，常用電話/微信，或其他需求。
要求為全英文原創(chuàng)稿件，須嚴(yán)格按照模板排版后提交。摘要投稿僅做交流展示，不提供出版。
如有其他問題請致電13163283137
展開 天津大學(xué)仰大勇團隊綜述：生物功能電紡納米材料——從拓?fù)?em>結(jié)構(gòu)設(shè)計到生物應(yīng)用
【引言】
生物功能高分子材料廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域，其中靜電紡絲（縮寫為“e-spin”）是制備各種生物功能高分子材料最簡單、最直接的技術(shù)。與傳統(tǒng)的紡紗技術(shù)（如溶液紡絲和熔融紡絲）相比，e-spin使用靜電力來加工聚合物溶液并生產(chǎn)微米級或納米級的材料。e-spin不僅可用于制造納米纖維，還可制造具有多種拓?fù)?em>結(jié)構(gòu)的納米材料。超過一半的e-spin材料應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域，包括組織工程、傷口愈合、藥物/生物活性分子遞送、診斷和仿生學(xué)。本文重點介紹了電紡生物功能納米材料的拓?fù)?em>結(jié)構(gòu)設(shè)計和生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用的最新進(jìn)展。
【成果簡介】
靜電紡絲是一種高度通用的技術(shù)，可將聚合物或相關(guān)材料加工成直徑范圍從微米到納米級的纖維材料。早期電紡材料主要是聚合物，形態(tài)主要是纖維。在過去的二十年中，科研人員在選材和形貌方面都取得了很多進(jìn)展，制備了包括金屬、金屬氧化物、碳材料和有機/無機復(fù)合材料的靜電紡絲，以及制造了珠、管以及多級結(jié)構(gòu)等纖維之外的更多形態(tài)。此外，還探索了多種有前景的應(yīng)用，主要包括生物、能源、催化、環(huán)境和機械增強，其中一半以上專注于生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用。比如，設(shè)計電紡納米材料以模擬細(xì)胞外基質(zhì)的結(jié)構(gòu)特征，用于細(xì)胞生長和營養(yǎng)物轉(zhuǎn)運；封裝或附著有生物活性分子和藥物的電紡納米材料可用于遞送分子；由于高孔隙率和大比表面積，它們還可以用于醫(yī)學(xué)診斷以增強特異性、靈敏度和信號傳導(dǎo)能力。此外，電紡納米材料可以組裝成各種有趣的仿生結(jié)構(gòu)。所有這些特點使得靜電紡絲成為制造生物功能納米材料的有力工具，用于涉及人類健康的一系列生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用，主要包括組織工程、傷口愈合、藥物/生物活性分子遞送、診斷和仿生學(xué)。
展開 生物電磁學(xué)軟件選擇
我選FEMLAB
分子生物學(xué)實驗室設(shè)計方案
分子生物學(xué)實驗室廣泛應(yīng)用于大專院校教學(xué)、科研機構(gòu)以及醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)的科學(xué)研究。在進(jìn)行植物組織培養(yǎng)之前，需要全面了解所需的基本設(shè)備條件，以便靈活利用現(xiàn)有房屋或者進(jìn)行新建、改建實驗室。實驗室的規(guī)模應(yīng)根據(jù)工作目的和規(guī)模確定，避免規(guī)模太小影響效率，尤其是對于工廠化生產(chǎn)的目標(biāo)而言。分子生物學(xué)實驗室的設(shè)計和規(guī)劃必須科學(xué)合理。中壹聯(lián)實驗室裝修公司小編將詳細(xì)闡述分子生物學(xué)實驗室設(shè)計的原則、各功能區(qū)布局及設(shè)備配置。
一、分子生物學(xué)實驗室設(shè)計原則
1.無菌操作保障：植物組織培養(yǎng)及大多數(shù)分子生物學(xué)實驗需要在嚴(yán)格的無菌條件下進(jìn)行。實驗室設(shè)計的首要原則是確保無菌操作，從而防止污染。無菌操作不僅包括設(shè)備和器材的無菌，還涉及到操作環(huán)境的潔凈度。因此，在分子生物學(xué)實驗室設(shè)計時各區(qū)域的壓力控制和氣流組織形式必須科學(xué)合理，以防止交叉污染和氣溶膠傳播。
2.提高工作便利性：對分子生物學(xué)實驗室設(shè)計中實驗室布局要最大限度地提高工作的便利性和效率。合理的對空間進(jìn)行利用和設(shè)備安排能減少實驗操作中的時間浪費和工作混亂，提高實驗的成功率和重復(fù)性。
3.資源節(jié)約與環(huán)境控制：植物組織培養(yǎng)需要人工控制溫度、光照、濕度等培養(yǎng)條件。在分子生物學(xué)實驗室建設(shè)時就應(yīng)該要充分考慮到實驗室的節(jié)能環(huán)保，確保設(shè)備高效運作的同時，節(jié)省能源和資源。
二、分子生物學(xué)實驗室功能區(qū)布局
分子生物學(xué)實驗室由可以分為化學(xué)實驗室（準(zhǔn)備室）、洗滌滅菌室、無菌操作室（接種室）、培養(yǎng)室、細(xì)胞學(xué)實驗室以及PCR實驗室等多個功能區(qū)。以下中壹聯(lián)實驗室裝修公司小編將詳細(xì)介紹每個功能區(qū)的具體設(shè)計和設(shè)備配置。
1.化學(xué)實驗室（準(zhǔn)備室）
化學(xué)實驗室主要負(fù)責(zé)藥品的貯備、稱量、溶解、配制和培養(yǎng)基的分裝等工作。
展開 北鯤云超算平臺在AlphaFold2對蛋白質(zhì)研究中有何作用？
受人工智能和深度學(xué)習(xí)技術(shù)發(fā)展較快等因素影響，結(jié)構(gòu)生物學(xué)數(shù)據(jù)的研究也開始迎來了嶄新的階段，針對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測也出現(xiàn)了一些新的方法，并獲得了突破性進(jìn)展。目前，最為前沿的技術(shù)當(dāng)屬AlphaFold2以及RoseTTAFold，這些技術(shù)對行業(yè)的影響可謂是顛覆性的。特別是國內(nèi)已經(jīng)有北鯤云這類的企業(yè)和一些高校以及科研機構(gòu)進(jìn)行合作，在北鯤云超算平臺的支持下，AlphaFold2的優(yōu)越性會更好地發(fā)揮出來，甚至有很多人士認(rèn)為，實驗結(jié)構(gòu)生物學(xué)會逐漸地成為過去式，最終退出歷史舞臺。
問題來了，AlphaFold2的運行原理是怎樣的，它的重要性又具體體現(xiàn)在哪些方面呢？要了解這些問題的答案，還要從蛋白質(zhì)序列的研究說起。業(yè)界人士都知道，蛋白質(zhì)折疊是生物物理領(lǐng)域最重要的研究課題之一，在過去的五十年時間里，這一課題的研究都因為各種各樣的技術(shù)問題而受阻。其中很重要的一個原因是，蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)之間屬于高維到高維的映射關(guān)系，常規(guī)的數(shù)學(xué)或物理的方法難以對這些關(guān)系進(jìn)行分析。
最近幾年，實驗技術(shù)得到了進(jìn)一步的提升，新一代測序技術(shù)和蛋白質(zhì)晶體學(xué)以及冷凍電鏡等結(jié)構(gòu)生物學(xué)方法開始得到大量應(yīng)用，豐富的蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)信息得以積累，這無疑為使用基于北鯤云的人工智能技術(shù)對序列-結(jié)構(gòu)間關(guān)系進(jìn)行研究打下了堅實的基礎(chǔ)。自從2016的CASP12競賽開始，深度學(xué)習(xí)技術(shù)就廣泛地在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測領(lǐng)域進(jìn)行應(yīng)用，使得結(jié)構(gòu)預(yù)測準(zhǔn)確度得到了質(zhì)的提升。
AlphaFold2的獨到之處在于，它采用全新算法設(shè)計，這種算法和之前的方式具有很大的區(qū)別，比如在生物物理層面，該技術(shù)所采用的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)，其序列信息和氨基酸殘基相互作用圖譜間實現(xiàn)了升級，和蛋白質(zhì)折疊的物理機理可以更好地進(jìn)行吻合。另外，基于這種技術(shù)的模型還能夠?qū)崿F(xiàn)端對端的精準(zhǔn)結(jié)構(gòu)預(yù)測，可以極大地提升分析效率。
展開 血流動力學(xué)/生物流體力學(xué)講座
血流動力學(xué)/生物流體力學(xué)講座
Discovery Studio 藥物發(fā)現(xiàn)與生物大分子計算模擬平臺
它服務(wù)于生命科學(xué)領(lǐng)域的實驗生物學(xué)家、藥物化學(xué)家、結(jié)構(gòu)生物學(xué)家、計算生物學(xué)家和計算化學(xué)家。為科學(xué)家提供易用的生物大分子模擬和藥物設(shè)計工具。通過高質(zhì)量的圖形、多年驗證的技術(shù)以及集成的環(huán)境，Discovery Studio（DS）將實驗數(shù)據(jù)的保存、管理與專業(yè)水準(zhǔn)的建模、模擬工具集成在一起，為研究隊伍的合作與信息共享提供平臺。
Discovery Studio的主要模擬功能：
· 生物大分子：蛋白/核酸的序列分析、蛋白進(jìn)化分析、蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的預(yù)測與模擬、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)表面電荷分析及pKa值預(yù)測、膜蛋白的結(jié)構(gòu)預(yù)測與模擬、抗體的設(shè)計與分析、蛋白理性設(shè)計、丙氨酸掃描（computational alanine scanning）、核酸的設(shè)計與模擬、蛋白聚集效應(yīng)預(yù)測、蛋白（核酸）-蛋白（核酸）相互作用、X-ray晶體結(jié)構(gòu)解析等
· 計算化學(xué)：分子力學(xué)計算和分子動力學(xué)模擬、量子力學(xué)/分子力學(xué)（QM/MM）計算等
· 基于靶標(biāo)結(jié)構(gòu)藥物設(shè)計：配體-靶標(biāo)相互作用（分子對接）、全新藥物設(shè)計、me too， me better藥物設(shè)計、分子對接、基于結(jié)構(gòu)的虛擬篩選、基于片段的藥物設(shè)計等
· 基于配體藥物設(shè)計部分：完全基于配體的藥效團設(shè)計、基于配體-受體復(fù)合物的藥效團設(shè)計、化合物數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建和篩選、藥效團數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建與保存、定量構(gòu)效關(guān)系（QSAR/QSPR）、基于MMP的SAR分析等
· 有機小分子：虛擬組合化學(xué)庫的設(shè)計與分析、類藥性篩選、化合物構(gòu)象搜索和分析、化合物ADMET性質(zhì)預(yù)測等
· DS的應(yīng)用領(lǐng)域：以小分子化合物、生物大分子的設(shè)計與模擬為核心，應(yīng)用領(lǐng)域涵蓋藥物、化學(xué)、生物三大學(xué)科，研究領(lǐng)域包括：疾病的發(fā)病機理研究、新藥發(fā)現(xiàn)和設(shè)計、生物信息學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)、酶學(xué)、免疫學(xué)、病毒學(xué)、蛋白質(zhì)工程、腫瘤研究等。
展開 
微流控生物打印細(xì)胞組織結(jié)構(gòu)仿真初探 ￥800
<p>具有特定生物和機械性能的3D功能性組織結(jié)構(gòu)在再生醫(yī)學(xué)和組織工程領(lǐng)域相當(dāng)重要。但是，高度組織化、功能性的3D組織的發(fā)展仍面臨一個未解決的挑戰(zhàn)。在 體外重現(xiàn)包括多種細(xì)胞和細(xì)胞外基質(zhì)的3D多級結(jié)構(gòu)是一個相當(dāng)不容易的任務(wù)。在這樣的背景下，生物打印作為一種有潛力制備仿生3D組織結(jié)構(gòu)的新技術(shù)已經(jīng)出現(xiàn)。生物打印可以根據(jù)需要實現(xiàn)多細(xì)胞結(jié)構(gòu)的精確定位。數(shù)字化可調(diào)微流控3D生物打印是當(dāng)今研究的一個熱點。
集成多組學(xué)數(shù)據(jù)的機器學(xué)習(xí)在生物醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用
基礎(chǔ)大綱
機器學(xué)習(xí)及生物組學(xué)基礎(chǔ)
目標(biāo)：對機器學(xué)習(xí)基本概念進(jìn)行介紹，讓大家對機器學(xué)習(xí)基本概念有大致了解。明確機器學(xué)習(xí)方法的適用性，優(yōu)勢，以及局限性等
什么是機器學(xué)習(xí)
機器學(xué)習(xí)的應(yīng)用實例
生物組學(xué)簡介（基因組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組學(xué)，蛋白組學(xué)，代謝組學(xué)）
機器學(xué)習(xí)在在多組學(xué)數(shù)據(jù)分析的應(yīng)用
python基礎(chǔ)
目標(biāo)：機器學(xué)習(xí)主流實現(xiàn)是python語言。學(xué)習(xí)機器學(xué)習(xí)之前，有針對性的對python進(jìn)行系統(tǒng)的學(xué)習(xí)，數(shù)據(jù)的基本處理,以方便將來開展機器學(xué)習(xí)的學(xué)習(xí)
python安裝與開發(fā)環(huán)境的搭建
基本數(shù)據(jù)類型、組合數(shù)據(jù)類型
函數(shù)、列表 、元組、字典、集合
控制結(jié)構(gòu)、循環(huán)結(jié)構(gòu)
Numpy模塊——矩陣的科學(xué)計算
Matplotlib模塊——數(shù)據(jù)處理與繪圖
Pandas模塊——csv數(shù)據(jù)處理與分析
Sklearn模塊——機器學(xué)習(xí)模型基礎(chǔ)軟件包調(diào)用
2 案例實踐一：利用Python pandas讀取組學(xué)CSV數(shù)據(jù)并進(jìn)行數(shù)據(jù)讀取、轉(zhuǎn)換、保存等
生物組學(xué)大數(shù)據(jù)預(yù)處理與探索分析
目標(biāo)：對高維組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計分析及機器學(xué)習(xí)建模前，需要對數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理，如缺失值填補、降維可視化等，大數(shù)據(jù)預(yù)處理與探索分析是檢驗數(shù)據(jù)質(zhì)量與了解數(shù)據(jù)分布的必要過程。
展開 案例分析 | 從工程學(xué)角度預(yù)測血管和氣管的流量并研究生物
埼玉大學(xué)大學(xué)院理工學(xué)研究科的生物力學(xué)實驗室正在充分利用SCFLOW&SCRYU/Tetra?來研究醫(yī)學(xué)和生物主題。通過將工程領(lǐng)域的觀點帶入醫(yī)學(xué)領(lǐng)域，我們旨在解決醫(yī)學(xué)領(lǐng)域過去無法解決的問題。它還正在努力研究將具有生物機體功能的生產(chǎn)品的應(yīng)用。
埼玉大學(xué)科學(xué)與工程研究生院機械科學(xué)系的生物力學(xué)實驗室是工程學(xué)院的一項獨特研究，研究基于機械工程的生物學(xué)相關(guān)的各種趨勢，并致力于醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用開發(fā)。據(jù)說實驗室正在使用SCFLOW&SCRYU/Tetra研究三個主要主題：
1、闡明由心臟瓣膜畸形引起的疾病的發(fā)病機理。
2、對腦動脈瘤搭橋手術(shù)的初步檢查的研究。
3、闡明鳥類呼吸器官的機制，以期應(yīng)用于仿生學(xué)和生物分類學(xué)。
我們詢問了同一實驗室的中村正典副教授的詳細(xì)信息。
埼玉大學(xué)大學(xué)院理工學(xué)系機械科學(xué)系
生物力學(xué)研究室副教授中村正典先生
探索由心臟瓣膜畸形引起的血管疾病的致病機理
出口處有一個閥門，血液從心臟流到主動脈，以防止血液回流。該瓣膜通常由三個組成，但在稱為主動脈瓣二尖瓣外翻的疾病中，只有兩個瓣膜。這是一種先天性畸形，發(fā)生在千分之一的人中，但是大多數(shù)人大部分時間都沒有被注意，因為他們可以毫無問題地生活。但是，在30年代和50年代，瓣膜末端的部分主動脈腫脹并比正常人更容易變成主動脈瘤。中村副教授正在與自治醫(yī)科大學(xué)附屬的埼玉醫(yī)學(xué)中心和自治醫(yī)科大學(xué)心血管外科共同合作調(diào)查原因。在這種情況下，有兩種可能的主動脈瘤原因。一種理論認(rèn)為血管可能存在某些遺傳問題，因為從一開始就存在某種遺傳缺陷。另一種可能性是由于主動脈瓣膜疾病引起的血流模式改變導(dǎo)致主動脈瘤。可能是這兩者之一或兩者都是原因。
Nakamura等人正在研究由流量變化引起的設(shè)想進(jìn)行驗證。
展開 不同農(nóng)業(yè)生物質(zhì)廢棄物的熱解特性及動力學(xué)對比
分析表2可知，玉米芯的揮發(fā)分綜合釋放特性指數(shù)D值最高，花生殼的最低，而稻殼和稻秸居中，揮發(fā)分綜合釋放特性指數(shù)排序為玉米芯＞稻秸＞稻殼＞花生殼，這說明玉米芯的熱穩(wěn)定性最低，最有利于熱解，而稻殼在該4種生物質(zhì)中的熱穩(wěn)定性最高，花生殼和稻秸的熱穩(wěn)定性則居于中間。
3溫度對氣相產(chǎn)物析出的影響
生物質(zhì)的熱解就是纖維素、半纖維素和木質(zhì)素等組分熱解的綜合過程[8-9]。圖4是生物質(zhì)熱解過程產(chǎn)生的小分子可燃?xì)庀喈a(chǎn)物（CO，H2，CH4）隨溫度升高的變化曲線.從圖4看出，隨著溫度的升高，玉米芯、稻殼和稻秸的CO析出在340?380℃之間均出現(xiàn)離子強度減弱峰，而花生殼的CO釋放則未出現(xiàn)任何峰值.耳的析出為單峰曲線。CH4在360?400℃之間存在一個明顯的主峰，而在580℃出現(xiàn)一個微弱的側(cè)峰。
從圖4看出，在整個升溫過程中，該4種生物質(zhì)熱解析出CO的離子流釋放強度大小為：稻秸＞稻殼＞花生殼＞玉米芯；析出H2的強度為：稻秸＞稻殼＞玉米芯＞花生殼；析出CH4的強度排序為：稻秸＞稻殼＞玉米芯＞花生殼。
總體上看，稻秸產(chǎn)生的CO，H2，CH4等小分子燃?xì)獾碾x子流強度均最高，其次為稻殼和玉米芯，而花生殼相對較低.由表1可知，該4種生物質(zhì)中，花生殼的木質(zhì)素含量最高，其纖維素和半纖維素的含量之和明顯低于其他3種生物質(zhì)，而纖維素和半纖維素?zé)峤饪僧a(chǎn)生大量的揮發(fā)分氣體。因此，可優(yōu)先選用稻秸作為原料進(jìn)行熱解氣化，以制備更加優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)燃?xì)狻? 4熱解動力學(xué)特性分析
生物質(zhì)熱解動力學(xué)方程可表示為
5結(jié)論
1)生物質(zhì)熱解大致可分為3個階段：失水預(yù)熱解、揮發(fā)分析出和炭化階段；玉米芯的熱解總失重為75%，花生殼、稻秸和稻殼為65%，60%和40%；熱解動力學(xué)特性與試驗結(jié)果基本保持一致。
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