HPC集群部署的案例
部署Windows HPC，并實現在Ansys 中向Win HPC提交作業 ￥68
4、Windows HPC的特點
Windows 高性能計算服務器，提供了HPC Pack 軟件開發工具包、作業調度系統和管理系統。其最大的特點是與windows server深度融合，可以快速部署HPC。大多數進行數值模擬的小伙伴，可能不熟悉Linux，只能簡單操作windows，這種情況下使用微軟HPC能大大降低難度。
部分有限元軟件（如Marc），也提供了客戶端軟件，可以在多臺計算機上并行，但是這個只是“松散”的耦合，各計算機都是基于家用windows，在穩定性、安全性上遠不如windows server，也不如域架構下的登錄認證方便。另外，大部分有限元軟件，也提供手動并行，需要自己安裝MPI，設置“host”文件（設置每臺計算機的名稱、核心數量、工作目錄）和共享的工作目錄，使用起來非常難用。
5、HPC在數值模擬中的作用
HPC在本質上是屬于“用空間換時間”，通過多計算機并行來減少計算時間。在數值模擬過程中，特別是非線性計算時，采用單機計算時間可能會超過一周，使用多臺計算機就會縮短計算時間。
要充分發揮HPC的性能，有限元軟件對HPC（包括GPU）的支持也很重要。目前在各大有限元軟件中Ansys對微軟HPC的支持最好。
6、微軟HPC部署
先說說自己的HPC規劃，共有四臺計算機，具體功能分配情況如下：
存儲節點：使用1臺較舊的計算機，CPU是i7-8700k，主板是華碩（華碩網卡通常采用Intel芯片組，在server以下無法正常安裝驅動），使用24盤位存儲機箱（帶背板），1張LSI 直通卡（二手），1張聯想擴展卡（二手），電源為臺達 650W金牌電源。兩塊10T希捷企業硬盤（全新白盤），在windows server中使用存儲池，鏡像保存數據，通過共享服務提供網絡存儲。
展開 Matlab集群提交教程--HPC(Cluster集群系統)
1. pbs文件
"matlab.pbs" :
matlab.zip
注：
1：任務名。
2：使用的的節點和內核數。
3：m文件名，不包含“.m”后綴。
2. m文件
計算中心提交后臺計算，無法實時顯示圖片，涉及到圖片保存的，要在m文件中設置不顯示并保存圖片。
"your_script.m" :
注：圖示僅為其中一種實現方法，不唯一。
3. 提交
（1）將pbs文件及用到的所有m文件上傳至計算中心同一目錄下；
（2）“qsub matlab.pbs”命令提交；
（3）“cat matlab.o1234”查看進度及錯誤。
Comsol集群提交教程--HPC(Cluster集群系統) ￥2
上傳文件
使用winscp將mph文件和pbs文件上傳到集群服務器。
兩文件必須在同一文件夾！
example.mph為comsol的input文件。
comsol.pbs為集群提交腳本模板。
3. 提交任務
使用ssh工具(本例為putty)登錄到集群，并使用cd，切換到上述文件夾。
使用命令下列命令提交。
qsub comsol.pbs
4. 查看狀態命令
qstat -a 查看提交狀態
NDS為節點數，TSK為總核數，S列為狀態，R為正在運行，C為完成或錯誤。
tail -f example.log 實時查看計算進度
Fluent集群提交教程--HPC(Cluster集群系統) ￥2
Fluent集群提交教程--HPC(Cluster集群系統)
目錄：
1. 所需文件
2. 修改文件
3. 提交計算
4. 處理user_define_function.c（付費查看）
所需文件
fluent.cas
fluent.dat
fluent.jou
fluent腳本文件，可在Fluent圖形界面錄制，或手動編寫。
編寫方法參照幫助手冊，或：
http://www.360doc.com/content/17/1024/20/45841895_697806748.shtml
http://forums.caenet.cn/showtopic-532630.aspx
(付費視頻)：https://www.yqgqt.org.cn/college/video/c11694
fluent.pbs
fluent集群提交腳本，見附件(付費查看)
2. 修改文件
將上述文件上傳到集群服務器，修改fluent.pbs，完整文件見附件，亦可先修改再上傳。
#PBS -N YourJobName 任務名，自定
#PBS -l nodes=2:ppn=15 使用節點數2，每節點15核，自定
#PBS -q high 使用high隊列，自定
JOU = "fluent.jou" jou文件名
MODE = "3ddp" 3d:三維單精度，3ddp:三維雙精度，二維類似
3. 提交計算
若案例需用到自定義函數，先進行第4步，再提交。
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