化學(xué)信息學(xué)的案例
藥物發(fā)現(xiàn)與化學(xué)信息學(xué)中的機(jī)器學(xué)習(xí)應(yīng)用
藥物發(fā)現(xiàn)與化學(xué)信息學(xué)中的機(jī)器學(xué)習(xí)應(yīng)用 發(fā)布時(shí)間：2026年 時(shí)長(zhǎng)：3小時(shí) 大小：1.1GB 語(yǔ)言：英語(yǔ) 課程內(nèi)容 學(xué)習(xí)將Python、人工智能與機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)應(yīng)用于化學(xué)信息學(xué)領(lǐng)域，掌握藥物發(fā)現(xiàn)的計(jì)算方法與實(shí)操項(xiàng)目開發(fā)，從零搭建相關(guān)預(yù)測(cè)模型并完成部署。 學(xué)習(xí)目標(biāo)
跟生活學(xué)化學(xué):烹飪中的化學(xué)
但是，使用味精要特別注意溫度，如果烹飪時(shí)加熱至120℃以上，谷氨酸鈉就會(huì)發(fā)生化學(xué)變化，變成焦谷氨酸鈉，不僅鮮味減退還有輕微的毒性，所以炒菜、做湯時(shí)，味精應(yīng)在臨出鍋時(shí)放入。再者由于味精呈堿性，不宜與醋等酸性菜肴混用，以免使酸堿中和。另外，嬰兒應(yīng)少吃味精，因?yàn)槲毒珪?huì)與人體中鋅生成絡(luò)合物谷氨酸鋅，隨后溶于水排出體外，造成嬰兒缺鋅，影響兒童發(fā)育。
炒菜時(shí)，有的人喜歡把油燒得冒煙甚至快燃燒起來才放菜，特別是在使用植物油的時(shí)候，覺得又不燒“死”菜里就會(huì)有生油氣。須知這是一種不好做法，油在高溫時(shí)容易生成一種多環(huán)化合物，一般植物油含的不飽和脂肪酸多，更容易形成多環(huán)化合物，實(shí)驗(yàn)證明，多環(huán)化合物易于誘發(fā)動(dòng)物得膀胱癌。一般將油燒至沸騰就行了，油的“生氣”便可以除去。油溫太高了不好。
展開 東華大學(xué)史向陽(yáng)團(tuán)隊(duì) ACS Nano：纖連蛋白包覆的金屬-多酚網(wǎng)絡(luò)通過鐵死亡增強(qiáng)的ICD實(shí)現(xiàn)腫瘤的化學(xué)/化學(xué)動(dòng)力學(xué)/免疫協(xié)同治療
為解決小分子化療藥物不可避免的副作用、腫瘤免疫逃逸以及復(fù)發(fā)等問題，利用FN的修飾促進(jìn)藥物的靶向遞送，聯(lián)合化療及CDT實(shí)現(xiàn)增強(qiáng)的ICD，輔以A-PD-L1免疫檢查點(diǎn)阻斷療法，完成增強(qiáng)的腫瘤免疫治療及MR成像，東華大學(xué)史向陽(yáng)教授團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了一種纖連蛋白包覆的金屬-多酚網(wǎng)絡(luò)，通過增強(qiáng)的鐵死亡介導(dǎo)的ICD，用于協(xié)同的腫瘤化學(xué)/化學(xué)動(dòng)力學(xué)/免疫治療以及MR成像（圖1）。
圖1. DOX-TAF@FN納米復(fù)合物的制備及其用于體內(nèi)MR成像和腫瘤的化學(xué)/化學(xué)動(dòng)力學(xué)/免疫聯(lián)合治療示意圖。
研究團(tuán)隊(duì)首先在DOX存在的情況下，利用TA與Fe3+之間的配位作用原位形成負(fù)載DOX的TAF（DOX-TAF）納米復(fù)合物。隨后，通過氫鍵作用力將FN包覆于DOX-TAF的表面制備納米復(fù)合物DOX-TAF-FN。制備的DOX-TAF-FN復(fù)合物尺寸分布均勻，平均粒徑為45.0 nm。
團(tuán)隊(duì)通過UV-vis、SDS-PAGE等手段證明了DOX-TAF@FN的成功制備（圖2a-f），且其在水、PBS以及培養(yǎng)基中具有良好的膠體穩(wěn)定性（圖2g）。制備的DOX-TAF@FN在弱酸性條件下（pH=5.5）能夠顯著釋放鐵離子（41.7%）（圖2h）。此外，亞甲基藍(lán)（MB）降解實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，DOX-TAF@FN具有催化H2O2產(chǎn)生?OH的特性（圖2i），從而誘導(dǎo)CDT。
圖2.
展開 日本半導(dǎo)體封裝材料集體發(fā)力車載市場(chǎng)：住友電木/昭和電工/信越化學(xué)規(guī)劃信息匯總
（圖片出自：電子Device產(chǎn)業(yè)新聞）
信越化學(xué)瞄準(zhǔn)未來有望普及的碳化硅（SiC）等寬帶隙（WBG，Wide Band Gap）半導(dǎo)體元件，推出了“KMC-8000系列”塑封材料，用于更耐高溫、耐高壓的新一代功率元件。由于該系列材料有助于解決塑封工藝中的問題，因此再次受到業(yè)界關(guān)注。信越化學(xué)工業(yè)瞄準(zhǔn)到2025年前后有望繼續(xù)增長(zhǎng)的電動(dòng)車功率元件市場(chǎng)，推出了這款可滿足新一代車規(guī)級(jí)200度連接溫度的塑封材料。
群馬事業(yè)所（日本群馬縣安中市）是信越化學(xué)最先進(jìn)的試做、研發(fā)中心。該據(jù)點(diǎn)通過與海外量產(chǎn)工廠攜手合作，可在短時(shí)間內(nèi)推出豐富多彩的新產(chǎn)品，以應(yīng)對(duì)客戶的多樣化需求、創(chuàng)造更多業(yè)務(wù)機(jī)會(huì)。
2022年中國(guó)先進(jìn)封裝用PSPI材料市場(chǎng)分析報(bào)告
第一章：PSPI材料市場(chǎng)綜述
1. PSPI主要應(yīng)用市場(chǎng)介紹
2. PSPI在RDL工藝應(yīng)用介紹
第二章：全球晶圓代工及先進(jìn)封裝市場(chǎng)發(fā)展趨勢(shì)
1. 2018-2025年全球晶圓代工產(chǎn)能增長(zhǎng)趨勢(shì)
2. 2018-2025年全球晶圓代工技術(shù)發(fā)展趨勢(shì)
3. 2018-2025年全球先進(jìn)封裝市場(chǎng)發(fā)展趨勢(shì)
4. 2021年全球先進(jìn)封裝制造商市場(chǎng)格局
第三章：全球及中國(guó)先進(jìn)封裝用PSPI需求趨勢(shì)
1. 2020-2026年全球及中國(guó)先進(jìn)封裝用PSPI需求趨勢(shì)
2. 2020-2026年全球及中國(guó)先進(jìn)封裝用PSPI市場(chǎng)規(guī)模趨勢(shì)
第四章：PSPI材料企業(yè)主要信息
1. 全球及中國(guó)PSPI主要企業(yè)
2. 中國(guó)大陸先進(jìn)封裝PSPI市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)格局
3.
展開 
精細(xì)有機(jī)合成化學(xué)及工藝學(xué)PPT
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《Nature Commun》：化學(xué)鍵在結(jié)晶和玻璃化動(dòng)力學(xué)方面的潛力
因此，結(jié)晶和玻璃化動(dòng)力學(xué)的設(shè)計(jì)為提高其應(yīng)用潛力提供了重要的機(jī)會(huì)。這一目標(biāo)激發(fā)了許多研究活動(dòng)，以解開PCMs中快速結(jié)晶的起源。以往的研究，強(qiáng)調(diào)了非晶(玻璃)相中四重環(huán)的重要性，并闡明了降低隨機(jī)性對(duì)晶體成核的作用。
此文中，研究者采用了一種不同的方法，以探索了化學(xué)鍵的系統(tǒng)變化對(duì)結(jié)晶動(dòng)力學(xué)的影響。為了實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn)，研究者分析了一種原型相變材料GeTe的快速結(jié)晶，并分別與GeSe、SnTe和Sb2Te3合金。GeSe的共價(jià)明顯高于GeTe，而SnTe的特征是更大的電荷轉(zhuǎn)移。這三種物質(zhì)體系都具有很好的混相。它們的特征是在它們的晶體相中有八面體狀的原子排列，盡管有不同程度的扭曲，這是p鍵化合物的特征。因此，研究者避免了GeTe與四面體、sp3-鍵結(jié)半導(dǎo)體的混合。研究者發(fā)現(xiàn)，結(jié)晶速度沿著兩種基本鍵類型，金屬鍵和共價(jià)鍵的線連接區(qū)域有明顯的化學(xué)計(jì)量學(xué)依賴關(guān)系。增加共價(jià)降低了六個(gè)數(shù)量級(jí)的結(jié)晶，并促進(jìn)了玻璃化。化學(xué)計(jì)量比的依賴性與材料的性質(zhì)有關(guān)，如晶體相的光學(xué)性質(zhì)和鍵指示符，相鄰原子間共有的電子數(shù)。量子化學(xué)圖解釋了這些趨勢(shì)，并為設(shè)計(jì)結(jié)晶動(dòng)力學(xué)提供了藍(lán)圖。
圖1 不同硫?qū)倩衔锏慕Y(jié)晶速度。
圖2 最小結(jié)晶時(shí)間τ。
圖3 玻璃化相變。
圖4 動(dòng)力學(xué)隨鍵指標(biāo)的變化。
綜上所述，最后，擴(kuò)展化學(xué)鍵量詞(ES和ET)的使用，以描述其他類別材料的結(jié)晶和玻璃化動(dòng)力學(xué)應(yīng)該是有益的。四面體配位、共價(jià)體系和金屬是否也有類似的趨勢(shì)，即能否根據(jù)共享和轉(zhuǎn)移電子數(shù)量的定量數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)它們的玻璃化和結(jié)晶行為？如果這個(gè)目標(biāo)能夠?qū)崿F(xiàn)，這將為制造玻璃和晶體的藝術(shù)提供一種新的科學(xué)視角。
展開 服務(wù)器主要用于 計(jì)算化學(xué)/材料模擬、分子動(dòng)力學(xué)、機(jī)器學(xué)習(xí)
主要用到的軟件 vasp、quantum espresso、cp2k、lammps等
華工唐本忠院士團(tuán)隊(duì)秦安軍教授等 JACS封面文章：首次結(jié)合“羥基-炔”和“巰基-烯”點(diǎn)擊化學(xué)制備序列精確大分子用于高密度信息存儲(chǔ)
它們僅由四種不同核苷酸基元構(gòu)成，卻可以存儲(chǔ)我們海量的遺傳信息。受到這種自然界“智能”合成的啟發(fā)，非天然序列精確大分子的合成已成為一個(gè)新興的研究領(lǐng)域。
在已有的報(bào)道中，用于構(gòu)筑人工序列精確大分子的單體一般需要多步的精心設(shè)計(jì)合成，很多合成方法需要用到“保護(hù)-脫保護(hù)”策略，不符合“原子經(jīng)濟(jì)”的綠色化學(xué)合成原則，同時(shí)需要消耗大量時(shí)間和精力。一些體系會(huì)用到金屬催化劑，由于很難從終產(chǎn)物中徹底去除干凈，從而影響其性能。因此，發(fā)展一種溫和、無保護(hù)基團(tuán)、無金屬催化以及100%原子經(jīng)濟(jì)的新化學(xué)用于制備序列精確大分子具有重要意義。
華南理工大學(xué)秦安軍教授等長(zhǎng)期致力于活化炔單體參與的新型點(diǎn)擊聚合反應(yīng)研究，近年來發(fā)展了多種基于活化炔單體的新型點(diǎn)擊聚合反應(yīng)（J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 5437?5443; Macromolecules2020, 53, 2516?2525; Macromolecules2019, 52, 4526?4533; Polym. Chem. 2020, 11, 2568–2575; Chem. Eur. J. 2017, 23, 10725?10731）。近期，他們首次創(chuàng)新性地將“羥基-炔”和“巰基-烯”點(diǎn)擊反應(yīng)結(jié)合，發(fā)展了一種新型迭代逐步合成策略，制備得到全新的序列精確寡聚（單硫代縮醛）。該合成策略相較之前工作，具有溫和高效、無保護(hù)基團(tuán)、無金屬催化以及100%原子經(jīng)濟(jì)等諸多優(yōu)點(diǎn)。
作者采用4+4的單體策略（4個(gè)活化炔和4個(gè)巰基醇類單體），通過11步的迭代逐步合成，制備得到克級(jí)的具有精確分子量和序列的寡聚（單硫代縮醛），總產(chǎn)率為54%。作者通過核磁共振氫譜、凝膠滲透色譜和高分辨質(zhì)譜確認(rèn)了產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)和純度（圖1）。
展開 柔性的剝離石墨烯箔上負(fù)載3D納米碳用于高效的電化學(xué)和光電化學(xué)水解
本文開發(fā)了一種生長(zhǎng)在柔性剝離石墨烯（FEG）箔上的3D Co-N-P（Co-Nx|P）復(fù)合摻雜碳電極（Co-Nx|P-GC/FEG），并作為先進(jìn)的電催化劑，用于堿性介質(zhì)中穩(wěn)定的電化學(xué)和光電化學(xué)（PEC）水解。在已報(bào)道的過渡金屬和/或雜原子摻雜的碳電催化劑中，Co-Nx|P-GC/FEG電極表現(xiàn)出最高的OER催化活性，且全電解的性能優(yōu)于Ir/C//Pt/C催化劑。理論計(jì)算與實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致，Co-Nx與P摻雜之間的協(xié)同效應(yīng)有助于Co-Nx|P-GC/FEG的催化活性。本文首次將Co-Nx|P-GC/FEG集成到赤鐵礦電極上，制備了Co-Nx|P-GC/FEG型光電陽(yáng)極，用于高效太陽(yáng)能驅(qū)動(dòng)的水解，在AM 1.5 G下，電壓為1.23 V時(shí)，光電流密度可達(dá)到2.15 mA cm-2，在0.92 V時(shí)，可達(dá)到最大的光電轉(zhuǎn)換效率（0.40％）。
Figure 1.合成Co-Nx|P-GC/FEG的示意圖。
Figure 2. Co-Nx|P-GC/FEG的表征。a,b）數(shù)碼照片；c,d）FESEM圖；e,f）TEM和相應(yīng)的SAED圖；g）HRTEM圖；h）拉曼光譜圖；Co-Nx|P-GC/FEG在i）N 1s和j）P 2p區(qū)域的XPS譜圖。
Figure 3. Co-Nx|P-GC/FEG的電催化性能及機(jī)理研究。
展開 中科院化學(xué)所JACS：離子導(dǎo)體層減弱正極-固態(tài)電解質(zhì)的界面電位，增強(qiáng)固態(tài)電池的界面動(dòng)力學(xué)
【成果簡(jiǎn)介】
近日，中科院化學(xué)所的郭玉國(guó)研究員和萬(wàn)立駿院士（共同通訊）課題組，將優(yōu)質(zhì)的離子導(dǎo)體緩沖層Li1.4Al0.4Ti1.6(PO4)3修飾到LiNi0.6Co0.2Mn0.2O2上，減輕極化現(xiàn)象，提高動(dòng)力學(xué)特性。采用具有界面電勢(shì)分析功能的原子力顯微鏡，研究修飾后正極的優(yōu)異動(dòng)力學(xué)的形成機(jī)理，揭示界面緩沖層對(duì)電勢(shì)分布和極化的影響。研究發(fā)現(xiàn)固態(tài)電池具有優(yōu)異的循環(huán)穩(wěn)定性和較高的倍率性能，這有助于固態(tài)電池中界面問題的研究。相關(guān)成果以“Mitigating Interfacial Potential Drop of Cathode–Solid Electrolyte via Ionic Conductor Layer To Enhance Interface Dynamics for Solid Batteries”為題發(fā)表在JACS上。
【圖文導(dǎo)讀】
圖 1 L-NCM的XRD和TEM結(jié)構(gòu)表征
（a）L-NCM的精修XRD圖；
（b）L-NCM的TEM圖像；
（c）L-NCM的HRTEM晶格條紋像；
（d）L-NCM的TEM圖及其EDS圖。
圖 2 P-NCM和L-NCM的動(dòng)力學(xué)性能表征圖
（a）P-NCM的變速CV曲線圖；
（b）L-NCM的變速CV曲線圖；
（c）充電過程中，兩個(gè)正極的GITT和準(zhǔn)平衡電位曲線；
（d）GITT曲線中，兩個(gè)正極的電壓極化和歐姆極化圖。
展開 結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)分子對(duì)接大師班--帶案例 ￥10
1-1 概述
2-1-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能組成
2-2-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能肽鍵和相互作用
2-3-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能α螺旋和β片
2-4-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能肽鍵和Ramachandran圖
2-5-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能結(jié)合能
2-6-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能蛋白質(zhì)如何折疊
2-7-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能結(jié)構(gòu)水平
2-8-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能功能水平
2-9-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能酶動(dòng)力學(xué)基本概念
3-1-可用的蛋白質(zhì)制備結(jié)構(gòu)
3-2-制備的蛋白質(zhì)制備結(jié)構(gòu)
3-3-蛋白質(zhì)制備同源性建模
3-4-蛋白制備穿線法
3-5-蛋白質(zhì)制備α折疊
3-6-PDB結(jié)構(gòu)的6-蛋白制備選擇
3-7-蛋白質(zhì)制劑缺失殘留問題
3-8-蛋白質(zhì)制備結(jié)構(gòu)驗(yàn)證
4-1-分子對(duì)接算法
4-2-分子對(duì)接類型
4-3-分子對(duì)接模式
4-4-分子對(duì)接軟件
4-5-分子對(duì)接自動(dòng)對(duì)接VINA高分子制劑
4-6-分子對(duì)接自動(dòng)對(duì)接VINA配體制備
4-7-分子對(duì)接自動(dòng)對(duì)接VINA網(wǎng)格制備
5-1-自動(dòng)對(duì)接VINA腳本
5-2-自動(dòng)對(duì)接VINA分析-I
5-3-Autodock VINA分析- II
6-1-虛擬篩選為什么它很重要
6-2-虛擬篩選簡(jiǎn)要信息
6-3-虛擬篩選大分子和配體的制備
6-4-虛擬篩選網(wǎng)格準(zhǔn)備
6-5-虛擬篩選ADMET分析
6-6-虛擬篩查L(zhǎng)ipinksi五規(guī)則
6-7-虛擬篩查結(jié)果分析
6-8-虛擬篩選腳本
7-1-故障診斷問題
7-2-出版質(zhì)量圖制備
展開 
生物信息學(xué)與進(jìn)化分析及其生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用
生物信息學(xué)與進(jìn)化分析及其生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用2.pdf
生物信息學(xué)與進(jìn)化分析及其生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用1.pdf
北京軟研國(guó)際信息技術(shù)研究院推出“LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)技術(shù)與應(yīng)用”和“VASP第一性原理計(jì)算方法及應(yīng)
北京軟研國(guó)際信息技術(shù)研究院推出“LAMMPS分子動(dòng)力學(xué)技術(shù)與應(yīng)用”和“VASP第一性原理計(jì)算方法及應(yīng)用”專題交流研討會(huì)議。如何利用LAMMPS模擬分子擴(kuò)散、輸運(yùn)及兩相的相互作用，對(duì)計(jì)算和實(shí)驗(yàn)的補(bǔ)充進(jìn)行預(yù)測(cè)指導(dǎo)；如何運(yùn)用VASP基本原理及計(jì)算進(jìn)行材料性能測(cè)試和新材料研究
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VASP 第一性原理計(jì)算方法與應(yīng)用
展開 Ashampoo.3D.CAD.Architecture.5.v5.5.0.02.1發(fā)現(xiàn)者軟件網(wǎng)
MOE的應(yīng)用范疇 MOE在生物信息學(xué)、化學(xué)信息學(xué)、高通量研究、分子設(shè)計(jì)、蛋白質(zhì)模擬、分子 模擬等領(lǐng)域都有應(yīng)用。在生物信息學(xué)方面如同源序列標(biāo)識(shí)、對(duì)比;化學(xué)信息學(xué)方面如結(jié)構(gòu)描述子計(jì)算及結(jié)構(gòu)相似性與差異性表征、構(gòu)象數(shù)據(jù)庫(kù) 、三維結(jié)構(gòu)查詢、藥效團(tuán)定位等;在高通量研究方面有高通量篩選分析、二叉構(gòu)效關(guān)系研究、組合化學(xué)分子庫(kù)合成等;在分子設(shè)計(jì)方面有活性 位點(diǎn)探測(cè)、分子對(duì)接、碎片分析等;在蛋白質(zhì)模擬方面有同源模擬、突變進(jìn)化、力學(xué)分析等;在分子模擬方面有力場(chǎng)和靜電勢(shì)分析、動(dòng)力學(xué)研 究、三維分子建造、分子表面研究等。除此以外，MOE在計(jì)算技術(shù)上還支持集成式和分布式運(yùn)算。
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CSI.ETABS.2015.v15.1.0.1250.Win32_64 2CD建筑結(jié)構(gòu)分析與設(shè)計(jì)軟件 ETABS是由CSI公司開發(fā)研制的房屋建筑結(jié)構(gòu)分析與設(shè)計(jì)軟件，ETABS已有近三十年的發(fā)展歷史，是美國(guó)乃至全球公認(rèn)的高層結(jié)構(gòu)計(jì)算程序，在世界范圍內(nèi)廣泛應(yīng)用，是房屋建筑結(jié)構(gòu)分析與設(shè)計(jì)軟件的業(yè)界標(biāo)準(zhǔn)。
展開 OkMap Desktop 13.12.1 1CD矢量和光柵地圖和不同類型的地圖投影.
、基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)
、化學(xué)信息學(xué)和數(shù)據(jù)庫(kù)、
組合化學(xué)和分子多樣性、NMR數(shù)據(jù)處理、化合物實(shí)體提供等多
種與藥物研究和開發(fā)相關(guān)的
方向，為用戶提供全面的藥物設(shè)計(jì)和生物化學(xué)研究的解決方案
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Materialise產(chǎn)品：
Materialise Magics v13.0-ISO 1CD(STL處理選項(xiàng)的自動(dòng)化工具)
Materialise Magics Tooling v5.1.1 1CD(完美的模具解決方案)
Materialise Magics Tooling Expert v2.1.1 CD（模具報(bào)價(jià)軟件）
Materialise Magics RP v12.01 Win32 1CD(用于快速成型的STL文件處理，自動(dòng)產(chǎn)生支撐等)
Materialise Magics RP v12.01 Win64 1CD
Materialise.Mimics.v10.0-ISO 1CD（一個(gè)CT和MRI圖像的顯示和分割工具，同時(shí)也可以將物體進(jìn)行3D渲染。
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