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登錄ansys云平臺計算的案例
AlphaFold2“登陸”北鯤云平臺,云計算助力科研大放異彩
“工欲善其事,必先利其器”,作為將云計算與生命科學領域研究相結合的倡導者,北鯤云超算平臺已經安裝了AlphaFold2,并且開放了Nvidia Tesla A100、 Nvidia Tesla V100 的GPU資源,幫助研究人員解析新蛋白結構。
目前,為了讓用戶進一步為體驗AlphaFold2使用便利,北鯤云從行業發展的實際情況出發,正式部署上線了AlphaFold2。在北鯤云的平臺之上,用戶無需安裝AlphaFold2,僅需花費短短一分鐘的實踐,在瀏覽器火鶴北鯤云客戶端都可以登錄北鯤云超算平臺,啟動工作站,并加載AlphaFold2模板,即可啟用AlphaFold2進行蛋白質結構預測。便捷的使用環境,進一步減少了各種冗余步驟,為用戶有效節省操作時間,深入探索生命科研領域的奧妙之處。
不僅如此,北鯤云堅持以“提升算力”為發展目標,通過并行AI云通過云主機平臺和裸金屬云服務等多平臺,提供A100\V100等多型號海量算力資源,支持多機多卡調度,免費使用3TB數據集,一鍵賬號登錄,全面考慮廣大用戶的操作痛點問題,不斷優化平臺使用的便捷程度。
在使用AlphaFold2的過程當中,北鯤云技術支持員表示,仍有許多的研究人員,會遇到操作問題,以及軟件運行問題,北鯤云也繼續堅持用戶體驗為重,為用戶提供為7*24小時在線技術支持,為科研工作者提供更多便捷的服務。
展開 直播推薦:面向工程仿真的高性能云計算丨達索3DEXPERIENCE云平臺概述
一、面向工程仿真的高性能云計算
1.工程仿真的高性能計算機需求
2.仿真轉向云化和平臺化趨勢
3.仿真和計算架構。
4.本地與云高性能計算機成本比較。
5.達索系統SIMULIA云高性能計算機解決方案。
6.總結
二、達索3DEXPERIENCE云平臺概述
1.達索云平臺架構
2.達索云平臺部署策略
3.基于達索云平臺的設計
適用人群
機械工程師、有限元分析師、對工程仿真云計算感興趣的工程師或高校師生。
展開 計算化學:如何在云平臺上計算聲子譜
內容摘自北鯤云五月份直播內容【聲子譜的計算、后處理與分析實例】 另有文章【不同壓強下ZnO的聲子譜計算及其收斂性測試】可在發布的內容中查閱。
所有計算皆在北鯤云超算平臺上完成。
計算聲子譜所需軟件:
1 VASP(Vienna Ab-initio Simulation Package)
結構計算與聲子譜基本計算
2 phonopy 聲子譜的計算與后處理
3 vaspkit 各種后處理
4 Origin,python,matlab 等畫圖軟件
選取標準原胞計算
意義:不容易出錯且節省計算時間嗎,結果比較漂亮
方法:
1 vaspkit-6-602
2 phonopy --symmetry
高精度結構優化
擴胞
原因:VASP直接計算的是Gamma點的聲子情況。
如何擴胞:Phonopy –d –dim=“x x x” –c POSCAR-unitc
擴多大:網傳10A原則
有限差分法/有限位移法/密度泛函微擾理論
后處理:繪制聲子譜圖
提取力常數:
命令:phonopy --fc vasprun.xml
調整控制文件
name.conf M_NAME = l Cr DIM = 2 2 1 BAND = 0.500 0.000 -0.333 0.000 0.000 0.000 0.000 0.667 0.000 FORCE_CONSTANTS = READ BAND_POINTS = 51 #BAND_LABELS = X $\Gamma$ L #DOS = .TRUE.
展開 北鯤云超算平臺如何將云計算與高性能計算結合
近幾年,隨著“上云“概念的普及,而且云計算技術逐漸趨于成熟,許多有自建機房或者集群的高性能計算行業企業都開始上云。但是因為對于云技術的不了解,這些企業非常需要一個完善的企業上云方案。北鯤云計算有限公司就是的能夠為高性能計算行業企業提供一站式上云解決方案的公司。
那么北鯤云如何將云計算與高性能計算結合起來呢?在北鯤云年初獲得Pre-A輪融資時,談及為何選擇云超算作為創業方向時,創始人馮建新表示,在多年的工作中發現當前的云計算市場上企業在云資源管理方面有很多可以提高和優化的工作。從需求側來看,企業內部通常通過預定系統來申請和釋放云服務器資源,但資源申請無法實時匹配,經常會出現資源過剩,亦或不足導致大量計算任務排隊,工作效率較低。 從供給端來看,公有云廠商有大量的云服務器處于空閑當中,據統計云服務器平均空閑比高達50%左右。北鯤云基于此打造了北鯤云一站式云超算平臺,當用戶提交任務時,無需提前購買資源,從北鯤云超算平臺里自動匹配到最合適的公有云資源去執行高性能計算任務,當任務執行完畢的時候自動釋放資源,大幅提高了公有云廠商云服務器的利用率。并且北鯤云針對國內市場的特點,最早提出了競價服務器管理方案,通過此機制,企業可以提供比同行更低報價的算力解決方案。
企業可以通過北鯤云超算平臺提供的私有模式、混合模式以及云上模式將企業異構的資源整合,并隨之將業務遷移上云。北鯤云超算平臺在這個階段重塑了硬件資源層,解決了硬件資源彈性伸縮問題,并且能夠將上層應用開發和運維產生根本變革,將云上的彈性、敏捷性等云的特性釋放。從而大幅提高企業的工作效率。
北鯤云超算平臺通過那幾種模式將云計算與高性能計算結合呢?有以下三種方式:
北鯤云SaaS模式:為所有有高性能計算需求的客戶提供算力SaaS服務。
展開 
北鯤云超算平臺如何將云計算與高性能計算結合
近幾年,隨著“上云“概念的普及,而且云計算技術逐漸趨于成熟,許多有自建機房或者集群的高性能計算行業企業都開始上云。但是因為對于云技術的不了解,這些企業非常需要一個完善的企業上云方案。北鯤云計算有限公司就是的能夠為高性能計算行業企業提供一站式上云解決方案的公司。
那么北鯤云如何將云計算與高性能計算結合起來呢?在北鯤云年初獲得Pre-A輪融資時,談及為何選擇云超算作為創業方向時,創始人馮建新表示,在多年的工作中發現當前的云計算市場上企業在云資源管理方面有很多可以提高和優化的工作。從需求側來看,企業內部通常通過預定系統來申請和釋放云服務器資源,但資源申請無法實時匹配,經常會出現資源過剩,亦或不足導致大量計算任務排隊,工作效率較低。 從供給端來看,公有云廠商有大量的云服務器處于空閑當中,據統計云服務器平均空閑比高達50%左右。北鯤云基于此打造了北鯤云一站式云超算平臺,當用戶提交任務時,無需提前購買資源,從北鯤云超算平臺里自動匹配到最合適的公有云資源去執行高性能計算任務,當任務執行完畢的時候自動釋放資源,大幅提高了公有云廠商云服務器的利用率。并且北鯤云針對國內市場的特點,最早提出了競價服務器管理方案,通過此機制,企業可以提供比同行更低報價的算力解決方案。
企業可以通過北鯤云超算平臺提供的私有模式、混合模式以及云上模式將企業異構的資源整合,并隨之將業務遷移上云。北鯤云超算平臺在這個階段重塑了硬件資源層,解決了硬件資源彈性伸縮問題,并且能夠將上層應用開發和運維產生根本變革,將云上的彈性、敏捷性等云的特性釋放。從而大幅提高企業的工作效率。
北鯤云超算平臺通過那幾種模式將云計算與高性能計算結合呢?有以下三種方式:
北鯤云SaaS模式:為所有有高性能計算需求的客戶提供算力SaaS服務。
展開 如何在云計算平臺上完成分子對接
我們設置為4則表示vina最多計算到與最優模型的能量差值為4就終止計算了。
exhaustiveness:用來控制對接的細致程度,默認值是8,設置值與電腦的配置相關,影響計算時間。
num_modes:最多生成多少個模型。此時,6NJS文件夾中應該包括配體分子,受體分子,參數文件,vina程序共7個文件。
執行計算
打開北鯤云超算平臺,進入控制臺
這里選擇SSH連接,通過SSH鏈接啟動一個管理節點,并連接進入管理節點。
通過win+R進入運行窗口,輸入“cmd”進入命令行窗口,此時默認文件夾一般為C盤,
再輸入
CD C:\AutoDock\6NJS
回車,進入該文件夾。
輸入
vina--config 6njs.conf
回車,即可執行分子對接計算。
等待計算完成,一共得到10個模型結果,包括對接結合能分數,RMSD值,我們可以看到有多個結果的RMSD都小于2埃,說明本次分子對接結果還是比較可靠的。
在北鯤云超算平臺完成分子對接計算的過程還是比較簡單的,只要按照上述步驟即可完成,中途如果遇到問題可以隨機聯系我們的技術支持,技術支持隨時在線解決大家的疑惑。
除了簡便的操作之外,在平臺上還有海量資源供大家選擇,不用擔心要排隊或者ddl趕不上啦!
展開 招募|EasyCAE共享云計算平臺校園代理虛位以待
招募|EasyCAE共享云計算平臺校園代理虛位以待
2017-11-08 EasyCAEEASYCAE云計算平臺
每當生活費不夠用跟父母開口時,
你是否內心自責覺得該為家里做些分擔?
?
在想要經濟獨立決定選擇兼職時,
你是否猶豫做個飯店忙碌的服務員?
還是奇裝異服的派單員?
?
畢業設計運算求解一籌莫展時,
你是否感慨學校資源有限?
發現了Easycae云平臺這樣的神器時,
你是否希望折扣可以再低一些?
今天,這些問題都將迎刃而解!
因為下面你將看到的是:豐厚的經濟收益…
與專業緊密相關的學習工具…
個人綜合素質與能力的全面提升…
國內最膩害的CAE平臺僅屬于你的超低折扣…
靈活的工作給你時間和空間的最大自由…
我們是誰?
藍威技術致力于為全球的工程師提供便捷和經濟的仿真工具,為更多的企業和政府客戶提供開放、共享、高性能仿真分析和智能決策服務,利用互聯網技術釋放行業知識、CAE工具和超級計算的巨大價值。
你的任務:
在校進行藍威充值卡產品的推廣與銷售;
推廣包括但不限于口頭推介、學生主流社交媒體發帖;
配合公司統一的高校市場推廣活動的開展(場地申請、人員招募、物料準備等);
接受公司的產品培訓,包括線上與線下兩種方式。
你的收獲:
高額提成,多勞多得,上不封頂;
免費參加公司組織的各類培訓;
個人綜合實力提升,增加就業競爭力;
提供實習證明,表現優異可獲獎狀及就業推薦信;
免試進入公司就業的機會。
展開 深度解讀 NVIDIA 加速計算平臺如何推動人工智能、元宇宙、云技術和可持續計算的下一波浪潮
黃仁勛將深度解讀 NVIDIA 加速計算平臺如何推動人工智能、元宇宙、云技術和可持續計算的下一波浪潮。
NVIDIA 創始人兼首席執行官黃仁勛的 GTC 主題演講將于北京時間 3 月 21 日 23:00 全球首播,3 月 22 日 10:00 中國重播。
掃碼或點擊下方鏈接
鏈接:https://www.nvidia.cn/gtc-global/keynote/?ncid=ref-io-415248
探索全球思想領袖的宏圖大略
您還可以通過本次 GTC 探索來自各行各業思想領袖的宏圖大略。重磅演講嘉賓包括 DeepMind 創始人兼首席執行官 Demis Hassabis、Open AI 聯合創始人兼首席科學家 Ilya Sutskever、Adobe 首席產品官 Scott Belsky,和 IBM 公司首席信息官 Kathryn Guarini 等。
更多重磅專題演講將接連登場,切勿錯過全新的突破性內容、由專家主持的會議和必看的主題演講。
展開 資源控制在大數據和云計算平臺中的應用
用Kubernetes部署的容器平臺需要提前定義資源配額,否則容器可以使用到宿主機的所有資源,資源配額在YAML文件的resources中定義:
YARN容器管理
作為容器管理的平臺,Kubernetes主要用來在容器中部署分布式應用程序,YARN作為一個資源管理平臺也支持容器的管理,主要用來以容器的方式運行大數據作業。像Spark將YARN作為資源管理器運行Spark job。
YARN支持對現有容器大小的調整(cgroup和jobobjects都支持修改資源配額),當用戶從YARN申請了一些固定大小的容器,想改變容器資源配額的大小的時候不需要釋放掉這些容器重新申請,YARN支持動態改變已經分配的容器的大小。
結束語
隨著大數據和云計算技術的發展,資源控制和管理作為底層技術已經非常成熟,掌握這些技術便可以在大數據處理中游刃有余。
展開 招募|EASYCAE共享云計算平臺校園代理虛位以待
招聘流程
投遞簡歷—簡歷篩選—電話面試—個人材料遞交—代理合作協議簽訂
報名通道:
請以“應聘校園充值卡代理”為郵件標題,發送郵件至hr@easycae.cn
郵件內容包括:
正文:簡要闡述你的應聘理由
附件:個人簡歷(word或pdf格式)
咨詢熱線:13701328313
EasyCAE 云仿真共享計算中心,隨時隨地的獲取HPC計算資源,按需付費,無需安裝; 為注冊用戶提供FLUENT,CFX 和openFOAM 的少量免費體驗時間!
CAE私有云定制服務自主求解器
商務合作
請郵件至小易: customer@easycae.cn
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展開 北鯤云超算平臺如何成為就生命科學云計算領域先行者?
北鯤云超算平臺如何成為就生命科學云計算領域先行者?
盡管云計算在國內已經發展了十余年之久,但仍然是個相對新穎的事物。近幾年隨著互聯網大廠對于公有云的建設,以及“新基建”的提出,國內云計算公司迅速發展,北鯤云超算平臺作為在云計算領域、國內生命科學行業的SaaS應用的先行者,北鯤云成立于歐洲硅谷—斯德哥爾摩Kista,致力于為全球生命科學行業提供基于云計算模式的商業解決方案。
如今,分子生物學根本離不開計算機的幫助。很多研究機構都建立了專門的計算中心,處理過多的數據。然而,隨著越來越多的生物分子數據被解析,生物信息學專家不得不借用計算機行業的另一套策略,也就是云計算(或分布式計算)?;?em>云計算的系統不同于本地化的存儲和分析數據,它將強度很大的工作程序化地按需分派到成百上千的遠程服務器上。當然,云計算的另一個優勢在于能夠幫助研究機構避免更多的花費。
作為Cloud-HPC的先行者北鯤云已經成功服務中國數千家企業、研究所及高校。北鯤云現有業務和產品包括Cloud-HPC SaaS平臺、以及生命科學行業解決方案。北鯤云超算SaaS平臺主要為個人用戶提供算力服務,而鯤云超算行業解決方案是為高校及企業用戶量身定制的,針對企業不同的上云情況,為企業提供云上、混合云、以及私有云等模式。
北鯤云超算平臺除了能夠為用戶提供大量的遠程服務器外,還可以為生命科學行業用戶提供基礎軟件,幫助用戶執行復雜的計算任務,并在成千上萬臺服務器間進行有效分配。并且能夠提供高速的每臺服務器和網絡間的基礎通信。
北鯤云計算的另一大優勢在于操作的簡便性,至少是對熟悉計算機編程的研究人員來說?!爸灰cJava編程就足以在非常大的集群中運行大規模的分析任務,即便不擅長使用命令行,研究人員同樣可以通過北鯤云超算平臺提供的圖形界面進行作業。
展開 
北鯤云超算平臺如何提高高性能計算在云環境下的可行性?
經過數年的發展,高性能計算在云環境下的使用也越來越成熟。在AWS、阿里云、騰訊云等這些大型的云服務供應商已經利用更為強大的網絡與處理器方案向高性能計算作出了試探性延伸的同時,諸如北鯤云、Rescale等公司也開始通過將軟件與高性能計算獨立軟件開發商相對接的方式,進而幫助高性能計算用戶更加地輕松使用高性能計算軟件。
與傳統的高性能計算集群(如,超算中心)相比,租賃云廠商資源確實會提高使用成本。但在相同配置下,用戶在物理數據中心內運維一臺典型的100節點集群,每月需要承擔近7萬美元固定成本,(包括人力成本)這僅僅是集群運維方面的支出。所需支付的成本并不比使用云廠商資源的低,這里并沒有添加任何高端處理器或者加速方案。
那么有沒有一種既能夠減少不必要的開支又能夠滿足企業根據不同硬件規格單獨進行計算的方案呢?因此,云計算的優勢在這種高成本支出及計算資源利用率不高的場景下,愈發凸顯。在云環境下,我們可以隨時開啟并關閉自己租賃的設備。而不使用時,它們完全不會帶來任何成本——這就是Rescale、北鯤云這樣的公司正在做的事情。
北鯤云平臺還在減少企業用戶在高性能計算集群的運維成本,提高企業計算資源的利用率的同時,還能夠未企業用戶提供行業解決方案,對于已自建集群的企業,北鯤云能夠提供幫助企業優化資源利用率的方案,如果企業的自建集群算力不足,北鯤云將會提供能夠自動溢出到云上的解決方案,而對于沒有集群的企業,北鯤云提供可以讓企業直接上云的解決方案。
對于企業用戶來說,最理想的方式是能夠將企業內部資源與基于云的容量加以結合,幫助企業輕松應對峰值需求的同時利用現有硬件投資平衡實際運營成本,一些企業。
展開 Ansys聯合微軟推動芯片開發、仿真和云計算方面的創新
搭載AMD 3D V-Cache?技術的第3代AMD EPYC?處理器現可在Microsoft Azure HBv3虛擬機(VM)上獲得,將在2022年提供給更多Ansys Cloud客戶
主要亮點
Ansys Cloud現在將自動升級高性能計算服務器,新的服務器將搭載AMD 3D V-Cache技術的AMD EPYC 7003系列處理器
搭載AMD 3D V-Cache技術的第3代AMD EPYC處理器運用3D堆疊技術,為高性能計算提供卓越性能
Ansys客戶將可通過Microsoft Azure HBv3虛擬機,自動在云端訪問搭載AMD 3D V-Cache技術的第3代AMD EPYC處理器。Ansys Cloud是Ansys基于Azure打造的仿真高性能計算云服務,近日將自動升級計算服務器硬件配置以提供使用當今最新AMD芯片的能力。
全新Azure HBv3 虛擬機專為加速CAE仿真工作流程而設計,采用搭載AMD 3D V-Cache技術的第3代AMD EPYC處理器,讓高性能計算實現前所未有的性能提升。
展開 Ansys聯合微軟推動芯片開發、仿真和云計算方面的創新
搭載AMD 3D V-Cache?技術的第3代AMD EPYC?處理器現可在Microsoft Azure HBv3虛擬機(VM)上獲得,將在2022年提供給更多Ansys Cloud客戶
主要亮點
Ansys Cloud現在將自動升級高性能計算服務器,新的服務器將搭載AMD 3D V-Cache技術的AMD EPYC 7003系列處理器
搭載AMD 3D V-Cache技術的第3代AMD EPYC處理器運用3D堆疊技術,為高性能計算提供卓越性能
Ansys客戶將可通過Microsoft Azure HBv3虛擬機,自動在云端訪問搭載AMD 3D V-Cache技術的第3代AMD EPYC處理器。Ansys Cloud是Ansys基于Azure打造的仿真高性能計算云服務,近日將自動升級計算服務器硬件配置以提供使用當今最新AMD芯片的能力。
全新Azure HBv3 虛擬機專為加速CAE仿真工作流程而設計,采用搭載AMD 3D V-Cache技術的第3代AMD EPYC處理器,讓高性能計算實現前所未有的性能提升。在Azure開展的早期測試中發現對大規模計算流體動力學(CFD)仿真的速度提升高達80%,顯式有限元分析(FEA)碰撞測試的速度提升高達50%。
展開 “神工坊”——國家超級計算無錫中心推出工業數字化(CAE)云應用平臺
“神工坊”作為國家超級計算無錫中心正在全力打造的工業數字化CAE云應用平臺和“神威·太湖之光”國產超級計算機工業應用的唯一云平臺入口,也同時肩負著國產超級計算機工業仿真生態建設者的歷史使命。
平臺研發
為應對先進制造業需求,國家超級計算無錫中心集成了一系列面向國產眾核處理器的軟件工具,進一步完備了“神威 ? 太湖之光”國產超級計算機的系統軟件,并在此基礎上推出了工業數字化云應用平臺。
“神工坊”工業數字化(CAE)云應用平臺集成了諸多CAE軟件,能夠進行流體CFD分析、結構有限元分析和電子散熱分析等不同學科的工業仿真作業,滿足不同行業不同專業客戶的多樣化需求。平臺操作方便,使用習慣同本地PC電腦基本一致,用戶使用學習成本低。其可視化界面,能夠滿足CAE全流程作業,顯著提高用戶在線仿真工作效率。
神工坊”平臺,在2020年9月份已完成平臺內測,目前平臺進入公測階段。目前超過100家高端裝備制造企業、高校、科研機構參與了平臺的公測,涉及汽車設計制造、高端電機設備開發、船舶和航空裝備研發等行業和應用場景,證明了平臺的實用性,以及對用戶工業仿真效率的提升。
前處理
求解
后處理
工業競爭力是區域經濟競爭力的核心,而區域競爭力的強弱已成為衡量一個地區是否具有現實和潛在競爭優勢的重要標志,是“是否具有可持續發展能力”的決定性因素。蘇南地區是全球制造業要素集中地和我國最大的工業基地,但要想在高端制造回流和低端制造轉移的轉型壓力下獲得發展先機,很大程度取決于新的工業革命中數字化研發設計能力的積極賦能。此次國家超級計算無錫中心推出“神工坊”平臺,將為蘇南地區乃至全國的制造業企業,提供隨時隨地、在線、按需、高性能的SaaS仿真服務,切實提升工業數字化設計研發水平,助力產業升級。
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