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帖子 GROMACS復(fù)雜體系構(gòu)建之利用CHARMM-GUI工具
之前本公眾號(hào)介紹過GROMACS中膜蛋白體系構(gòu)建。按照官方的介紹,通過將磷脂構(gòu)象盒力場(chǎng)準(zhǔn)備好,然后在模擬盒子內(nèi)進(jìn)行磷脂的組裝,最后將蛋白嵌入在磷脂膜內(nèi)。上述步驟雖然可以較為準(zhǔn)確的構(gòu)建模擬體系,但是并不方便調(diào)整,例如磷脂多樣性的選擇以及膜蛋白在膜內(nèi)的位置和角度。本次向大家介紹一種方便的體系構(gòu)建方法:利用CHARMM-GUI工具構(gòu)建。
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320科技工作室 ??? 2年前
GROMACS復(fù)雜體系構(gòu)建之利用CHARMM-GUI工具
帖子 Gromacs模擬體系構(gòu)建----進(jìn)階版
之前,本公眾號(hào)介紹過一系列體系的模擬以及gromacs的使用辦法和教程。本次,將為大家介紹一種進(jìn)階版的模型構(gòu)建方法。在之前的介紹中,我們了解到可以通過insert-molecules和editconf等命令構(gòu)建模擬初始體系
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320科技工作室 ??? 2年前
Gromacs模擬體系構(gòu)建----進(jìn)階版
帖子 如何構(gòu)建智能駕駛泛場(chǎng)景數(shù)據(jù)體系
從企業(yè)側(cè)及行業(yè)側(cè)的迫切需求及海量數(shù)據(jù)的實(shí)踐應(yīng)用出發(fā),智能駕駛泛場(chǎng)景數(shù)據(jù)體系的建立迫在眉睫。中汽數(shù)據(jù)有限公司(以下簡(jiǎn)稱“中汽數(shù)據(jù)”)圍繞智能駕駛泛場(chǎng)景的應(yīng)用與推廣,聚焦行業(yè)共性難題,從數(shù)據(jù)、場(chǎng)景、標(biāo)準(zhǔn)、評(píng)價(jià)多個(gè)維度展開研究及實(shí)踐,完成智能駕駛泛場(chǎng)景數(shù)據(jù)體系架構(gòu)構(gòu)建、跨仿真器通用場(chǎng)景數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)引擎工具鏈開發(fā),并以標(biāo)準(zhǔn)及白皮書等形式面向國(guó)際持續(xù)輸出“中國(guó)經(jīng)驗(yàn)”,全方位促進(jìn)智能駕駛技術(shù)研發(fā)落地。
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智享汽車圈 ??? 4年前
如何構(gòu)建智能駕駛泛場(chǎng)景數(shù)據(jù)體系?
帖子 探討如何構(gòu)建端到端高置信度驗(yàn)證體系?
依托這套可驗(yàn)證的物理一致性框架,aiSim 有效縮小了仿真與現(xiàn)實(shí)之間的差距,構(gòu)建了可工程落地的高置信度仿真體系。
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康謀keymotek ??? 5月前
探討如何構(gòu)建端到端高置信度驗(yàn)證體系?
帖子 構(gòu)建高精度橡膠仿真模型:面向耐久性預(yù)測(cè)的材料測(cè)試體系
我們深刻理解構(gòu)建精準(zhǔn)材料參數(shù)體系的技術(shù)挑戰(zhàn),所提供的系統(tǒng)化測(cè)試服務(wù)旨在直接支撐您的耐久性仿真與設(shè)計(jì)優(yōu)化工作。若您希望探討如何為您的產(chǎn)品構(gòu)建精準(zhǔn)的仿真材料參數(shù)體系,我們已準(zhǔn)備好隨時(shí)提供技術(shù)支持。—關(guān)注我們,了解更多精彩—
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Endurica ??? 1月前
構(gòu)建高精度橡膠仿真模型:面向耐久性預(yù)測(cè)的材料測(cè)試體系
帖子 光伏電站智慧化運(yùn)維,構(gòu)建高質(zhì)量管理體系
光伏智慧運(yùn)維系統(tǒng)應(yīng)運(yùn)而生,構(gòu)建高質(zhì)量管理體系。 一、光伏智慧運(yùn)維系統(tǒng)的原理主要包括能源監(jiān)測(cè)與數(shù)據(jù)采集、智能控制與優(yōu)化調(diào)度、信息化平臺(tái)與運(yùn)維管理。首先通過安裝在光伏電站上的監(jiān)測(cè)設(shè)備,可以實(shí)時(shí)采集光伏發(fā)電系統(tǒng)的各項(xiàng)數(shù)據(jù),包括電壓、電流、功率和溫度等。這些數(shù)據(jù)通過物聯(lián)網(wǎng)技術(shù)傳輸?shù)皆破脚_(tái),形成大數(shù)據(jù),為后續(xù)的運(yùn)維和優(yōu)化提供依據(jù)。
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鷓鴣云光伏軟件 ??? 2年前
光伏電站智慧化運(yùn)維,構(gòu)建高質(zhì)量管理體系
帖子 溫度-應(yīng)力耦合作用下PTFE壓縮蠕變機(jī)理與檢測(cè)體系構(gòu)建
聚四氟乙烯(PTFE)作為一種典型的高分子材料,憑借其卓越的耐腐蝕性、低摩擦因數(shù)和化學(xué)穩(wěn)定性,經(jīng)常作為往復(fù)液壓密封件使用。然而,由于其長(zhǎng)期處于承載條件下,故產(chǎn)生的壓縮蠕變會(huì)引起尺寸的變化,發(fā)生密封件根部擠壓損壞現(xiàn)象,在密封系統(tǒng)中影響密封性能。壓縮蠕變和磨損均會(huì)引起PTFE材料尺寸的變化,因此,深入研究 PTFE 的壓縮蠕變機(jī)理,建立科學(xué)的檢測(cè)方法,對(duì)提升 PTFE 制品的工程可靠性具有重要意義
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國(guó)高材高分子材料產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新中心 ??? 12月前
溫度-應(yīng)力耦合作用下PTFE壓縮蠕變機(jī)理與檢測(cè)體系構(gòu)建
帖子 基于BIM的仿真技術(shù)在巖溶隧道防排水體系優(yōu)化中的應(yīng)用技術(shù)研究
,為運(yùn)營(yíng)期養(yǎng)護(hù)維修提供基礎(chǔ)資料,形成的防排水體系數(shù)字系統(tǒng)用于運(yùn)營(yíng)維護(hù)十分必要,研究成果可為類似工程的施工提供參考。
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學(xué)土木的搬磚人 ??? 2年前
基于BIM的仿真技術(shù)在巖溶隧道防排水體系優(yōu)化中的應(yīng)用技術(shù)研究
帖子 數(shù)字孿生需要體系化思維
體系構(gòu)建的數(shù)字孿生體能夠有機(jī)融合云計(jì)算、大數(shù)據(jù)、人工智能等多種技術(shù),在工業(yè)領(lǐng)域體現(xiàn)出了蓬勃的生機(jī),在產(chǎn)品全壽命周期上,覆蓋了研發(fā)設(shè)計(jì)、生產(chǎn)制造、使用運(yùn)維各個(gè)階段;在產(chǎn)品構(gòu)成上,從單個(gè)的個(gè)體組件到各個(gè)重要系統(tǒng)再到產(chǎn)品各個(gè)周期中所處的體系;從建模方法上,綜合運(yùn)用混合建模的方法,將機(jī)理建模、仿真建模、數(shù)據(jù)建模合理運(yùn)用,構(gòu)建體系化的數(shù)字孿生體主要目的就是為實(shí)際業(yè)務(wù)決策提供科學(xué)依據(jù),對(duì)當(dāng)前狀態(tài)進(jìn)行準(zhǔn)確評(píng)估,
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安世亞太 ??? 3年前
數(shù)字孿生需要體系化思維
帖子 算網(wǎng)一體:網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)及技術(shù)體系
算網(wǎng)一體協(xié)議主要作用在域間的算網(wǎng)一體演進(jìn),從 OSI 七層協(xié)議模型演進(jìn)而來,分層引入新信息、新能力,構(gòu)建算網(wǎng)一體協(xié)議體系。(五)能力體系算網(wǎng)一體的新型能力體系,包括資源布局、編排、調(diào)度等能力。(六)服務(wù)體系算網(wǎng)一體的新型服務(wù)體系,包括交易、激勵(lì)等服務(wù),將催生新的商業(yè)模式。
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牛頓家的計(jì)算機(jī) ??? 3年前
算網(wǎng)一體:網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)及技術(shù)體系
帖子 基于Gromacs進(jìn)行膜蛋白體系的分子動(dòng)力學(xué)模擬
并且在該步驟利用蛋白和磷脂力場(chǎng)構(gòu)建需要的topol文件。3. 選擇合適的蛋白和磷脂取向。由于膜蛋白的取向和在膜上的高度是固定的,因此要根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道確定合適的取向和位置。該步驟可使用trjconv和editconf等命令可以進(jìn)行構(gòu)象的調(diào)整。如圖所示4. 磷脂對(duì)蛋白質(zhì)的包裹。由于上個(gè)步驟中構(gòu)建體系僅僅是調(diào)整了取向,磷脂還是非常松散,因此需要將磷脂進(jìn)行收縮堆積。
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320科技工作室 ??? 3年前
基于Gromacs進(jìn)行膜蛋白體系的分子動(dòng)力學(xué)模擬
帖子 行業(yè)案例 | MBSE解決方案(二):基于DoDAF的武器裝備體系結(jié)構(gòu)建模
從系統(tǒng)工程的角度對(duì)導(dǎo)彈作戰(zhàn)單元體系進(jìn)行分析,按照作戰(zhàn)目標(biāo)、作戰(zhàn)活動(dòng)、能力要素、性能指標(biāo)的順序,層層分解得到從使命任務(wù)出發(fā)的性能需求結(jié)構(gòu),從而建立合理的作戰(zhàn)能力評(píng)估指標(biāo)體系。從建立指標(biāo)體系的過程可知:該方法可以避免專家在指標(biāo)體系建立過程中主觀因素的影響,能夠客觀表示出導(dǎo)彈作戰(zhàn)單元的作戰(zhàn)能力,使指標(biāo)體系構(gòu)建更加符合實(shí)際需求。
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一起學(xué)MBSE ??? 2年前
行業(yè)案例 | MBSE解決方案(二):基于DoDAF的武器裝備體系結(jié)構(gòu)建模
帖子 MBSE系統(tǒng)架構(gòu)入門之DODAF全視圖模型介紹
對(duì)于轉(zhuǎn)載文章,公眾號(hào)會(huì)表明出處,如果無法找到真正來源或標(biāo)錯(cuò)來源,或?qū)τ谖闹兴褂玫膱D片,資料,下載鏈接中所包含的軟件,資料等,讀者認(rèn)為不合適的,或如有侵權(quán),請(qǐng)聯(lián)系公眾號(hào),我們會(huì)第一時(shí)間修訂或刪除,以維護(hù)原創(chuàng)者的權(quán)益。熱誠(chéng)歡迎大家監(jiān)督,建議和批評(píng)指
3300
一起學(xué)MBSE ??? 2年前
MBSE系統(tǒng)架構(gòu)入門之DODAF全視圖模型介紹
帖子 CCS船舶數(shù)字規(guī)范體系研究
基于此,船舶數(shù)字系統(tǒng)的測(cè)試驗(yàn)證可分為以下四個(gè)步驟: 1.構(gòu)建評(píng)價(jià)指標(biāo)體系。通過分析船載系統(tǒng)的業(yè)務(wù)預(yù)期和能力需求,明確系統(tǒng)的輸入和輸出,確定船載系統(tǒng)的評(píng)價(jià)指標(biāo)體系, 同時(shí)建立船載系統(tǒng)的能力特征庫(kù); 2.生成仿真數(shù)據(jù)樣本。
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學(xué)有所長(zhǎng) ??? 2年前
CCS船舶數(shù)字規(guī)范體系研究
帖子 萬(wàn)字長(zhǎng)文解析特斯拉自動(dòng)駕駛體系
整體而言,特斯拉的自動(dòng)駕駛架構(gòu)是采用純視覺方案實(shí)現(xiàn)對(duì)世界的感知,并基于原始視頻數(shù)據(jù)通過神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建出真實(shí)世界的三維向量空間,在向量空間中通過傳統(tǒng)規(guī)控方法與神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)相結(jié)合的混合規(guī)劃系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)汽車的行為與路徑規(guī)劃,生成控制信號(hào)傳遞給執(zhí)行機(jī)構(gòu),同時(shí)通過完善的數(shù)據(jù)閉環(huán)體系和仿真平臺(tái)實(shí)現(xiàn)自動(dòng)駕駛能力的持續(xù)迭代。
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駕駛哥 ??? 4年前
萬(wàn)字長(zhǎng)文解析特斯拉自動(dòng)駕駛體系
帖子 新能源汽車質(zhì)量保證體系與傳統(tǒng)汽車單元測(cè)試規(guī)范的融合研究
與此同時(shí),傳統(tǒng)汽車經(jīng)過百年發(fā)展已形成完善的測(cè)試驗(yàn)證體系,特別是ISO 26262功能安全標(biāo)準(zhǔn)在汽車電子控制單元(ECU)測(cè)試中積累了豐富經(jīng)驗(yàn)。如何借鑒傳統(tǒng)汽車成熟的測(cè)試方法論和工具鏈,構(gòu)建適合新能源汽車特點(diǎn)的質(zhì)量保證體系,成為行業(yè)亟待解決的問題。
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Tomny ??? 6月前
帖子 GROMACS模擬流程與力場(chǎng)構(gòu)建
對(duì)于結(jié)晶水可用grep –v HOH命令清除,然后通過gmx pdb2gmx命令選擇的蛋白N、C端電荷狀態(tài),水溶劑模型以及時(shí)候忽略原有結(jié)構(gòu)中的H原子,最重要的是通過軟件自帶的力場(chǎng)文件在該處產(chǎn)生適合體系的力場(chǎng)。
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320科技工作室 ??? 4年前
GROMACS模擬流程與力場(chǎng)構(gòu)建
帖子 用轉(zhuǎn)速轉(zhuǎn)矩傳感器驅(qū)動(dòng)的電機(jī)故障先兆量化指標(biāo)體系?
用轉(zhuǎn)速轉(zhuǎn)矩傳感器驅(qū)動(dòng)的電機(jī)故障先兆量化指標(biāo)體系,為電機(jī)運(yùn)行狀態(tài)的監(jiān)測(cè)提供了新的視角。在當(dāng)前數(shù)字化、智能化的工業(yè)環(huán)境中,構(gòu)建這樣一個(gè)指標(biāo)體系不僅能夠提升電機(jī)的可靠性與安全性,也為實(shí)現(xiàn)設(shè)備的智能維護(hù)和管理奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。 一、降噪類算法 ·低通濾波:設(shè)計(jì)合適截止頻率的低通濾波器,如巴特沃斯低通濾波器。
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博揚(yáng)智能 ??? 7月前
用轉(zhuǎn)速轉(zhuǎn)矩傳感器驅(qū)動(dòng)的電機(jī)故障先兆量化指標(biāo)體系?
帖子 用轉(zhuǎn)速轉(zhuǎn)矩傳感器驅(qū)動(dòng)的電機(jī)故障先兆量化指標(biāo)體系?
用轉(zhuǎn)速轉(zhuǎn)矩傳感器驅(qū)動(dòng)的電機(jī)故障先兆量化指標(biāo)體系,為電機(jī)運(yùn)行狀態(tài)的監(jiān)測(cè)提供了新的視角。在當(dāng)前數(shù)字化、智能化的工業(yè)環(huán)境中,構(gòu)建這樣一個(gè)指標(biāo)體系不僅能夠提升電機(jī)的可靠性與安全性,也為實(shí)現(xiàn)設(shè)備的智能維護(hù)和管理奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。 一、降噪類算法 ·低通濾波:設(shè)計(jì)合適截止頻率的低通濾波器,如巴特沃斯低通濾波器。
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博揚(yáng)智能 ??? 2月前
用轉(zhuǎn)速轉(zhuǎn)矩傳感器驅(qū)動(dòng)的電機(jī)故障先兆量化指標(biāo)體系?
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