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Step3：利用pymol腳本（modevectors.py）進(jìn)行再處理modevectors.py下載地址：https://pymolwiki.org/index.php/Modevectors Step4：查看工作路徑，也可以更改工作路徑，確保你的文件都在此路徑下Step5：開始運(yùn)行pymol腳本，在命令框依次輸入run modevectors.py

md-gromacs.sh腳本的內(nèi)容涵蓋上述教程中的所有命令，根據(jù)北鯤云超算平臺(tái)的指南需要在腳本開頭加上導(dǎo)入gromacs模塊，如果申請(qǐng)了GPU需要將GPU模塊也導(dǎo)入(1-6行)，具體腳本內(nèi)容如下：module add GROMACS/2020-fosscuda-2019bexport GMX_GPU_DD_COMMS=trueexport GMX_GPU_PME_PP_COMMS=true

<h2 class="ql-align-center"><strong>0.出發(fā)點(diǎn)</strong></h2><p>用abaqus做細(xì)觀模擬，隨機(jī)填充顆粒/纖維是跳不過的坎，網(wǎng)上有很多插件或腳本，技術(shù)鄰也有不少大咖做了些插件，但個(gè)人而言更傾向于腳本，雖然插件使用起來方便，不過有時(shí)需要根據(jù)具體要求修改模型，此時(shí)腳本的靈活性就體現(xiàn)出來了。