生物信息學的案例
生物信息學與進化分析及其生物醫學應用
生物信息學與進化分析及其生物醫學應用2.pdf
生物信息學與進化分析及其生物醫學應用1.pdf
基因測序、生物信息分析平臺工作站硬件配置探討（2020）
（一）了解生物信息學
生物信息學（Bioinformatics）利用應用數學、信息學、統計學和計算機科學的方法研究生物學的問題。生物信息學的研究材料和結果就是各種各樣的生物學數據，其研究工具是計算機，研究方法包括對生物學數據的搜索（收集和篩選）、處理（編輯、整理、管理和顯示）及利用（計算、模擬）。
生物信息學典型工作流程
這個過程是由一系列鏈接的步驟組成，這些步驟將原始輸入（測序原始數據RAW）轉換為有意義或可解釋的輸出，例如，高通量測序NGS數據而生成的fastq文件。然后用于基因組序列分析的特定功能方面的特定工具執行。根據執行的分析類型，工作流可以具有可變數量的步驟，因此可以是簡單的或復雜的。
生物信息學主要研究方向：DNA/RNA/蛋白質測序，序列比對，基因發現，基因組組裝，藥物設計，藥物發現，蛋白質結構比對和預測，通過使用計算密集型技術（用于模式識別，數據挖掘，機器學習算法和可視化）來加深對生物過程的理解。因此需要配備先進的計算設備和豐富專業的分析軟件
（二）生物信息學分析的計算特點
如何選購一個理想的圖形工作站硬件配置，可能很多人思考過：
什么是用于生物信息學和計算生物學研究的最佳PC/工作站？
用于生物信息學分析的服務器配置
全基因組序列分析實驗室的硬件配置
高通量序列分析服務器有什么要求
下一代測序數據分析硬件配置推薦
用于分析NGS宏基因組學數據的計算機配置？
展開 CPCI會議推薦---計算生物學和生物醫學國際學術會議（CBBS 2023）
計算生物學和生物醫學國際學術會議（CBBS 2023）
會議官網：http://www.iccbbs.org/
會議時間：2023年8月12-14日
會議地點：湖北武漢
提交檢索：CPCI (WoS), CNKI, Google Scholar, WanFang Data, etc.
會議介紹
隨著計算機技術的發展，生物醫學信息學和計算生物學越來越受到學術界和工業專家的關注。作為一個跨學科的學術會議，CBBS 2023聚焦生物醫學的熱門研究領域，如計算生物學，計算生物學, 生物醫學機器人等， 旨在為計算生物學和生物醫學領域的學者和行業專家提供一個專業的國際交流平臺，促進行業內，行業間的學術交流，共同探討解決新問題，迎接新挑戰，進而激發新的想法和思路，提供更多的合作機會。
出版與檢索
CBBS 2023 錄用并展示的文章將由Atlantis Press出版, 并提交至CPCI (WoS), CNKI, Google Scholar, WanFang Data等數據庫檢索。
組委會成員
大會主席-陳銘教授，浙江大學生命科學學院教授，內蒙古民族大學生命科學與食品學院特聘院長，有豐富的期刊編輯、審稿和會議經驗。
大會主席-Y-h. Taguchi教授，來自日本東京中央大學，主要研究方向為主成分分析、基于張量分解的特征提取及其在生物信息學中的應用。
投稿主題
計算生物學算法 / 人工關節和器官 / 生物電子學 / 生物物理學 / 計算醫學……
投稿方式
作者請將全文或摘要通過郵箱投稿至info@iccbbs.org，并備注投稿人姓名，職稱，單位，常用電話/微信，或其他需求。
要求為全英文原創稿件，須嚴格按照模板排版后提交。摘要投稿僅做交流展示，不提供出版。
如有其他問題請致電13163283137
展開 結構生物信息學分子對接大師班--帶案例 ￥10
1-1 概述
2-1-蛋白質結構和功能組成
2-2-蛋白質結構和功能肽鍵和相互作用
2-3-蛋白質結構和功能α螺旋和β片
2-4-蛋白質結構和功能肽鍵和Ramachandran圖
2-5-蛋白質結構和功能結合能
2-6-蛋白質結構和功能蛋白質如何折疊
2-7-蛋白質結構和功能結構水平
2-8-蛋白質結構和功能功能水平
2-9-蛋白質結構和功能酶動力學基本概念
3-1-可用的蛋白質制備結構
3-2-制備的蛋白質制備結構
3-3-蛋白質制備同源性建模
3-4-蛋白制備穿線法
3-5-蛋白質制備α折疊
3-6-PDB結構的6-蛋白制備選擇
3-7-蛋白質制劑缺失殘留問題
3-8-蛋白質制備結構驗證
4-1-分子對接算法
4-2-分子對接類型
4-3-分子對接模式
4-4-分子對接軟件
4-5-分子對接自動對接VINA高分子制劑
4-6-分子對接自動對接VINA配體制備
4-7-分子對接自動對接VINA網格制備
5-1-自動對接VINA腳本
5-2-自動對接VINA分析-I
5-3-Autodock VINA分析- II
6-1-虛擬篩選為什么它很重要
6-2-虛擬篩選簡要信息
6-3-虛擬篩選大分子和配體的制備
6-4-虛擬篩選網格準備
6-5-虛擬篩選ADMET分析
6-6-虛擬篩查Lipinksi五規則
6-7-虛擬篩查結果分析
6-8-虛擬篩選腳本
7-1-故障診斷問題
7-2-出版質量圖制備
展開 
中國細胞生物學學會細胞工程與轉基因生物分會/陜西省細胞生物學學會2018年年會在陜西師范大學成功召開
在學會第四屆理事會第一次會議上，邊惠潔理事長對新一屆理事會的工作進行了部署，向積極參加科普活動的各單位頒發了“陜西省細胞生物學學會科普活動優秀獎”獎金和榮譽證書，并主持討論通過了成立學會第一個專業委員會的議題。崔洪勇副秘書長進行了中國細胞生物學學會2018年“諾貝爾獎解讀”活動的動員。
會議期間，中國細胞生物學學會細胞工程與轉基因生物分會召開了第三屆委員會第三次會議。分會會長、空軍軍醫大學邊惠潔教授向委員們匯報了近年來分會的工作和取得的成績，傳達了中國細胞生物學學會對分會工作的要求，向積極參加分會活動的各單位頒發了“科普活動優秀獎”獎金和榮譽證書。分會秘書長孔令敏副教授傳達了中國細胞生物學學會的科普工作精神和要求。
資料來源：中國細胞生物學學會官網，11月5日
展開 第七屆生物信息與生物醫學工程國際學術會議（BIBE2024）
征稿領域 包括但不限于
生物信息
基因組學
蛋白質組學
DNA序列分析
蛋白質編碼
蛋白質空間結構模擬
分子生物學
遺傳信息
基因工程
基因表達
蛋白質比對
基因識別分析
分子進化
序列重疊群裝配
基因藥物
生物醫學工程
醫用傳感器
數字信號處理
醫學圖像處理
醫用儀器原理
醫學影像儀器
診斷學
內科學
外科學
生理學
醫學電子學
醫學納米技術
生物醫學材料
生物制藥
細胞治療技術
個體化治療
在線投稿：http://papersub.icbibe.org/
主題報告人
張煜東教授，英國萊斯特大學，IET&EAI&BCS Fellow, ACM Distinguished Speaker；
陳斌教授，西安交通大學，國家級領軍人才計劃入選者，科技部國家創新人才推進計劃——中青年科技創新領軍人才，西安交通大學"騰飛人才計劃"特聘教授；
劉斌教授，大連理工大學, CCF&ACM&MICCAI members；
Gema Prats Boluda教授，西班牙瓦倫西亞理工大學，終身教授，瓦倫西亞理工大學生物工程研究與創新中心（CI2B）的成員；
陳揚超教授，香港中文大學深圳研究院基因調控與藥物研發實驗室主任；
Binh Phu NGUYEN，新西蘭惠靈頓維多利亞大學，高級講師，新加坡國立大學醫學院計算生物學中心研究員；
王光中教授，中國科學院上海營養與健康研究所，系統神經科學研究組組長；
吳方向教授，加拿大薩斯喀徹溫大學，IEEE Senior Member。
展開 EI檢索的“生物信息與生物醫學工程”國際會議征文 (ICBBE2010) hz
EI檢索的“生物信息與生物醫學工程”國際會議征文 (ICBBE2010) hz
CFP: ICBBE 2010 (Bioinformatics and Biomedical Eng.)
Ei&ISTP檢索的IEEE生物信息與生物醫學工程（iCBBE 2011）國際會議征文 tf
International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE 2011) Ei&ISTP Indexed
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The 5th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE 2011)
第五屆IEEE生物信息與生物醫學工程國際學術會議
Ei & ISTP Indexed
CALL FOR PAPERS
http://www.icbbe.org/2011
Wuhan, China May 10-12, 2011
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The 5th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE 2011) will be held from 10th to 12th,
展開 北鯤云亮相NCCBB 2022，誠邀各位蒞臨現場
第八屆全國計算生物學與生物信息學學術會議（NCCBB 2022）暨生物醫學大數據與人工智能大會于7月23日在廣東廣州隆重召開，作為Cloud-HPC的先行者，北鯤云參與本次大會，為參展觀眾展示了專業的生命科學行業云上高性能計算解決方案。
本屆大會匯集國內優秀專家、學者和產業界優秀人才，圍繞人工智能與多維組學大數據交叉融合的大會主題展開深入交流和討論。大會預計安排約100個會議報告，包括主旨報告、特邀專題報告、口頭報告、墻報等形式，將成為具有重要影響力的跨學科學術盛會。
北鯤云作為本次會議贊助商，在會場特設展位與各位專家學者共同探討前沿學科與科技的交叉領域。
今天是大會第一天，炎熱的天氣沒有阻擋各位前來參會的熱情，北鯤云展臺受到了眾多參會者的關注。北鯤云在云上的數字化研發平臺得到了參會者的廣泛肯定，大家紛紛表示希望北鯤云通過其豐富的行業服務經驗，為企業持續提供更加優質的云上高性能計算解決方案。
會議還將持續3天，北鯤云在現場準備了精美禮品等您來領??！期待您的蒞臨交流！
會議之后，北鯤云團隊還將與各業界專業人士進行更深度的交流與合作，讓我們拭目以待。
關于NCCBB 2022
第八屆全國計算生物學與生物信息學學術會議（NCCBB）暨生物醫學大數據與人工智能大會是由中國生物工程學會計算生物學與生物信息學專業委員會聯合中山大學中山眼科中心、中山大學中山醫學院和南方醫科大學等三家單位共同主辦的全國性計算生物學和生物信息學領域的高水平學術會議。會議將促進全國生物、藥學、農學、醫學與計算機等領域專家學者跨界交流與合作，打造前沿交叉科學交流平臺。
展開 基因測序、生物信息分析平臺工作站硬件配置推薦2021v3
新冠疫情席卷全球，對于人類而言是前所未有的挑戰，迅速找到未知病毒的發源地及特效治療方案，需要海量檢測、基因測序、生物信息分析等研究，對計算機計算能力要求至關重要，
西安坤隆計算機科技有限公司自2020年1月推出相應硬件配置：基因測序、生物信息分析平臺工作站硬件配置推薦2020
到2021年8月，已經升級換代，我們更新了基于生物信息分析的最新圖形工作站基準配置，另外增加了生物信息分析集群方基準配置方案（即將推出），詳見配置如下：
（一）生物信息分析圖形工作站配置推薦2021v3
O
品牌與型號
配置規格
價格
備注
1
AX410 144128-16TA
14核4.4GHz /128GB DDR4 /QuaroP620 /2TB P-SSD系統盤 +16TB SATA企業級/塔式(750w)/23寸圖顯
38000
2
AX410 142256-16TA
18核4.2GHz / 256GB DDR4 / QuaroP620 /2TB P-SSD系統盤/16TB SATA企業級/塔式(750w)/23寸圖顯
53500
3
EX650i 228256-32TA
2顆Xeon 金4316處理器（40核2.8GHz ）/ 256GB DDR4 /QuaroP620 /2TB P-SSD系統盤/32TB SATA企業級/塔式(865w)/23寸圖顯
65000
4
EX650i 233384-48TA
2顆Xeon 金6342處理器（48核3.3GHz ）/ 384GB DDR4 /QuaroP620 /2TB P-SSD系統盤/48TB SATA企業級/塔式(865w)/23寸圖顯
107000
展開 南理工馮章啟課題組Small：從精神汗液中提取生物電子能源和信息
認識到這些限制，南京理工大學馮章啟課題組開發了一種機電耦合和濕度驅動功能二合一的單層膜，可以從環境濕度波動中產生持續的電能輸出，并且這一人體濕度響應所激發輸出的脈沖電信號亦可以實時地反饋人精神狀態的生物電子信息，這一研究為可穿戴濕度發電和人生物電子信息的實時提取提供了可行的方法和物理組件。相關研究近期以題為“Power Generation from Moisture Fluctuations Using Polyvinyl Alcohol-Wrapped Dopamine/Polyvinylidene Difluoride Nanofibers”發表在雜志《Small》上。
圖1. 機電耦合和濕度驅動二合一單層膜的微觀結構，及其在人體情緒波動誘發精神出汗情況下發電和提取情緒生物電子信息的示意圖。
該研究報告了一種新型的二合一設計策略。與傳統的雙層致動器不同，本工作選擇了單層的 PVA@PVDF/DA納米纖維膜（NFs）作為濕度致動器驅動的壓電發電機的有效組件。高度對齊的核/殼 PVDF/DA納米纖維已被證明具有較高的壓電輸出 (Advanced Materials, 2021 33(3):2006093；DOI: 10.1002/adma.202006093)，因此選作機電耦合元件，進而保證了對弱驅動變形的高靈敏度。由于 PVA 與 DA 上的親水基團之間有很強的界面吸附，因此可以通過簡單的吸濾將 PVA 殼引入 PVDF/DA NFs 的界面周圍。與其他雙層致動器相比，這種機電耦合和濕度驅動的二合一 PVA@PVDF/DA NFs 顯示出優異的穩定性并避免了潛在的分層風險。單層膜一方面充當濕度執行器，從環境濕度的波動中提取化學勢能以執行機械功。
展開 
指紋識別 | 浙江工業大學開發指紋識別新技術，可提取皮下3毫米生物信息
“當今社會信息化技術快速發展，信息安全與人身安全已經成為國家日益關注的焦點問題?！蓖鹾Ｏ急硎?，單一身體特征或行為特征有時不足以證明個人身份，團隊通過采集包含內部指紋的高分辨率三維皮下結構信息，運用人工智能技術對采集數據進行處理，成功獲取皮下指紋、皮下汗腺和汗孔等生物識別特征。
王海霞介紹道，這些手指皮下生物特征的優勢在于復雜的皮膚內部組織結構特征使得其偽造難度極大，人工偽造的指紋膜只具有表面指紋紋路，并不具有皮下指紋信息、汗腺等信息，可對傳統指紋識別技術存在的缺陷進行填補。
攻克四項難點 研發智慧安防利器
“超聲波在組織中的衰減較強，還會受噪聲影響，對皮下指紋的探測深度有限且成像分辨率不高。”王海霞介紹，由于皮下組織結構的復雜性，光波在其內部經過多次散射，會使得成像中出現散斑。
記者了解到，研究初期，團隊總結了大面積皮下生物特征信息成像、強散斑干擾下低質量信息增強、自適應角質層深度差異化提取、跨平臺下多模態特征信息采集這四項技術難點。
通過將棱鏡、濾光片、熒光光源、工業相機、光纖耦合器等器件精心設計組裝，團隊在全球范圍內首次提出了一種分別利用全內反射(TIR)和光學相干斷層掃描(OCT)同步采集外部指紋和內部指紋的指紋采集系統，結合了兩個完全不同的光路系統，并使用自制的梯形棱鏡將其融合。
值得一提的是，該系統采用小光斑光纖準直器和長焦透鏡保證光學相干層析成像有足夠的面積，采用自制的梯形棱鏡組合TIR和OCT光路，實現相同的測量面積和同步采集。
“每個人的皮膚角質層厚度不完全一致，團隊為此開發出深度自適應多卷積融合技術，運用智能算法可根據不同人體組織深度，正確獲取皮下特征?！?/span>
展開 生物電磁學軟件選擇
我選FEMLAB
分子生物學實驗室設計方案
分子生物學實驗室廣泛應用于大專院校教學、科研機構以及醫療衛生機構的科學研究。在進行植物組織培養之前，需要全面了解所需的基本設備條件，以便靈活利用現有房屋或者進行新建、改建實驗室。實驗室的規模應根據工作目的和規模確定，避免規模太小影響效率，尤其是對于工廠化生產的目標而言。分子生物學實驗室的設計和規劃必須科學合理。中壹聯實驗室裝修公司小編將詳細闡述分子生物學實驗室設計的原則、各功能區布局及設備配置。
一、分子生物學實驗室設計原則
1.無菌操作保障：植物組織培養及大多數分子生物學實驗需要在嚴格的無菌條件下進行。實驗室設計的首要原則是確保無菌操作，從而防止污染。無菌操作不僅包括設備和器材的無菌，還涉及到操作環境的潔凈度。因此，在分子生物學實驗室設計時各區域的壓力控制和氣流組織形式必須科學合理，以防止交叉污染和氣溶膠傳播。
2.提高工作便利性：對分子生物學實驗室設計中實驗室布局要最大限度地提高工作的便利性和效率。合理的對空間進行利用和設備安排能減少實驗操作中的時間浪費和工作混亂，提高實驗的成功率和重復性。
3.資源節約與環境控制：植物組織培養需要人工控制溫度、光照、濕度等培養條件。在分子生物學實驗室建設時就應該要充分考慮到實驗室的節能環保，確保設備高效運作的同時，節省能源和資源。
二、分子生物學實驗室功能區布局
分子生物學實驗室由可以分為化學實驗室（準備室）、洗滌滅菌室、無菌操作室（接種室）、培養室、細胞學實驗室以及PCR實驗室等多個功能區。以下中壹聯實驗室裝修公司小編將詳細介紹每個功能區的具體設計和設備配置。
1.化學實驗室（準備室）
化學實驗室主要負責藥品的貯備、稱量、溶解、配制和培養基的分裝等工作。
展開 血流動力學/生物流體力學講座
血流動力學/生物流體力學講座
