結(jié)晶動(dòng)力學(xué)模擬的案例
硅酸鹽晶體成核—用于模擬結(jié)晶動(dòng)力學(xué)的隱式玻璃模型
由于成核和生長過程十分復(fù)雜，模擬晶體微結(jié)構(gòu)演變，著實(shí)是一種挑戰(zhàn)。
來自美國康寧公司、賓州州立大學(xué)和阿貢國家實(shí)驗(yàn)室的跨學(xué)科團(tuán)隊(duì)，發(fā)展了隱式玻璃模型（IGM），其采用廣義Born模型，用連續(xù)介質(zhì)等效地替換了玻璃，使得模擬可以集中于研究原子生長團(tuán)簇以及可作為異相成核位點(diǎn)的未溶解雜質(zhì)的演變過程。他們將IGM模型應(yīng)用于幾種不同的系統(tǒng)，即二元硅酸鋇、二元硅酸鋰和三元鈉鈣硅酸鹽，并基于已有相圖驗(yàn)證了他們模擬得到的化合物。此外，他們還預(yù)測(cè)了偏硅酸鋰的形核團(tuán)簇，并用SEM觀察了成核的結(jié)構(gòu)，發(fā)現(xiàn)模擬得到的結(jié)構(gòu)與實(shí)驗(yàn)測(cè)量結(jié)果相符，從而證明了IGM模型用于晶體形核模擬的有效性。該文近期發(fā)表于npj Computational Materials4:59(2018)。
該文近期發(fā)表于npj Computational Materials 4: 59 (2018)，英文標(biāo)題與摘要如下，點(diǎn)擊左下角“閱讀原文”可以自由獲取論文PDF。
Implicit glass model for simulation of crystal nucleation for glass-ceramics
Matthew E. McKenzie, Sushmit Goyal, Troy Loeffler, Ling Cai, Indrajit Dutta, David E. Baker & John C. Mauro
Predicting crystal nucleation behavior in glass-ceramic materials is important to create new materials for high-tech applications.
展開 Moldex3D模流分析材料性質(zhì)與模型之結(jié)晶動(dòng)力學(xué)模型 (半結(jié)晶性材料適用)
開發(fā) Avrami 的理論的Nakamura方程被用在Moldex3D來描述結(jié)晶動(dòng)力，其模型描述為：
其中 K(T) 為非均勻結(jié)晶率常數(shù)；t1/2 為半結(jié)晶時(shí)間；T為溫度；R為通用氣體常數(shù)；ΔT = Tm - T 為冷卻溫度；f = 2T/( T + Tm)為修正因子；U*為結(jié)晶的相變化啟動(dòng)能量；T∞ 為結(jié)晶過程的環(huán)境溫度。依照Hoffman等的理論后兩參數(shù)的通用值分別為：U* = 6284 J/mol 和T∞=Tg - 30。
參考文獻(xiàn)
[1]Jianxin Guo , Ph. D. Dissertation in Mechanical Engineering, 2000 ,New Jersey Institute of Technology.
[2]Andrea Sorrentino, Ph. D. Dissertation in Chenmical Engineering, University of Salerno.
展開 《Nature Commun》：化學(xué)鍵在結(jié)晶和玻璃化動(dòng)力學(xué)方面的潛力
增加共價(jià)降低了六個(gè)數(shù)量級(jí)的結(jié)晶，并促進(jìn)了玻璃化。化學(xué)計(jì)量比的依賴性與材料的性質(zhì)有關(guān)，如晶體相的光學(xué)性質(zhì)和鍵指示符，相鄰原子間共有的電子數(shù)。量子化學(xué)圖解釋了這些趨勢(shì)，并為設(shè)計(jì)結(jié)晶動(dòng)力學(xué)提供了藍(lán)圖。
圖1 不同硫?qū)倩衔锏?em>結(jié)晶速度。
圖2 最小結(jié)晶時(shí)間τ。
圖3 玻璃化相變。
圖4 動(dòng)力學(xué)隨鍵指標(biāo)的變化。
綜上所述，最后，擴(kuò)展化學(xué)鍵量詞(ES和ET)的使用，以描述其他類別材料的結(jié)晶和玻璃化動(dòng)力學(xué)應(yīng)該是有益的。四面體配位、共價(jià)體系和金屬是否也有類似的趨勢(shì)，即能否根據(jù)共享和轉(zhuǎn)移電子數(shù)量的定量數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)它們的玻璃化和結(jié)晶行為？如果這個(gè)目標(biāo)能夠?qū)崿F(xiàn)，這將為制造玻璃和晶體的藝術(shù)提供一種新的科學(xué)視角。（文：水生）
本文來自微信公眾號(hào)“材料科學(xué)與工程”。歡迎轉(zhuǎn)載請(qǐng)聯(lián)系，未經(jīng)許可謝絕轉(zhuǎn)載至其他網(wǎng)站。
展開 清華大學(xué)徐軍課題組封面綜述：從動(dòng)力學(xué)角度闡述聚合物結(jié)晶的次級(jí)成核過程
近日，清華大學(xué)化工系徐軍副教授應(yīng)邀在《Polymer Crystallization》雜志上發(fā)表了題為“Secondary nucleation in polymer crystallization: A kinetic view”的綜述文章，為TOC所繪的漫畫圖片“不甘躺平-結(jié)晶之路”被選為期刊封面。聚合物分子如何找到通往結(jié)晶成核的正確途徑？這是一個(gè)艱難的旅程。如圖1所示，聚合物分子嘗試了各種可能的路徑來到達(dá)目的地，前仆后繼，但最快同時(shí)也是熱力學(xué)穩(wěn)定（自由能下降）的路徑將最終勝出，捷足先登。
圖1 “不甘躺平-結(jié)晶之路”漫畫被用作雜志的封面圖片
晶體表面的次級(jí)成核在聚合物結(jié)晶過程中起著至關(guān)重要的作用，它決定了晶體生長前沿的片晶厚度和球晶的徑向生長速率。在過去的幾十年里，人們對(duì)次級(jí)成核進(jìn)行了深入的研究，但是對(duì)其分子機(jī)制和動(dòng)力學(xué)的理解還不全面。
本綜述文章首先簡要回顧了聚合物結(jié)晶次級(jí)成核的主要研究進(jìn)展，總結(jié)了主要的結(jié)晶理論模型，討論了影響柔性聚合物分子鏈在晶體生長前沿次級(jí)成核時(shí)的熱力學(xué)和動(dòng)力學(xué)因素，并從動(dòng)力學(xué)角度討論了一些遺留問題。通過對(duì)動(dòng)力學(xué)進(jìn)行分析，揭示了聚合物分子鏈成核與小分子晶體成核的區(qū)別。由于結(jié)晶單元間的共價(jià)鍵連接，如果最小穩(wěn)定核由一根高分子鏈上的單元結(jié)晶而成，那么其成核速率將由最小穩(wěn)定核而不是臨界核決定。
展開 
BCC點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)梁單元Abaqus壓縮仿真模擬-顯示動(dòng)力學(xué)質(zhì)量縮放 ￥19.89
本文通過abaqus顯示動(dòng)力學(xué)的方法對(duì)BCC結(jié)構(gòu)進(jìn)行壓縮仿真模擬，同時(shí)為減小計(jì)算量，采用梁單元模擬點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)，壓頭設(shè)置為剛性面，添加質(zhì)量縮放，加快運(yùn)算速度，為點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)壓縮模擬提供一種便捷方法。
1. 建立BCC點(diǎn)陣模型,以單胞尺寸5X5X5為例。
a.首先建立立方體實(shí)體，然后對(duì)實(shí)體進(jìn)行處理，得到點(diǎn)陣單胞點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)。
b.建立單胞BCC梁單元點(diǎn)陣模型,然后進(jìn)行刪除面的操作，得到單胞BCC點(diǎn)陣結(jié)構(gòu)，接下來進(jìn)行陣列操作，得到最大外形尺寸為25x25x25的點(diǎn)陣壓縮模擬試件。
C.建立剛性壓板，設(shè)置參考點(diǎn)，模擬萬能試驗(yàn)機(jī)壓頭，剛性單元不參與計(jì)算，不影響計(jì)算結(jié)果，加快運(yùn)算速度。
2. 裝配，按壓縮試驗(yàn)進(jìn)行裝配，從上到下依次為壓板-點(diǎn)陣-壓板。
3.設(shè)置材料屬性，本文為鈦合金TC4，密度4.43e-9Tone/mm3,彈性模量為118000MPa，泊松比0.3，應(yīng)力應(yīng)變值見下表所示。
設(shè)置截面屬性Beam，定義截面半徑0.5mm
指派截面，定義方向[1,2,3]，完成材料屬性設(shè)置。
4.設(shè)置分析步Dynamic,Explicit，時(shí)間設(shè)置為5s，以每秒1mm的速度進(jìn)行壓縮模擬，開啟質(zhì)量縮放為1e-5，歷程輸出勾選位移和力，以便輸出力-位移曲線，然后計(jì)算相應(yīng)的應(yīng)力-應(yīng)變曲線。
5.設(shè)置相互作用-切向行為和法向行為，摩擦系數(shù)為0.3，設(shè)置通用接觸。
以下部分為付費(fèi)部分
展開 使用火災(zāi)動(dòng)力學(xué)模擬器(FDS)完成火災(zāi)CFD模擬課程（英） ￥15
使用火災(zāi)動(dòng)力學(xué)模擬器(FDS)完成火災(zāi)CFD模擬課程（英）
發(fā)布于2026年3月
MP4 | 視頻：h264, 1920x1080 | 音頻：AAC, 44.1 KHz, 雙聲道
語言：英語 | 時(shí)長：12小時(shí)45分鐘 | 大小：9.42 GB
**FDS實(shí)用火災(zāi)建模 — 熱釋放速率、暖通空調(diào)、控制系統(tǒng)及高級(jí)CFD應(yīng)用**
**您將學(xué)到什么**
- 使用FDS和 PyroSim 構(gòu)建完整的火災(zāi)模擬模型，從幾何設(shè)置到結(jié)果解讀。
- 設(shè)計(jì)結(jié)構(gòu)化計(jì)算網(wǎng)格，并利用特征火災(zāi)直徑計(jì)算合適的單元尺寸。
- 定義材料、反應(yīng)、組分和表面，以準(zhǔn)確模擬火災(zāi)增長和煙氣行為。
- 布置和配置測(cè)量裝置，用于測(cè)量溫度、能見度、煙氣層高度、熱釋放速率和流量。
**課程要求**
- 具備傳熱學(xué)和流體力學(xué)等工程基礎(chǔ)的基本理解會(huì)有幫助，但非強(qiáng)制要求。
- 無需具備FDS或PyroSim的先驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)。課程循序漸進(jìn)地涵蓋基礎(chǔ)知識(shí)和高級(jí)概念。
- 需要一臺(tái)能夠運(yùn)行PyroSim和FDS模擬的計(jì)算機(jī)。
- 必須具備學(xué)習(xí)計(jì)算火災(zāi)建模并應(yīng)用工程判斷的意愿。
**課程描述**
火災(zāi)建模在性能化消防安全設(shè)計(jì)中已不再是可選項(xiàng) — 它是必不可少的。
這門關(guān)于火災(zāi)動(dòng)力學(xué)模擬器(FDS)的完整專業(yè)課程，將帶您從零基礎(chǔ)走向高級(jí)實(shí)際火災(zāi)建模應(yīng)用。無論您是消防工程師、CFD工程師、機(jī)械工程師、安全顧問還是研究人員，本課程旨在讓您在構(gòu)建、運(yùn)行和解讀火災(zāi)模擬方面具備專業(yè)能力。
我們從火災(zāi)動(dòng)力學(xué)基礎(chǔ)、燃燒原理以及理解FDS工作原理所需的CFD基礎(chǔ)知識(shí)開始。
展開 分子動(dòng)力學(xué)模擬介紹
分子動(dòng)力學(xué)簡介：
分子動(dòng)力學(xué)方法是一種計(jì)算機(jī)模擬實(shí)驗(yàn)方法，是研究凝聚態(tài)系統(tǒng)的有力工具。該技術(shù)不僅可以得到原子的運(yùn)動(dòng)軌跡，還可以觀察到原子運(yùn)動(dòng)過程中各種微觀細(xì)節(jié)。它是對(duì)理論計(jì)算和實(shí)驗(yàn)的有力補(bǔ)充。廣泛應(yīng)用于材料科學(xué)、生物物理和藥物設(shè)計(jì)等。經(jīng)典MD模擬，其系統(tǒng)規(guī)模在一般的計(jì)算機(jī)上也可達(dá)到數(shù)萬個(gè)原子，模擬時(shí)間為納秒量級(jí)。2006年進(jìn)行了三千二百億個(gè)原子的模擬（IBMlueGene/L）。
分子動(dòng)力學(xué)總是假定原子的運(yùn)動(dòng)服從某種確定的描述，這種描敘可以牛頓方程、拉格朗日方程或哈密頓方程所確定的描述，也就是說原子的運(yùn)動(dòng)和確定的軌跡聯(lián)系在一起。在忽略核子的量子效應(yīng)和Born-Oppenheimer絕熱近似下，分子動(dòng)力學(xué)的這一種假設(shè)是可行的。所謂絕熱近似也就是要求在分子動(dòng)力學(xué)過程中的每一瞬間電子都處于原子結(jié)構(gòu)的基態(tài)。要進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬就必須知道原子間的相互作用勢(shì)。
在分子動(dòng)力學(xué)模擬中，我們一般采用經(jīng)驗(yàn)勢(shì)來代替原子間的相互作用勢(shì)，如Lennard-Jones勢(shì)、Mores勢(shì)、EAM原子嵌入勢(shì)、F-S多體勢(shì)。然而采用經(jīng)驗(yàn)勢(shì)必然丟失了局域電子結(jié)構(gòu)之間存在的強(qiáng)相關(guān)作用信息，即不能得到原子動(dòng)力學(xué)過程中的電子性質(zhì)。
詳細(xì)介紹請(qǐng)見附件。
2、分子模擬的三步法和大致分類
三步法：
第一步：建模。包括幾何建模，物理建模，化學(xué)建模，力學(xué)建模。初始條件的設(shè)定，這里要從微觀和宏觀兩個(gè)方面進(jìn)行考慮。
第二步：過程。這里就是體現(xiàn)所謂分子動(dòng)力學(xué)特點(diǎn)的地方。包括對(duì)運(yùn)動(dòng)方程的積分的有效算法。對(duì)實(shí)際的過程的模擬算法。關(guān)鍵是分清楚平衡和非平衡，靜態(tài)和動(dòng)態(tài)以及準(zhǔn)靜態(tài)情況。
第三步：分析。這里是做學(xué)問的關(guān)鍵。你需要從以上的計(jì)算的結(jié)果中提取年需要的特征，說明你的問題的實(shí)質(zhì)和結(jié)果。因此關(guān)鍵是統(tǒng)計(jì)、平均、定義、計(jì)算。
展開 分子動(dòng)力學(xué)仿真模擬
圖1：利用分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算的材料（此材料為Cr2O3固體）各種機(jī)械性質(zhì)。
2. 熱力學(xué)性能：聲子態(tài)密度，比熱容（等容或等壓），熔點(diǎn)，熱膨脹系數(shù)（1D-3D），等溫壓縮系數(shù)，熱導(dǎo)率（僅限非金屬材料，例如石墨烯等），等等。
圖2：利用分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算的材料（此材料為銅-銀納米顆粒）熱力學(xué)各性質(zhì)。
· 各尺度材料的動(dòng)力學(xué)過程模擬與研究：
1. 材料的融化過程：例如金屬納米顆粒，高熵合金，等等。
圖3：利用分子動(dòng)力學(xué)模擬的銅銀納米顆粒以及鋁-銅-鐵-鉻-鎳高熵合金納米顆粒的融化過程。
2. 顆粒在不同條件下的燒結(jié)過程：例如不同溫度，壓力 ，顆粒的大小，等等。
圖4：利用分子動(dòng)力學(xué)模擬的銅銀納米顆粒及納米線在不同溫度下的燒結(jié)過程
3. 焊接過程：例如, 鎳、鋁納米顆粒與Inconel 718合金的浸潤或者焊接過程
圖5：利用分子動(dòng)力學(xué)模擬的鎳納米顆粒在鎳基板上的浸潤過程以及焊接Inconel 718合金的過程
4. 固相或液相擴(kuò)散過程：例如θ’-Al2Cu沉積相在鋁合金中的擴(kuò)散及生長，可計(jì)算擴(kuò)散系數(shù)，擴(kuò)散激活能等。
圖6：利用分子動(dòng)力學(xué)模擬的θ′-Al2Cu在鋁合金中的擴(kuò)散過程。
來源：海納有限元服務(wù)號(hào)
展開 腐蝕介質(zhì)擴(kuò)散行為的分子動(dòng)力學(xué)模擬
關(guān)鍵詞：Materials Studio，分子動(dòng)力學(xué)模擬，均方位移，擴(kuò)散系數(shù)
內(nèi)容摘要：
? 腐蝕是工業(yè)生產(chǎn)過程中一個(gè)極為突出的問題，造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失和安全隱患。在眾多的防腐蝕措施之中，添加緩蝕劑是廣泛采用的方法之一。
? 常用的緩蝕劑主要為吸附型緩蝕劑，它可穩(wěn)定吸附在金屬表面并在金屬表面形成致密的保護(hù)膜，阻礙腐蝕介質(zhì)向金屬表面遷移擴(kuò)散，以達(dá)到抑制或延緩腐蝕的目的。
計(jì)算方法：本文所有模擬工作均由 Accelrys 公司開發(fā)的Materials Studio 軟件包完成，力場為 COMPASS力場，它能夠準(zhǔn)確給出孤立體系和凝聚態(tài)的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)。
利用 Visualizer 模塊構(gòu)建基礎(chǔ)分子模型
腐蝕介質(zhì)粒子：HCO3- 、H3O+、H2O以及咪睉啉類緩蝕劑分子
建立界面模型
利用 amorphous cell 模塊分別構(gòu)建包含緩蝕劑分子的無定形組織結(jié)構(gòu)，采用(NVT)進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬，平衡后統(tǒng)計(jì)體系密度的平均值，并把該值作為計(jì)算體系中緩蝕劑膜的密度。模擬體系由三層結(jié)構(gòu)組成:第一層為 Fe(001)面；第二層為包含80個(gè)緩蝕劑分子和1個(gè)腐蝕介質(zhì)粒子的無定形組織結(jié)構(gòu)；第三層是厚度為 2nm的真空層。如圖為本文模擬所需的計(jì)算模型：
模型結(jié)構(gòu)優(yōu)化
使用Forcite 模塊對(duì)上述模型分別進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化，使其達(dá)到最佳的模型結(jié)構(gòu)和穩(wěn)定的能量體系。
展開 Lsdyna-近場動(dòng)力學(xué)模擬玻璃破碎 ￥399
付費(fèi)內(nèi)容為算列，求解文件無版本限制，另有答疑服務(wù)。
基于GROMACS的氯化鈉氣液界面分子動(dòng)力學(xué)模擬
關(guān)鍵詞：GROMACS；NaCl；氣液界面; 分子動(dòng)力學(xué)；packmol
海水淡化、海氣相互作用及儲(chǔ)能電解質(zhì)等領(lǐng)域，需要研究鹽溶液在氣?液界面處的微觀結(jié)構(gòu)和動(dòng)態(tài)行為。相比宏觀實(shí)驗(yàn)，分子動(dòng)力學(xué)（MD）模擬可直接揭示 Na+、Cl- 以及水分子在界面處的分布與取向，為理解表面張力、離子特異性（Hofmeister 效應(yīng)）等提供原子級(jí)證據(jù)。而GROMACS作為一種高效的開源MD模擬軟件，在模擬鹽水溶液氣液界面方面具有強(qiáng)大的技術(shù)支持。本案例基于GROMACS，研究氯化鈉氣液界面體系中離子和水分子的分布情況。
初始模型的構(gòu)建
在本案例中，我們模擬對(duì)象為氯化鈉水溶液-真空體系，水分子采用spce水模型。
展開 
模擬普利司通世界太陽能挑戰(zhàn)賽的旋轉(zhuǎn)輪空氣動(dòng)力學(xué)
模擬提供了對(duì)旋轉(zhuǎn)輪周圍流場的詳細(xì)了解。在車輪前部和輪拱周圍觀察到一個(gè)小的再循環(huán)區(qū)。在這里，來自上游的氣流在車輪和輪拱之間匯合成單一的氣流。
流線按前輪胎周圍的速度著色。
結(jié)論
通過與 Fidelity Hexpress 和 Fidelity Flow 的合作，可以更深入地了解旋轉(zhuǎn)輪周圍的流場及其對(duì)壓力阻力的影響。車輪的旋轉(zhuǎn)導(dǎo)致車輪阻力降低 40%，整車的C d A 降低 10%。該案例研究增加了我們對(duì)仿真解決方案的信心，因?yàn)榻Y(jié)果非常接近實(shí)驗(yàn)測(cè)試（道路測(cè)試和風(fēng)洞測(cè)試）。
參考
Borgions K., Holemans T.，太陽能汽車旋轉(zhuǎn)輪的空氣動(dòng)力學(xué)模擬。KU Leuven，工程技術(shù)學(xué)院。碩士論文, 2019.
Vandervelpen E., Uten J.，用于太陽能汽車空氣動(dòng)力學(xué)模擬的湍流模型測(cè)試，KU Leuven，工程技術(shù)學(xué)院。碩士論文, 2018.
文章來源：cadence博客
展開 材料模擬及分子動(dòng)力學(xué)技術(shù)講解及入門解析
材料模擬及分子動(dòng)力學(xué)核心技術(shù)實(shí)戰(zhàn)
2020年10月15日— 2020年10月18日 遠(yuǎn)程在線實(shí)戰(zhàn)
手機(jī)（微信同號(hào)）：17777853361 官方咨詢QQ：334700349
lammps分子動(dòng)力學(xué)QQ群號(hào):753267868 （加群備注：楊春嬌邀請(qǐng)）
基于GROMACS的冰的拉伸分子動(dòng)力學(xué)模擬
圖4 拉伸過程冰晶胞的變化
圖5 拉伸過程冰晶胞的能量變化
結(jié)語
通過GROMACS分子動(dòng)力學(xué)模擬，本案例成功探究了冰晶胞拉伸的演變過程。對(duì)于相關(guān)領(lǐng)域的研究人員和工程師來說，本案例提供了一個(gè)有力的工具，可以為解決實(shí)際問題提供理論依據(jù)和技術(shù)支持。
最后，有相關(guān)需求歡迎通過公眾號(hào)"320科技工作室"與我們聯(lián)絡(luò)。
分子動(dòng)力學(xué)模擬-礦物表面潤濕性
關(guān)鍵詞：頁巖油，分子動(dòng)力學(xué)，lammps，gromacs，界面張力，最小混相壓力
摘要：分子模擬方法在探究納米尺度下分子間相互作用方面展現(xiàn)出巨大的技術(shù)優(yōu)勢(shì)。因此，本文采用分子動(dòng)力學(xué)模擬方法，研究礦物表面潤濕性。
通過我這套LAMMPS, GROMACS代碼，你可以實(shí)現(xiàn)不同氛圍氣體，不同溫度下的潤濕性-接觸角計(jì)算。這套代碼還可以把氣體換成油，水中加入表面活性劑，助溶劑，離子等，進(jìn)行研究。
MS，LAMMPS，GROMACS均可以實(shí)現(xiàn)，這里介紹LAMMPS，GROAMCS流程。
1，初始模型構(gòu)建：初始模型是氣-水-壁面模型，使用PACKMOL構(gòu)建，使用lammps也可以用lammps建模
2，選擇力場：CO2可用TRAPPE，EPM2力場，H2O用SPC/E力場，油用OPLS-AA力場，黏土礦物用clayff力場
3，進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬：能量最小化-平衡動(dòng)力學(xué)-生產(chǎn)動(dòng)力學(xué)
4，統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)，可分析密度分布，擴(kuò)散系數(shù)，相互作用力參數(shù)等
5，提供LAMMPS in文件，data文件; GROMACS：mdp，top，inp，pdb，gro，xtx等文件
首先設(shè)置一個(gè)初始尺寸較大的模擬盒子，如圖1所示。
體系設(shè)置為NVT系綜，可以設(shè)置多個(gè)溫度，觀察溫度的影響。壓力由氣體數(shù)量決定。麻煩點(diǎn)可以在體系上面加一個(gè)板子，用NEMD壓板子。這個(gè)體系8ns就穩(wěn)定了。
圖2是 6ns的穩(wěn)定構(gòu)象。
圖3 是接觸角的二維密度分布。
圖4 是密度分布，還可分析相互作用能
圖5 顯示了親水礦物可能不存在接觸角
圖6-圖7 是溫度-壓力對(duì)接觸角的影響。
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