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表面吸附能在界面設計中非常重要，但在某些情況下，沒有合理的LJ勢參數，需要通過DFT或其他方法進行評估。2、全原子分子動力學在全原子分子動力學（FAMD）中，一個粒子代表一個原子（圖2左），每個粒子的動力學是基于牛頓運動方程計算的。作用在每個原子上的力由一個函數和參數給出，包括上述的LJ勢。FAMD可以用來評估分子結構變化（如官能團）對分子構象和動力學的影響。

界面：J-OCTA利用SIESTA(基于原子軌道基底的DFT計算軟件)作為內置的界面能計算工具，可以預測分子和固體表面之間的界面能，以此來確定LJ勢。（圖7：界面能和勢能優化的DFT計算）5. 建模：J-OCTA可以通過將珠簧模型(Kremer-Grest)反向映射為全原子模型來建立無定形結構。該功能可以顯著提高聚合物的構建效率。

分子鏈間的庫侖靜電作用并不直接貢獻聚合物的導熱，只是使得相反電荷原子更接近， 增加 LJ（Lennard?Jones）作用。從分子尺度看，離子間庫侖力使得它們更接近，LJ 作用從吸引過渡到排斥，隨電離度增大 LJ 作用勢從正變負，在作用勢的排斥區域極大提升了聚合物電解質的導熱。離子電荷及離子半徑影響反離子?反離子、反離子?聚合物、聚合物?聚合物之間的作用力及導熱。