生物制藥行業的案例
北鯤云超算平臺賦能蛋白設計助推生物制藥行業發展
北鯤云超算平臺賦能蛋白設計助推生物制藥行業發展
隨著科技進步，生物制藥正在被視為改寫人類命運的關鍵。北鯤云超算平臺蛋白設計助推生物制藥行業發展，提供蛋白質結構設計時所需的龐大的計算和資源儲存資源，幫助生命科學與生物制藥的發展，讓蛋白設計為生物制藥發展加足馬力。
作為云計算平臺領域中的代表，北鯤云SaaS平臺在高性能計算領域中具備了強大的優勢。在蛋白設計中，從高效進行基于測序和藥物篩選，到對大量的蛋白質分子結構與基因序列數據進行匹配，北鯤云豐富的應用場景和高效的運行速度，為生物制藥的數據化與可視化提供最基礎算力。
同時北鯤云還針對當前生物制藥企業落后的計算機系統和計算能力，給出更經濟、靈活、針對性強的服務方案，使生物制藥企業在產品研發時擁有體系龐大的數據支撐與模型支持。
當前研究人員普遍認為蛋白質設計的核心初衷是加速生物制藥的發展，以謀求用更顯的藥品來解決疑難雜癥。而對給定的預期功能，能否設計出滿足該功能需求的蛋白，是蛋白質設計研究的另一關注點，在新型生物藥開發的實際應用層面具有重要意義。北鯤云單節點206CPU核心，NvidaV100,A100等加速卡支持，多種交互方式，支持超過300種經過編譯優化的可以軟件，使生物信息研究、生命科學探索、生物制藥發展、蛋白設計等場景的云計算功能都能輕松達成，對推動行業發展具有重要意義。
展開 多物理場建模在生物制藥行業的應用
由于藥物的研發模式、功能和商業化階段復雜多樣，所以應用于生物制藥行業的各類建模和仿真工具需要同時具備廣泛的適用性和足夠的專業深度。
安進（Amgen）公司是市場領先的跨國生物制藥企業。為了確保藥物的有效性和安全性，公司的研發人員將多物理場仿真這一工具應用到了藥品加工的整個流程中。安進公司生產的各類藥物惠及全世界數百萬身患重疾的病人。一款藥品成功面世的背后離不開大量的研發及生產流程。安進公司正在通過構建多樣化的工藝模型組合來優化工作流程。在一個對工藝模型而非產品模型更為重視的行業中，這樣的工藝優化也成為了企業制勝的法寶。安進公司的工藝開發總監 Pablo Rolandi 負責使用 COMSOL Multiphysics? 軟件為公司的研究人員建立一個平臺化的建模環境。Rolandi 解釋道：“COMSOL 軟件是一個具有現代設計理念的成熟平臺。簡明、流暢、易用的接口和圖形用戶界面，以及強大的單物理場和多物理場仿真功能，讓我們能夠創建出豐富多樣的工具。”為應對各個研發階段出現的各類問題，Rolandi 和團隊成員將目光投向多物理場建模，希望在這里找到解決方案。在很多項目中，仿真解決方案也會伴隨著仿真 App 的開發。研發團隊利用軟件中的“App 開發器”，直接將模型轉換成仿真 App，通過定制化的用戶界面讓最終用戶無需掌握專業的建模知識，就能夠運行仿真，并利用仿真結果指導后續工作。在過去的一年半中，他們開發了許多簡單易用、交互性強且易于部署的仿真 App，讓企業在工藝開發、生產作業和研發等各個環節中受益于仿真帶來的優勢。
消除生產中的瓶頸
Rolandi的團隊通過開發定制化的仿真 App，解決了生產工藝中的諸多問題，對干燥工藝進行優化是其中最具代表性的案例之一。
展開 北鯤云超算平臺如何幫助現代生物制藥發展？
北鯤云超算平臺如何幫助現代生物制藥發展？
隨著生命科學領域研究的不斷深入和細化，大量的關鍵數據，需要整理、分析、對比和歸類存儲等，同時也需要更多的專業數據分析軟件來進行專業的數據管理分析。而在大數據運算發展異常迅速的當下，眾多國內外云超算平臺，憑借自身的平臺大數據計算優勢以及云計算平臺的便利性，服務于生命科學領域，包括生物制藥企業等。作為國內領先的一站式云超算平臺，北鯤云超算平臺近年來面向企業，助力現代生物制藥發展進入快車道！
調研顯示，目前在現代制藥、藥物研發領域，藥物研發大約占到醫療市場的三成以上?？梢钥闯鏊幬镅邪l在醫療市場的重要性，而在新藥物的開發方面，往往有大量的數據需要處理，不僅如此，還要求數據的準確性和高效性。對于制藥企業本地內部的IT資源來說，也存在著不同程度的老化問題，如果進行全部更新顯然是不現實的，還有大量需要維護的成本，這些因素都在制約著生物制藥行業的發展。
當前很多企業還保留著GPU卡為Nvidia P100及更早的加速卡，計算能力遠遠跟不上實際項目的需求，這是大部分制藥企業面臨和急需解決的計算資源問題。也為大數據運算平臺提供了進入市場的契機，國內大數據云計算平臺眾多，其中不乏有實力強勁的競爭對手，面對異常激烈的競爭環境，北鯤云先發制人，打造專業的北鯤云計算平臺，成功為多個制藥企業完成平臺部署和大數據計算存儲服務。
在醫學制藥領域，通常不僅有嚴格規范化的試驗，還需要大量化合物篩選項目，從大批量的化合物或者新化合物中選擇對某一特定作用靶點具有較高活性的化合物，這也是現代生物制藥的一個普遍流程，而要從數以萬計的化合物分子中篩選出符合活性指標的化合物，在以往需要大量的時間和成本，大數據云計算平臺的出現，如北鯤云超算平臺等，讓這種情況得到了快速的改善，能夠大大改善制藥的試驗研發進度和成本。
展開 云計算重塑生命科學行業，北鯤云加速生物制藥企業轉型
科技的發展加速了許多行業的發展，云計算的日漸成熟也在不斷地重塑著生命科學行業，從而使得傳統的藥物研發企業面臨著從研發成本到藥物供應途徑乃至專利到期等諸多問題，不斷攀升的研發成本，導致藥物供應途徑減少，進一步導致研發效率降低，甚至最終影響到?？频狡谇澳芊駥⒀邪l成本收回。
因此，許多藥物研發企業不得不考慮如何協作創新,降低藥物研發的復雜性，這也是云計算給生命科學行業帶來的變革。北鯤云超算平臺作為一個將云上的高性能計算平臺，準確把握住生命科學行業所面臨的困局，能夠結合生命科學領域的不同場景制定企業專屬的解決方案。借助北鯤云的行業解決方案。,企業能夠加快藥物研發的進程，進而加快上市時間，同時，提升企業的算力集群功能。方便企業進行資源分配及管理。
對于高校用戶來說，如果沒有獨立的高性能計算集群，用戶也可以在北鯤云平臺直接使用軟件進行計算。比如最近備受業界關注的AlphaFold2，據悉，DeepMind不僅公開了 AlphaFold2的源代碼，而且還免費開放了AlphaFold數據集。
面對已經開源的AlphaFold2，許多從事生物大分子研究的同學肯定想嘗試一些這個能夠高度準確預測人類98.5%蛋白質的軟件。然而，AlphaFold2對于硬件設備的要求卻相當高，專業人事給出的參考配置如下：
Nvidia A100售價高達7萬，硬件設備價格都差不多，當然你還需要人力來配置，人工費用另算。當然，你也可以直接在北鯤云超算平臺使用GPU核時。
在存儲方面來說，AlphaFold2訓練好的模型加數據庫下載下來是428 GB大小的文件，解壓后需要2.2T的空間，因此用戶至少需要3T的存儲空間，而北鯤云超算平臺能夠為用戶提供PB級別的存儲空間。
展開 
中國生物化工簡史-生物制藥
小按：本期主要對中國生物化工在生物制藥方面的應用和進展做介紹。感興趣讀者可回看第一期，總體回顧，中國生物化工簡史（第1篇章）；第二期，生物能源，中國生物化工簡史（第2篇章之一）。
2.2 生物制藥
2.2.1 中國生物制藥的研究進程
得益于政府支持，中國的大學和研究機構在藥物的生物合成方面取得了矚目進展。很多研究已經轉化到公司進行合作研究和開發進行更多的評估。許多成績已經進行工業化或接近工業化。
自1990s起，中國逐漸發展成為生產類固醇藥物的全球中心，占到全球產量的三分之一。皮質類固醇藥物（corticosteroid drugs）的產能和實際產量，中國全球第一。2009年，出口743.25噸，價值37億美金。中國傳統的生產過程依賴化學降解薯蕷皂苷元（diosgenin）來獲得關鍵中間體。最近，該過程已經轉變為微生物發酵植物甾醇類生產中間體，像4-雄烯-3,17-二酮（4-androstene-3,17-dione，AD）, 1,4-雄甾二烯-3,17-二酮（1,4-androstadiene-3,17-dione，ADD）,和9-羥基雄烯二酮（9α-hydroxy-4-androstene-3,17-dione，9α-OH-AD）。
通過誘變篩選，分枝桿菌Mycobacterium突變菌可將植物甾醇（sitosterol, soybean sterol, andcampesterol）轉化為AD, ADD或9α-hydroxy-AD，得率提高到70%。
展開 生物制藥材料
細胞體外培養基本條件:①無菌②營養充足,防止有害物質③氧氣④隨時清除代謝有害物質⑤良好的生存外環境：pH、滲透壓、離子濃度⑥及時分種，適當的細胞密度
無血清培養基優點：①提高重復性（細胞）②減少微生物污染（病毒）③供應充足穩定④細胞產品易純化⑤避免血清因素對細胞的毒性⑥減少血清中蛋白對生物測定的干擾
培養基及其組成（1）無機鹽（2）碳源（3）植物生長調節劑（5種天然激素：生長素、分裂素、赤霉素、脫落酸、乙烯 ）（4）有機氮源（5）維生素。
植物細胞大規模培養生物反應器的類型（1）.機械攪拌式生物反應器（2）.鼓泡塔生物反應器（3）.氣升式生物反應器（4）.轉鼓式生物反應器（⒌）固定化細胞生物反應器。.
酶化學修飾的方法：1.酶的表面化學修飾：（1）大分子修飾。（2）小分子修飾 。（3）交聯修飾。（4）固定化修飾。2.酶分子內部修飾 ：⑴非催化活性基團的修飾。⑵蛋白主鏈的修飾。（3）催化活性基團的修飾（4）與輔助因子有關的修飾：（5）肽鏈伸展后的修飾：3.結合定點突變的化學修飾。
修飾酶的特性穩定性提高 ⑵抗各類失活因子能力提高 ⑶抗原性消除 ⑷體內半衰期延長： ⑸最適pH改變 ⑹酶學性質變化 ⑺對組織分布能力改變 。
闡述基因工程藥物研制有那些主要過程？答：基因工程藥物的生產必須首先獲得目的基因,然后用限制性內切酶和連接酶將所需目的基因插入適當的載體質?；蚴删w中并轉入大腸桿菌或其他宿主菌(細胞),以便大量復制目的基因.對目的基因要進行限制性內切酶和核苷酸序列分析.目的基因獲得后,最重要的就是使目的基因表達.基因的表達系統有原核生物系統和真核生物化的難易.將目的基因與表達載體重組,轉入合適表達系統,獲得穩定高效表達的基因工程菌。建立適于目的基因高效表達的發酵工藝,以便獲得較高產量的目的基因表達產物.。
展開 預告 | Ansys渠道合作伙伴1月活動安排
</p><p><strong>時間：</strong>1月13日， 9:00-17:00</p><p><strong>合作伙伴：</strong>上海琨欽信息科技有限公司</p><p><strong>地點：</strong>上海</p><p><strong>費用：</strong>3,000元/人</p><p><a href="https://s.31huiyi.com/9jlZI2rl" rel="noopener noreferrer" target="_blank"><strong><em>立即預報名</em></strong></a></p><p><br></p><div contenteditable="false" width="100%"><hr></div><h3><strong>1月16日 | 生物制藥行業Ansys解決方案研討會</strong></h3><p><br></p><p><strong>簡介：</strong>人類的健康、壽命的延長，離不開生物制藥行業的飛速發展。在藥物制造的過程中，涉及多種多樣的工藝過程，這些工藝過程及設備往往經過反復實驗、測試、放大才能最終確定較優的工藝和結構參數。Ansys針對生物制藥行業工藝及設備具有一系列完整的解決方案，能夠幫助企業用戶進行虛擬實驗，通過自動化仿真確定最優參數，輔助研發人員進行設備放大及工藝開發。
展開 推薦 | Ansys渠道合作伙伴活動4月活動安排
時間：4月20日， 13:00-15:00
合作伙伴：上海恒士達科技有限公司
地點：線上
費用：免費
立即報名
4月23日 | 機器人行業Ansys解決方案及應用分享
簡介：隨著機器人技術向智能化、高精度與復雜場景不斷演進，其研發正面臨結構、控制、流體、電磁與熱等多物理場深度耦合的嚴峻挑戰。
本次研討會將聚焦Ansys在機器人行業的全方位仿真解決方案，展示如何通過集成化平臺對機械臂動力學、足式機器人運動、伺服電機與電池熱管理、傳感器融合等核心環節進行高保真虛擬驗證。我們將探討如何借助仿真技術顯著縮短開發周期、降低實物測試成本，并提升機器人的可靠性、能效與智能水平，為工業機器人、人形機器人等領域的企業與研究者提供強大的創新引擎。
時間：4月23日 ，15:00 - 16:00
合作伙伴：億道電子
地點：線上
費用：免費
立即報名
4月24日 | 生物制藥行業工藝全流程仿真解決方案研討會
簡介：人類的健康、壽命的延長，離不開生物制藥行業的飛速發展。在藥物制造的過程中，涉及多種多樣的工藝過程，這些工藝過程及設備往往經過反復實驗、測試、放大才能最終確定較優的工藝和結構參數。
本研討會針對生物制藥行業的工藝流程，介紹從上游中游到下游的完整仿真解決方案，對工藝的各個細節階段進行仿真，解決放大、溫度、化學反應、包衣、運輸等等涉及到的問題場景，通過自動化仿真確定最優參數，輔助研發人員進行工藝開發驗證。
展開 生物工程技術在現代制藥業的應用
生物工程是70年代產生的一門新的學科，它是通過技術手段，利用生物體或生物過程生產有經濟價值產品的學科。生物工程技術的興起依賴于生物學基礎研究方面的兩個重大突破：一是上世紀 50 年代出現的Watson和Crick的DNA模版學說；二是上世紀60～70年代出現的Jacob 和Monod的操縱子學說。分子生物學迅速崛起，對生命現象的本質——核酸、蛋白質及其相互關系作了較深入的闡述，使人們對生物規律的認識從宏觀進到微觀，認識到生物的復雜現象最終是由生物分子及其特性決定的。此后，以分子生物學基礎理論為指導，又發展完善了基因工程的工具酶和載體，如內切酶、載體質粒、連接酶及其他修飾酶等，使人們能利用重組DNA 分子自如地操作、搬動和改造基因。DNA和蛋白質順序測定方法、基因體外快速突變、DNA人工合成等方法的出現，也導致了基因工程在研究技術方面的逐步成熟和發展。因此，生物工程是基礎科學和應用科學相結合的產物。生物工程的興起，不僅反映出生物學飛躍到一個與過去無法比擬的新水平，而且也反映出人類有效控制生物過程為人類造福的時代已經開始。
生物工程從學科領域可把之歸并為四個分支：基因工程、細胞工程、微生物工程和酶工程。下面對生物工程技術的四個分支作簡要的介紹。
1.基因工程
基因工程又稱遺傳工程，即重組DNA技術的實際應用。
它是把在體外重新組合的DNA引入到適當的細胞中進行復制和表達。其所依托的基礎理論為Watson和Crick的DNA模版學說，Jacob和Monod的操縱子學說。此二者相輔相成地從分子水平上揭開了遺傳密碼的復制、轉錄、轉譯、突變、調節與控制的奧秘，使人們對于生命基本現象實質的認識大大地具體化和深入，揭開了生物遺傳變異的奧秘，堪稱劃時代的成就。
展開 北鯤云SaaS平臺為生物制藥研發進程帶來“加速度”
為給不同的行業提供便利，北鯤云超算平臺還預裝了對應的專業軟件，進一步降低了用戶使用高性能計算服務的門檻。
目前，針對靶點的識別和跟化合物的篩選依然是生物制藥領域的研究重點，在北鯤云這類企業的支撐下，這個進程無疑會更加順利！
生物制藥中Thermo Scientific 實驗室設備和耗材整體解決方案
生物制藥中Thermo_Scientific_實驗室設備和耗材整體解決方案.pdf
重磅丨譜尼測試收購中佳合成制藥 打通生物醫藥一站式技術平臺“最后一公里
近日，譜尼測試集團成功收購湖北中佳合成制藥股份有限公司，具備了原料藥GMP生產體系和生產能力，打通生物醫藥一站式技術平臺“最后一公里”。
至此，譜尼測試可為生物醫藥的研發提供小試、中試和放大的全流程技術支持，增強了集團綜合競爭力。
憑借強大的科研技術實力，PONY譜尼生物醫藥已擁有上海和北京兩大生物醫藥研發基地，是集藥物設計、藥物合成、工藝開發、藥物活性篩選、制劑研究、藥效學評價、藥代動力學評價、毒理學評價以及新藥注冊為一體的綜合技術平臺，具備CMA、CNAS資質，按照GMP、GLP執行，并得到了國內和國際藥品管理部門的認可。
展開 淺談制藥行業粉塵爆炸參數測定
我們在不同行業擁有豐富經驗的專家將與您討論與粉塵相關的應用以及所有爆炸和火災的風險。
TüV SüD 中國與TüV SüD 瑞士過程安全公司（瑞士巴塞爾）的專家以及TüV SüD全球風險咨詢公司（GRC）（美國新澤西州）密切合作。
TüV SüD 瑞士過程安全公司工藝安全（瑞士巴塞爾）
近15年來，我們公司一直在為工業領域的公司提供風險分析、熱處理安全、防爆、靜電和化學安全等領域的優質服務，主要來自制藥、化工、農業、金屬/木材加工行業以及建筑材料制造商——也包括物流公司、財產保險公司（P&C）和監管部門。
TüV SüD全球風險顧問（GRC）（美國新澤西州）
TüV SüD Global Risk Consultants（GRC）是非捆綁式財產損失控制服務的全球領導者，在16個國家運營，全球擁有400名員工，其中300名為風險控制工程師和顧問。我們擁有超過60年的財產損失預防服務經驗，我們的專業知識使我們能夠應對來自世界各地客戶的多種風險管理策略。我們的風險控制工程師和顧問在其專業領域通過眾多認證和任命獲得認可，我們的顧問在世界各地的協會和組織的各種技術和專業委員會任職。
展開 高動態響應在制藥和化妝品行業的優勢 - 專訪SPLA稱重產品經理
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展開 AI制藥企業“自證”下一步，商業化之路怎么走？ 北鯤云CEO對話行業大拿
第三，相比于美國，國內在CRO、CDMO以及合成生物學這些偏制造屬性的產業上更有優勢。這些行業加上AI，最后AI加服務一起出?？隙]有問題，關鍵就是要看怎么揚長避短。
資本寒冬下，小型AI制藥企業該怎么生存？
峰瑞資本合伙人 馬睿：
現在整個行業面臨的情況是，投資人可能已經沒有耐心去聽你是做什么的，為什么 make sense。但是長遠來看，未來的制藥肯定會被AI完全影響，只不過現在確實有一些關鍵的環節并沒有在技術上得到解決。所以其實對于小型企業來說，第一，最重要的還是要想辦法養活自己，要么在融資上有所突破，要么在營收上有所突破，總之把這一段時間熬過去。第二，需要分析上一代AI制藥企業遇到的問題是什么，然后分析自己的position 在什么方向，如何差異化，以及解決哪些尚未解決的問題。
智藥科技創始人 黃韜：
生存問題不是由于太多的AI制藥企業競爭造成的，而是整個行業的困難，下游企業需求減少是最大的問題。目前AI制藥企業的下游客戶是比較成熟的藥企或者發展比較好的Biotech，這是比較普遍的客戶畫像，但是現在整個行業對于開拓新管線、做新產品這些事情非常謹慎。客戶的需求減少，就意味著能夠去觸達客戶、進而展示能力的機會變少了很多。在這種前提之下，對于小型AI制藥企業，放下對技術的執著和面子，想盡辦法先活下去是最重要的。
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