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假如我們將Jones Matrix當作x方向上的檢偏鏡(analyzer) (Areal = +1，其餘元素皆為0)，則只有x方向的偏振光可以順利通過，穿透率(Transmission)也因此減為原本的一半。注意: Analyze...Polarization中的所有分析功能均有Settings的選項，提供使用者直接輸入入射光的偏振態。

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在分析過程中出現較大的穿透也會 導致計算不收斂，穿透可以在后處理模塊中的圖像中 直觀顯示，也可在接觸工具中查看具體穿透值。分析 表明不僅穿透量的絕對值大小可以影響收斂速度，穿 透量的變化快慢也會影響分析收斂速度。如圖 5 是螺 紋連接結構在靜力學分析下的收斂曲線。