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Step3：利用pymol腳本（modevectors.py）進行再處理modevectors.py下載地址：https://pymolwiki.org/index.php/Modevectors Step4：查看工作路徑，也可以更改工作路徑，確保你的文件都在此路徑下Step5：開始運行pymol腳本，在命令框依次輸入run modevectors.py

md-gromacs.sh腳本的內容涵蓋上述教程中的所有命令，根據北鯤云超算平臺的指南需要在腳本開頭加上導入gromacs模塊，如果申請了GPU需要將GPU模塊也導入(1-6行)，具體腳本內容如下：module add GROMACS/2020-fosscuda-2019bexport GMX_GPU_DD_COMMS=trueexport GMX_GPU_PME_PP_COMMS=true

<h2 class="ql-align-center"><strong>0.出發點</strong></h2><p>用abaqus做細觀模擬，隨機填充顆粒/纖維是跳不過的坎，網上有很多插件或腳本，技術鄰也有不少大咖做了些插件，但個人而言更傾向于腳本，雖然插件使用起來方便，不過有時需要根據具體要求修改模型，此時腳本的靈活性就體現出來了。