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IVF的案例

【原創(chuàng)教程】手把手幫您建立ABAQUS與VS、IVF之間的關(guān)聯(lián)
我以自己的臺式機(64位win7)上ABAQUS6.14集成VS2013和IVF2013,以及筆記本(32位win7)上ABAQUS6.11集成VS2013和IVF2013,作為例子,并將我最近成功案例的截圖分享出來,希望對大家有所幫助。 喜歡這篇教程的朋友,歡迎關(guān)注、點贊、支持一下~ 你們的支持是我分享的動力 ABAQUS的二次開發(fā)子程序接口(user subroutine),可用于開發(fā)用戶自定義單元 UEL/VUEL、用戶自定義材料 UMAT/VUMAT 以滿足研究需要。安裝ABAQUS、VS、IVF之后,還需要手動建立軟件之間的關(guān)聯(lián),才能保證子程序能夠被調(diào)用、計算正常進行,繼而快樂地開展研究工作。 請注意:雖然按下述我的步驟可以保證90%的關(guān)聯(lián)成功率,但大家的電腦配置環(huán)境各不相同,有可能會出現(xiàn)大家預(yù)想不到的問題,沒關(guān)系,我?guī)湍爬琢藥追N常見問題^^ 具體可參見我之前發(fā)的帖子《ABAQUS和VS、IVF建立關(guān)聯(lián)的疑難問題解決經(jīng)驗》。 一、準備事項 原料:ABAQUS6.14、Microsoft Visual Studio 12.0(以下簡稱VS)、Intel Parallel Studio XE 2013(以下簡稱IVF)。我的配置:臺式機(64位win7)上ABAQUS6.14集成VS2013和IVF2013,以及筆記本(32位win7)上ABAQUS6.11集成VS2013和IVF2013。 請注意安裝次序:先安裝ABAQUS,其次VS,最后IVF。然后開始手工建立ABAQUS與VS、IVF的關(guān)聯(lián),這是本文的重點。 由于網(wǎng)上相關(guān)參考豐富,這里就再不敘述ABAQUS、VS和IVF的安裝過程了。
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abaqus+VS+IVF關(guān)聯(lián)
注意:由于軟件版本問題可能導致關(guān)聯(lián)失敗,本帖進行配置時測試的組合為 Windows 7 64位/ Windows 10 + ABAQUS 6.16 + Visual Studio 2010 + Intel Visual Fortran 2011/2013,此方法不能保證一定關(guān)聯(lián)成功,請見諒,以下為 ABAQUS 6.16 的下載地址: 鏈接: https://pan.baidu.com/s/1i44vzc5 提取碼: fkp8 以下以win7為例: 1.先安裝VS2010,再安裝IVF2011,順序不能顛倒,安裝完成后在開始菜單找到 Intel Parallel Studio XE 2011這一項,查看其子菜單是否有Parallel Studio XE 2011 with VS2011這一項,如果有說明VS與IVF關(guān)聯(lián)成功。
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【原創(chuàng)】ABAQUS和VS、IVF建立關(guān)聯(lián)的疑難問題解決經(jīng)驗 ¥3
安裝ABAQUS、VS、IVF之后,還需要手動建立軟件之間的關(guān)聯(lián),希望子程序能夠被調(diào)用、計算正常進行。然而貌似建立關(guān)聯(lián)之后,卻常遇到不能順利計算,甚至不能通過verification of user subroutine的困擾,讓人手足無措。 這篇文章,是我在實踐過程中(基于ABAQUS6.11、6.14,以及VS2013、IVF 2013)積累、總結(jié)出的幾類常見的比較頭疼的問題,力求圖文并茂,希望可以幫助大家盡快解決二次開發(fā)工具中的問題、避免煩憂,把精力放在有趣的研究上。歡迎關(guān)注、轉(zhuǎn)載、引用~ 感興趣的朋友,也可以下載這篇經(jīng)驗心得的pdf原件(文字可復(fù)制),收一瓶快樂水的辛苦費,感謝^^
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Abaqus2019+VS2017 + IVF2018 + Tosca 關(guān)聯(lián)教程 ¥50
一、軟件安裝順序:Abaqus2019、VS2017(在線安裝所需模塊)、IVF2018; 二、添加環(huán)境變量:我的電腦-屬性-高級系統(tǒng)設(shè)置-環(huán)境變量-系統(tǒng)變量-Path 1. 添加值:D:\Program Files (x86)\IntelSWTools\compilers_and_libraries_2018.3.210\windows\bin 2. 添加值:D:\Program Files (x86)\IntelSWTools\compilers_and_libraries_2018.3.210\windows\bin\intel64 三、修改文件abaqus.bat、****.bat文件 找到D:\SIMULIA\Command\abaqus.bat(不是abq2019),添加 @call ifortvars.bat intel64 vs2017如圖所示。
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IVF圖1
ABAQUS6.14關(guān)聯(lián)VS2012和IVF2013的步驟
在ABAQUS安裝目錄*\SIMULIA\Abaqus\Commands下找到abaq6141.bat,右鍵打開,編輯: 在VS2012的安裝路徑\Programs Files(x86)\Microsoft Visual Studio 11.0\VC中找到vcvarsall.dat 在abaq6141文件中第一行添加@call "C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio 11.0\VC\vcvarsall.bat" X64,修改后的文件如下: 在IVF2013的安裝路徑\Program Files (x86)\Intel\Composer XE 2013 SP1\bin中找到ifortvars.dat 修改abq6141內(nèi)容并保存如下: 運行Abaqus Verification進行檢查 在彈出的命令行中看到下列信息證明關(guān)聯(lián)成功了。 在最后彈出的verify.log中查看到以下信息,證明子程序可以使用。
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試管嬰兒40年歷程中 6大技術(shù)突破點
但5年后在與伴侶三次嘗試IVF方案,均以失敗告終后,她回到米德蘭生育醫(yī)學中心,希望解凍卵子,抓住最后的希望?!爸牢矣欣鋬雎炎邮莻€很大的安慰,尤其是在IVF方案行不通的情況下?!?詹妮共有14個冷凍卵子,且均成功解凍了,有四個卵子受精,但只有一個胚胎得以移植入子宮。兩周后,詹妮妊娠測試為陽性,最終邦尼(Bonnie)順利出生了。 邦尼(Bonnie)和媽媽。圖片來源:Daily Mail “發(fā)現(xiàn)懷孕時,我簡直無法相信。即使是在懷孕期間,我也總是擔心無法順利進行。邦尼是個天大的驚喜,我很感謝冷凍卵子玻璃化技術(shù)?!闭材萑缡钦f。她接受治療的費用為4500英鎊。 試管嬰兒技術(shù)帶來的變革是超乎想象的 西蒙·費舍爾(Simon Fishel)是劍橋IVF研究團隊的主要生育醫(yī)生,同時也是英國最大生育保健組織Care Fertility的創(chuàng)始人。他解釋說:“早期,取卵需要在診所呆上十天,因為需要每天進行十次尿液測試,來估算女性患者的自然排卵周期,而現(xiàn)在,我們可借用藥物來控制該周期?!?“實驗室的情況也有所變化。路易斯當時是在暖箱的試管里孕育的,而現(xiàn)在我們使用的是培養(yǎng)皿,可高度控制的孵化器和時間推移成像設(shè)備,還可通過智能手機實時查看胚胎的生長情況?!?“這在初期真的是無法想象的?!?“雖然高達88%的女性選擇自己的卵子和其另伴侶的精子結(jié)合,IVF技術(shù)同時也使得同性伴侶和單身女性擁有孩子的夢想成為現(xiàn)實,現(xiàn)在還被用于在癌癥等疾病治療前保留生育能力,防止嚴重疾病基因被代代遺傳或隔代遺傳?!?毋庸置疑,生育治療帶來的變革是超乎想象的。正如為首個試管嬰兒接生的韋伯斯特所言:“今天,對于有些人來說,IVF已成為其新的生活方式選擇。起初,它只是用來幫助那些輸卵管受損的女性,而現(xiàn)在,女性可以選擇在20多歲時冷凍卵子,然后在40歲到45歲時實現(xiàn)生育?!?/span>
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ABAQUS子程序二次開發(fā)的軟件配置
Abaqus子程序的二次開發(fā)需要配置IVF和VS。做好相關(guān)設(shè)置后可通過本文提供的案例進行驗證以證明軟件的配置是否正確。
ABAQUS (1) - ABAQUS二次開發(fā)環(huán)境配置
ABAQUS用戶子程序支持C++和Fortran語言,將ABAQUS同VISUAL STUDIO (VS)和INTEL VISUAL FORTRAN (IVF)進行關(guān)聯(lián)后,方可以運行子程序: (1)安裝及版本如下:ABAQUS 版本 2020,先安裝VS2013再安裝IVF2013 (2)在計算機中查找vcvarsall.bat和ifortvars.bat文件,得到其路徑: C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio 12.0\VC\vcvarsall.bat C:\Program Files (x86)\Intel\Composer XE 2013 SP1\bin\ifortvars.bat (3) 找到并打開ABAQUS安裝目錄Commands文件夾中的abq---.bat文檔(“----”為ABAQUS軟件版本號) (4) 編輯abq2020.bat文檔,在其中添加.bat文件路徑、VS和IVF的版本號并保存,示例如下: @call "C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio 12.0\VC\vcvarsall.bat" x86_amd64 @call "C:\Program Files (x86)\Intel\Composer XE 2013 SP1\bin\ifortvars.bat" intel64 vs2013 @echo off "C:\SIMULIA\EstProducts\2020\win_b64
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Abaqus2021+oneAPI2021+VS2019關(guān)聯(lián)配置方法
abaqus子程序需要調(diào)用Fortran編譯器,常用的Fortran編譯器就是intel visual Fortran,fortran編譯器又需要編譯環(huán)境,因此我們在運用abaqus子程序仿真之前都需要必備三款軟件: 1 abaqus——計算環(huán)境 2 IVF——Fortran編譯器 3 Visual studio ——fortran編譯環(huán)境 在2020之前,IVF是屬于Intel Parallel Studio EX 工具包中的一部分,從Intel Parallel Studio EX 2020版本之后,intel取消了該平臺,轉(zhuǎn)而開發(fā)了Intel oneAPI Tookit工具包,F(xiàn)ortran 編譯器也轉(zhuǎn)移到新的平臺。 對于只用到子程序開發(fā)的仿真人員來說,平臺的改變最大的變化就是,濃眉大眼的intel居然把它免費了!雖然abaqus2021+ Parallel Studio EX 2020+VS2019依然可行,但是oneAPI是未來的趨勢,在intel 官方搜索Parallel Studio都會自動跳轉(zhuǎn)到oneAPI去,遲早都得換。 何況免費正版他不香嗎? 目前網(wǎng)上abaqus+oneAPI+VS的配置教程不多,根據(jù)少量的資料和自己探索,簡單說下配置流程。好吧,廢話有點多了,下面進入正題。 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 安裝順序和之前是一致的,最底層的當然得最先安裝。
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Abaqus子程序配置Visual Studio及Fortran版本大全
出現(xiàn)這些錯誤的時候,首先要檢查VS 、FORTRAN、Abaqus三者版本是否匹配,一般來說,要選擇與Abaqus版本發(fā)行時間相近的VS以及IVF發(fā)行版本。比如Abaqus2018匹配VS2012就會出錯。如果版本匹配沒問題再檢查Abaqus子程序關(guān)聯(lián)設(shè)置是否有問題。這兩個問題都解決了,子程序驗證基本都能通過。 常用的VS與Fortran版本匹配 該圖是流傳比較廣的一張版本匹配圖配置子程序時,可以參照這張圖進行VS和IVF版本的選擇。
高溫模擬下冰塊的熱傳遞和融化過程 ¥19.89
然而僅僅安裝ABAQUS軟件并不能直接使用到用戶子程序的接口,需要關(guān)聯(lián)兩個軟件Visual Studio(VS)和Intel visual Fortran(IVF)。 1.安裝前置軟件。安裝Visual Studio 2015 和 Intel visual Fortran 2016及ABAQUS軟件。(需要先安裝Visual Studio 2015 再安裝 Intel visual Fortran2016 ,因為fortran運行器不能單獨運行,需要安裝在VS平臺上,且這樣IVF就能自動加載到VS的環(huán)境中,Intel visual Fortran的版本需要比Visual Studio 版本更高,ABAQUS的版本也需要適配,如下圖,但安裝順序無要求,本內(nèi)容的各應(yīng)用版本為:Visual Studio 2015 和Intel visual Fortran 2016及ABAQUS 2024,僅供參考。在這篇文章中有更詳細的介紹:https://mp.weixin.qq.com/s/QS70_OxhT-4C95um51RdRg) 圖 常用的VS與IVF版本匹配 PS:我在安裝軟件過程中遇到的問題: VS 2015安裝包損壞或丟失,通過網(wǎng)上尋找解決方案,試過很多個并沒有成功,最終在CSDN中這篇文章里第四個方法解決。(https://blog.csdn.net/hs_2017112123/article/details/122107693)。即“將你的安裝包所在的路徑復(fù)制到安裝失敗的界面那個搜索包,例如我的packages包在此路徑下:D:\vs2015\vs2015.pro_chs\packages,復(fù)制然后貼到搜索包,丟包后可以重復(fù)復(fù)制,繼續(xù)復(fù)制到安裝完成即可。安裝成功”。 2.三軟件關(guān)聯(lián)。安裝好軟件之后,就是進行這三款軟件的關(guān)聯(lián)。
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IVF圖2
#分享abaqus6.12-2018下載鏈接及安裝教程
與VS關(guān)聯(lián)的教程與軟件下載鏈接 包含abaqus6.14.1軟件,IVF軟件,VS軟件及三者的關(guān)聯(lián)教程,還有做盤Python二次開發(fā)的關(guān)聯(lián)軟件等 鏈接:https://pan.baidu.com/s/1zNwTYpTZ4gUJ1fcdLhmJug 提取碼:km1j
abaqus關(guān)聯(lián)Fortran子程序教程(包含安裝包) ¥3
接著,安裝IVF2013,安裝過程中,激活方式選擇使用license,其余安裝過程也只是點點點,無特別之處。我分享的鏈接中包含許可證文件,這一點請放心。安裝包鏈接在后方。 然后,右鍵點擊abaqus圖標,屬性,打開文件所在的位置,點擊找到launcher.bat文件,操作下圖。 最后,以文本打開方式打開launcher.bat文件,在最上方添加兩行內(nèi)容,即將Visual Studio 2012及Fortran與abaqus關(guān)聯(lián)起來。內(nèi)容如下: @call "C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio 11.0\VC\vcvarsall.bat" X64 @call "C:\Program Files (x86)\Intel\Composer XE 2013 SP1\bin\ifortvars.bat" intel64 vs2012 上述內(nèi)容為默認安裝路徑,若安裝過程中,修改了安裝路徑,則需要做相應(yīng)變化,如作者安裝過程中修改了Visual Studio 2012的安裝路徑,則第一行內(nèi)容為: @call "D:\Microsoft Visual Studio 11.0\VC\vcvarsall.bat" X64 操作示意圖如下圖。 以上安裝過程親測對abaqus2016/abaqus6.14有效,對于其他高版本的abaqus應(yīng)該也有效,但不敢保證。 也有網(wǎng)友指出: 查看abaqus所要求的的ivf編譯器的版本方法: 在cmd中輸入abaqus information=system 但本人親測此方法對于多個電腦安裝的不同版本的abaqus均無效。
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VS環(huán)境下調(diào)試ABAQUS 2016子程序的處理辦法
2.用文本編輯器打開“C:\SIMULA\Commands\abaqus.bat”(本人的ABAQUS安裝在了C盤),添加以下語句“@call "C:\Program Files (x86)\Intel\Composer XE 2013\bin\ifortvars.bat" intel64 vs2010”,本人修改結(jié)果如下: 注意:批處理文件ifortvars.bat的路徑一定要正確,這與你安裝的IVF版本有關(guān),它也可能在以下路徑:“C:\Program Files (x86)\Intel\Composer XE 2013 SP1\bin\ifortvars.bat” 3.接下來在Path中添加路徑。鼠標右擊我的電腦\屬性\高級系統(tǒng)設(shè)置\高級\環(huán)境變量,在系統(tǒng)變量中找到Path,點編輯,添加以下語句“C:\SIMULA\Commands;C:\SIMULA\CAE\win_b64\resources\install\cae;C:\Program Files (x86)\Intel\Composer XE 2013\redist\intel64\mkl;C:\Program Files (x86)\Intel\Composer XE 2013\redist\ia32\mkl;” 注意:要以分號隔開,并確保ABAQUS的安裝路徑和IVF2013的路徑正確。 4.用文本編輯器打開 “C:\SIMULA\Solver\win_b64\SMA\site\win86_64.env” 。 5.找到 "compile_fortran" 參數(shù), 將‘/Od’ 和 ‘/Zi’ 選項之前的注釋符號#刪除。本人的修改結(jié)果為: 6.找到 "link_sl" 參數(shù), 將‘/DEBUG’選項之前的注釋符號#刪除。
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你不知道的CAE小常識(二十六)
基本編譯思想:寫好fortran子程序之后,通過IVF編譯器以及nmake命令編譯for子程序,生成obj目標文件和求解器。 簡化方法: 1、利用文本編輯器寫fortran子程序,起個方便查看的名字, 存為.f格式文件,比如umat41-for-shell.f。 2、打開dyn21.f文件,注釋掉subroutine umat41 (cm,eps,sig,epsp,hsv,dt1,capa,etype,tt,temper,failel,crv,cma)下這一整個子程序的語句(包括這個語句),或者直接刪掉這部分子程序的內(nèi)容。保存dyn21.f。 3、用文本編輯器打開makefile,做如下修改: 1) OBJS= dyn21.obj dyn21b.obj一行中,增加umat41-for-shell.obj。變?yōu)镺BJS= dyn21.obj dyn21b.obj umat41-for-shell.obj 2)參照dyn21.obj: dyn21.F $(FC) $(FFLAGS) dyn21.F 格式,書寫兩行語句 umat41-for-shell.obj:umat41-for-shell.f $(FC) $(FFLAGS) umat41-for-shell.f 比如: dyn21.obj: dyn21.F $(FC) $(FFLAGS) dyn21.F dyn21b.obj: dyn21b.F $(FC) $(FFLAGS) dyn21b.F umat41-for-shell.obj: umat41-for-shell.f $(FC) $(FFLAGS) umat41-for-shell.f 然后保存makefile。 3)用IVF編譯器和nmake命令編譯子程序。這步以及后續(xù)的步驟與df_af_aq寫的基本流程一樣。
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