基于CP2K的高溫下烷烴裂解分子動力學模擬
關鍵詞:CP2K;烷烴;裂解;高溫;分子模擬
在有氧氣的情況下,物質在高溫下發生的分解稱為燃燒,而在沒有氧氣的情況下則稱為熱解。烷烴的質量越大,支鏈越多,熱解的速率通常也會越大。烷烴的裂解涉及到C-C和C-H鍵的斷裂,是自由基機理。本案例將通過CP2K軟件實現烷烴的熱解反應。
初始模型的構建
首先通過packmol軟件將10個正葵烷插入到3*3*3 nm3的立方盒子中,輸入文件如圖1所示:
圖1 packmol 輸入文件
所構建的初始模型如圖2所示:
圖2 十條正葵烷分子鏈初始模型
在CP2K的輸入文件中任務類型選擇MD,理論方法采用GFN1-xTB,采用NVT系綜,熱浴采用CSVR,溫度設為3500K(溫度設置較高加快反應的進行),熱浴TIMECON設為100,步數STEPS設為50000,步長TIMESTEP設為0.2,部分輸入文件如圖3所示:
圖3 CP2K部分輸入文件
可以看到,隨著模擬的進行,經過10 ps后,正葵烷被裂解為大量的小分子碎片。如圖4所示,體系中不存在完整的正葵烷分子鏈。
圖4 模擬過程中正葵烷分子鏈的裂解情況
我們進一步考察體系中具有不同成鍵數的碳原子的數目變化(圖5),可以看到,有100個C原子的成鍵數都是4,因為體系一開始所有的C原子都來自正葵烷,都屬于sp3碳,10條正葵烷分子鏈總共是100個碳原子。隨著模擬的進行,長鏈烴開始裂解,開始出現短鏈烴烷,烯烴和炔烴,因此C(4)逐漸減少,C(3),C(2)逐漸增多。C(1)和C(0)主要來自于一些不穩定的分子碎片。從圖6也可以看出,C-C鍵和C-H鍵在數目在反應過程中也在逐漸減少。
圖5 模擬過程中具有不同成鍵數的碳原子的數目變化
圖6 模擬過程中C-C和C-H鍵數目的變化
結語
本案例通CP2K成功實現了正葵烷分子鏈的熱裂解反應,對于相關領域的研究人員和工程師來說,本案例提供了一個有力的工具,可以為解決實際問題提供理論依據和技術支持
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