現(xiàn)在國內(nèi)的開放式機(jī)群環(huán)境越來越多，許多都部署了fluent（大好事），不過還是有許多人不太清楚如何利用這些有用的資源。這里結(jié)合我所在單位的情況做一個(gè)簡單的介紹，其他的機(jī)群環(huán)境大同小異。

1、          什么是機(jī)群？有什么特點(diǎn)？

機(jī)群又叫集群，當(dāng)然就是許多的計(jì)算機(jī)（廢話），因?yàn)闄C(jī)器太多了，又需要協(xié)同工作，所以需要按照一定的方式來管理，管理的結(jié)構(gòu)形式叫做拓?fù)洌ㄟ@個(gè)不用管）。機(jī)群使用的電腦是刀片（又薄又長的機(jī)箱）形式（為了便于插入機(jī)柜），一個(gè)刀片一般稱為一個(gè)節(jié)點(diǎn)。

一般而言，機(jī)群會(huì)分為三種節(jié)點(diǎn)：管理節(jié)點(diǎn)（若干臺(tái)），編譯節(jié)點(diǎn)（若干臺(tái)），計(jì)算節(jié)點(diǎn)（其余全部）。這三種節(jié)點(diǎn)的配置略有不同（廢話），管理節(jié)點(diǎn)主要用來存儲(chǔ)使用機(jī)群的用戶的信息，如名字，密碼，可以使用機(jī)器數(shù)的權(quán)限，用戶狀態(tài)等等；編譯節(jié)點(diǎn)一般用來預(yù)查程序故障，用戶的程序先在這里試運(yùn)行，查看是否與系統(tǒng)兼容等；計(jì)算節(jié)點(diǎn)用來直接計(jì)算其他節(jié)點(diǎn)提供來的程序。

就配置而言，管理節(jié)點(diǎn)和編譯節(jié)點(diǎn)一般相同，會(huì)部署軟件環(huán)境；計(jì)算節(jié)點(diǎn)只會(huì)部署簡單的必要運(yùn)行文件。計(jì)算機(jī)點(diǎn)之間會(huì)采用高速交換機(jī)，速度可達(dá)幾十GB/s，如IB等；計(jì)算節(jié)點(diǎn)與編譯、登陸節(jié)點(diǎn)之間采用普通的萬兆交換機(jī)。

2、          如何使用機(jī)群？

機(jī)群中一般采用linux操作系統(tǒng)來操作（多用戶情況下效率高），用戶會(huì)通過遠(yuǎn)程登錄軟件（如xshell）來登錄到登陸節(jié)點(diǎn)進(jìn)行個(gè)人的操作（一般會(huì)通過VPN網(wǎng)絡(luò)加密數(shù)據(jù)傳輸）。

Linux集群將程序任務(wù)分解發(fā)送到計(jì)算節(jié)點(diǎn)上時(shí)，是通過LSF作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)（也有其他的，如PBS等）來實(shí)現(xiàn)的，這個(gè)系統(tǒng)的作用是使整個(gè)機(jī)群負(fù)載均衡，便于管理，所以我們使用fluent也要通過這個(gè)系統(tǒng)。在成熟的集群中，用戶登錄之后，默認(rèn)便可以使用作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)了。使用時(shí)，除了常見的linux命令以外，調(diào)度系統(tǒng)也有一些簡單的命令，這個(gè)一般會(huì)有手冊介紹，常用的就3、5個(gè)，很好記。

3、          如何在集群中使用fluent？

因?yàn)?/span>fluent是成熟的封裝好的商業(yè)軟件，所以用戶直接使用命令調(diào)用即可。

但是因?yàn)榇蟛糠值?/span>linux下的遠(yuǎn)程登錄是不支持圖形界面的，所以我們看不到在windows下的熟悉界面，無法進(jìn)行操作。其實(shí)，fluent最早也是linux下的軟件，它提供了一種jou腳本來操作各種命令（即幫助中的TUI命令），我們在windows的圖形界面中，也可以在控制臺(tái)窗口中查看如何使用。這樣，我們在啟動(dòng)fluent軟件時(shí)，指定它的jou執(zhí)行腳本即可使軟件按照我們的意圖來進(jìn)行操作了。如果在幫助中找太慢，可以在windows的fluent圖形界面下，右下角控制臺(tái)中用回車鍵顯示文字命令，q鍵返回。

4、          實(shí)例

這里給出一個(gè)在LSF調(diào)度系統(tǒng)中使用fluent的實(shí)例：

首先，使用bsub命令提交LSF腳本（名字為fluent.lsf），在命令窗口中鍵入:bsub fluent.lsf即可。

腳本內(nèi)容如下：

#!/bin/sh  （這句話是說此腳本使用/bin/sh來解釋執(zhí)行，小白可以略過）

APP_NAME=fluent  （這句話是說此腳本調(diào)用名字為fluent的集群排序提交隊(duì)列，小白繼續(xù)略過）

NP=2 （這句話是說此腳本的任務(wù)將調(diào)用2個(gè)CPU core來執(zhí)行）

NP_PER_NODE=1 （這句話是說此腳本的任務(wù)將在分配用來執(zhí)行任務(wù)的每個(gè)節(jié)點(diǎn)上調(diào)用1個(gè)CPU core來執(zhí)行）

RUN="fluent 2ddp -g -i fluent.jou -r15.0.0 -pib –mpi=pcmpi" （這句話是說此腳本的執(zhí)行命令以及參數(shù)，2ddp 是指二維雙精度類型計(jì)算，這個(gè)大家應(yīng)該熟悉了；fluent.jou就是我們使用的fluent命令執(zhí)行腳本的名字）

 

fluent.jou腳本內(nèi)容實(shí)例：

/file/read-case ./boil-unstdy.cas （讀取cas文件，boil-unstdy.cas）

/file/read-data ./boil-unstdy.dat  （讀取dat文件，boil-unstdy.dat）

define/user-defined/compiled-function/compile （定義編譯函數(shù)庫并制定編譯文件）

libudf

yes

boiling-rpi-model.c

 

 

define/user-defined/compiled-function/load （加載編譯函數(shù)庫）

libudf

/file/auto-save/data-frequency 100 （自動(dòng)保存）

/solve/initialize/initialize-flow（初始化）

/solve/dual-time-iterate （求解循環(huán)設(shè)置）

500

20

/file/read-data ./boil-unsteady-out.dat （保存結(jié)果）

exit （退出fluent）

yes