結構生物學
關注創(chuàng)建者：匿名 創(chuàng)建時間：2026-01-04
結構生物學的視頻教程
ADAMS運動學仿真及結構優(yōu)化設計第四講——結構優(yōu)化設計
1.模型參數(shù)化 1）定義設計變量 2）模型參數(shù)化 2.優(yōu)化設計流程 1）優(yōu)化設計的一般流程 2）目標函數(shù)定義 3）約束函數(shù)定義 4）優(yōu)化設計、設計研究和實驗設計的區(qū)別 3.六連桿沖壓機構的優(yōu)化設計 4.發(fā)動機解耦率優(yōu)化設計
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HBK結構動力學測試
1. 頻響函數(shù)測量 2. 模態(tài)參數(shù)識別、分析驗證 3. 有限元與模態(tài)相關性分析 4. 工作狀態(tài)變形分析（ODS） 5. 運行模態(tài)分析（OMA） 6. Q&A 點擊這里，咨詢HBK產品信息：https://www.hbkworld.com/zh/contact-us
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結構生物學的實例教程
1-1 概述
2-1-蛋白質結構和功能組成
2-2-蛋白質結構和功能肽鍵和相互作用
2-3-蛋白質結構和功能α螺旋和β片
2-4-蛋白質結構和功能肽鍵和Ramachandran圖
2-5-蛋白質結構和功能結合能
2-6-蛋白質結構和功能蛋白質如何折疊
2-7-蛋白質結構和功能結構水平
2-8-蛋白質結構和功能功能水平
2-9-蛋白質結構和功能酶動力學基本概念
3-1-可用的蛋白質制備結構
3-2-制備的蛋白質制備結構
3-3-蛋白質制備同源性建模
3-4-蛋白制備穿線法
3-5-蛋白質制備α折疊
3-6-PDB結構的6-蛋白制備選擇
3-7-蛋白質制劑缺失殘留問題
3-8-蛋白質制備結構驗證
4-1-分子對接算法
4-2-分子對接類型
4-3-分子對接模式
4-4-分子對接軟件
4-5-分子對接自動對接VINA高分子制劑
4-6-分子對接自動對接VINA配體制備
4-7-分子對接自動對接VINA網格制備
5-1-自動對接VINA腳本
5-2-自動對接VINA分析-I
5-3-Autodock VINA分析- II
6-1-虛擬篩選為什么它很重要
6-2-虛擬篩選簡要信息
6-3-虛擬篩選大分子和配體的制備
6-4-虛擬篩選網格準備
6-5-虛擬篩選ADMET分析
6-6-虛擬篩查Lipinksi五規(guī)則
6-7-虛擬篩查結果分析
6-8-虛擬篩選腳本
7-1-故障診斷問題
7-2-出版質量圖制備
展開 在學會第四屆理事會第一次會議上，邊惠潔理事長對新一屆理事會的工作進行了部署，向積極參加科普活動的各單位頒發(fā)了“陜西省細胞生物學學會科普活動優(yōu)秀獎”獎金和榮譽證書，并主持討論通過了成立學會第一個專業(yè)委員會的議題。崔洪勇副秘書長進行了中國細胞生物學學會2018年“諾貝爾獎解讀”活動的動員。
會議期間，中國細胞生物學學會細胞工程與轉基因生物分會召開了第三屆委員會第三次會議。分會會長、空軍軍醫(yī)大學邊惠潔教授向委員們匯報了近年來分會的工作和取得的成績，傳達了中國細胞生物學學會對分會工作的要求，向積極參加分會活動的各單位頒發(fā)了“科普活動優(yōu)秀獎”獎金和榮譽證書。分會秘書長孔令敏副教授傳達了中國細胞生物學學會的科普工作精神和要求。
資料來源：中國細胞生物學學會官網，11月5日
展開 因此研究和理解GPCRs的結構與功能，對當今藥物設計至關重要。
一個蛋白質的特有生理功能與活性，是由它特定的三維結構決定的。因此從蛋白三維結構來理解GPCRs的功能是當今藥物設計中必不可少的一個環(huán)節(jié)。隨著結構生物學技術突飛猛進的發(fā)展，截止到2018年7月，已經了50多個不同種類的GPCRs結構被解析出來。這其中涵蓋了GPCRs 的A,B,C和F亞家族。在這些解析的結構當中，人們發(fā)現(xiàn)藥物小分子可以結合在GPCRs的不同部位，這其中包括傳統(tǒng)的正構位點(orthosteric site)和多個別構位點(allosteric site)，諸如：膜外ECL2 loop區(qū)域，第一、二跨膜螺旋區(qū)域，第二、三跨膜螺旋區(qū)域，第三、四跨膜螺旋區(qū)域，第四、五跨膜螺旋區(qū)域、膜內G蛋白結合區(qū)域。不同的小分子結合位點所處的化學環(huán)境有所不同，這樣則給當代藥物發(fā)現(xiàn)與設計提供了新的機遇。
盡管傳統(tǒng)結構生物學對人們理解蛋白的生理功能提供了不可或缺的方法和信息，但它也有自己的缺陷。比如傳統(tǒng)結構生物學不能告訴人們?yōu)槭裁碐PCRs結合激動劑(agonist)之后可以被激活，而結合拮抗劑(antagonist)的時候為什么信號通路會被阻斷。此外，單個GPCRs晶體結構也不能告訴人們GPCRs具體的激活動態(tài)過程是怎樣的。與之相比，計算結構生物學則很好的彌補了傳統(tǒng)結構生物學的不足6,7。比如：通過在計算機上構建磷脂雙層和溶劑模型，可以模擬GPCRs在細胞生理環(huán)境下的動態(tài)過程（圖一）。
圖一，分子動力學模擬GPCR膜蛋白體系。
本文工作通過計算生物學中分子動力學與系統(tǒng)分析的方法，找到GPCRs A家族的一個新的別構位點。首先作者把天然激動劑乙酰膽堿（ACh）分子放在乙酰膽堿受體 (muscarinic acetylcholine receptors)膜外部分，然后實施長時間尺度的全原子分子動力學模擬。
展開 生物信息學與進化分析及其生物醫(yī)學應用2.pdf
生物信息學與進化分析及其生物醫(yī)學應用1.pdf
計算生物學和生物醫(yī)學國際學術會議（CBBS 2023）
會議官網：http://www.iccbbs.org/
會議時間：2023年8月12-14日
會議地點：湖北武漢
提交檢索：CPCI (WoS), CNKI, Google Scholar, WanFang Data, etc.
會議介紹
隨著計算機技術的發(fā)展，生物醫(yī)學信息學和計算生物學越來越受到學術界和工業(yè)專家的關注。作為一個跨學科的學術會議，CBBS 2023聚焦生物醫(yī)學的熱門研究領域，如計算生物學，計算生物學, 生物醫(yī)學機器人等， 旨在為計算生物學和生物醫(yī)學領域的學者和行業(yè)專家提供一個專業(yè)的國際交流平臺，促進行業(yè)內，行業(yè)間的學術交流，共同探討解決新問題，迎接新挑戰(zhàn)，進而激發(fā)新的想法和思路，提供更多的合作機會。
出版與檢索
CBBS 2023 錄用并展示的文章將由Atlantis Press出版, 并提交至CPCI (WoS), CNKI, Google Scholar, WanFang Data等數(shù)據庫檢索。
組委會成員
大會主席-陳銘教授，浙江大學生命科學學院教授，內蒙古民族大學生命科學與食品學院特聘院長，有豐富的期刊編輯、審稿和會議經驗。
大會主席-Y-h. Taguchi教授，來自日本東京中央大學，主要研究方向為主成分分析、基于張量分解的特征提取及其在生物信息學中的應用。
投稿主題
計算生物學算法 / 人工關節(jié)和器官 / 生物電子學 / 生物物理學 / 計算醫(yī)學……
投稿方式
作者請將全文或摘要通過郵箱投稿至info@iccbbs.org，并備注投稿人姓名，職稱，單位，常用電話/微信，或其他需求。
要求為全英文原創(chuàng)稿件，須嚴格按照模板排版后提交。摘要投稿僅做交流展示，不提供出版。
如有其他問題請致電13163283137
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研討會內容
頻響函數(shù)測量
模態(tài)參數(shù)識別、分析驗證
有限元與模態(tài)相關性分析
工作狀態(tài)變形分析（ODS）
運行模態(tài)分析（OMA）
研討會時間
2026年3月17日（周二）下午2:00-3:00
費用免費
備注
研討會將通過網絡直播的方式進行，請自備具備上網條件的電腦
1-1 概述
2-1-蛋白質結構和功能組成
2-2-蛋白質結構和功能肽鍵和相互作用
2-3-蛋白質結構和功能α螺旋和β片
2-4-蛋白質結構和功能肽鍵和Ramachandran圖
2-5-蛋白質結構和功能結合能
2-6-蛋白質結構和功能蛋白質如何折疊
2-7-蛋白質結構和功能結構水平
2-8-蛋白質結構和功能功能水平
飛行器氣動設計、結構強度與疲勞、燃燒與傳熱、電磁散射（隱身）、軌道動力學直接觸及了航空航天領域仿真的技術核心。作為UltraLAB圖形工作站的廠商，精準把握這些算法的計算特性，是為客戶提供最優(yōu)硬件解決方案的關鍵。
我將為您逐一解析這五大航空航天仿真領域。
核心結論速覽表
培訓日程：
培訓時間：2025/11/20-21
培訓地點：北京市朝陽區(qū)天澤路16號院潤世中心2號樓B座12層
面向人群：
針對MSC Nastran軟件使用者，且對結構動力學、NVH有一定了解的工程技術人員。
培訓目標：
?通過培訓，使得參加培訓的人員了解MSC Nastran軟件的結構動力學功能和相關術語
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本案例適合哪些人學習：
1、學習型仿真工程師
2、理工科院校學生
3、對有限元分析感興趣的工程師
你會得到什么：
1、學習小塊移動的三維模型處理
2、學習小塊移動非線性接觸相關的接觸設置
3、學習非線性熱結構耦合動力學分析步的建立
4、學習小塊移動熱結構耦合動力學分析的載荷施加
案例介紹：
所使用軟件為ANSYS workbench2020r2.
案例介紹了
本案例適合哪些人學習：
1、學習型仿真工程師
2、理工科院校學生
3、與切削工藝相關的工程師
你會得到什么：
1、掌握二維模型的繪制
2、掌握熱結構耦合顯示動力學分析相關的材料參數(shù)設置
3、理解動力學分析步的建立
4、學習切削相關的相互關系的設置
5、了解顯示動力學網格的劃分
6、學習結果后處理的查看與對比
案例介紹：
所使用軟件為ABAQUS2018
精彩直播預告
在航空、航天、船舶、車輛等工業(yè)領域的關鍵結構動力學分析中，結構內部包含水、油等重流體的場景十分常見。在此類場景下，液體對結構整體的動力學特性往往產生極其顯著的影響。針對這一核心挑戰(zhàn)，海克斯康工業(yè)軟件旗下的MSC Nastran提供了多種成熟的解決方案，包括虛質量法和耦合實模態(tài)法等專門分析此類結構的方法。
MSC Nastran不僅支持對此類帶液體結構進行高效的超單元縮聚和
結構動力學簡介
什么是結構動力學分析？
了解結構的實際動態(tài)行為和/或固有動態(tài)特性，以提高安全性、可靠性、能耗和舒適性。
在哪里使用？
結構動力學分析用于設計驗證、認證測試、故障排除、“假設”場景預測、裝配分析、基準測試、結構健康監(jiān)測等。
分析如何進行？
基于測量（也稱為實驗測試）或基于計算機模擬（也稱為仿真分析）
仿真結果通常與測試結果相關聯(lián)
本文通過abaqus顯示動力學的方法對BCC結構進行壓縮仿真模擬，同時為減小計算量，采用梁單元模擬點陣結構，壓頭設置為剛性面，添加質量縮放，加快運算速度，為點陣結構壓縮模擬提供一種便捷方法。
1. 建立BCC點陣模型,以單胞尺寸5X5X5為例。
a.首先建立立方體實體，然后對實體進行處理，得到點陣單胞點陣結構。
b.建立單胞BCC梁單元點陣模型,然后進行刪除面的操作，得到單胞
