計(jì)算比旋光度的基本流程：

1. 首先優(yōu)化分子結(jié)構(gòu)
2. 使用優(yōu)化好的分子作為初始結(jié)構(gòu)，用更大的基組進(jìn)行比旋光度計(jì)算
3. 計(jì)算結(jié)果分析

計(jì)算比旋光度的基本操作：

以甲基環(huán)氧乙烷作為例子，通過計(jì)算兩種手性分子構(gòu)型的比旋光度，并與實(shí)驗(yàn)值對比，以確定分子的絕對構(gòu)型。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)我們選用氣相條件下，在355nm和633nm下測得的比旋光度。

1、對映體的結(jié)構(gòu)優(yōu)化：

S構(gòu)型甲基環(huán)氧乙烷結(jié)構(gòu)優(yōu)化的輸入文件如下

R構(gòu)型甲基環(huán)氧乙烷結(jié)構(gòu)優(yōu)化的輸入文件:

2、對映體的比旋光度計(jì)算：

使用第一步優(yōu)化得到的結(jié)構(gòu)作為初始結(jié)構(gòu)，計(jì)算S和R型甲基環(huán)氧乙烷的比旋光度。計(jì)算S和R型甲基環(huán)氧乙烷在氣相條件下，355nm和633nm入射光下比旋光度的輸入文件分別如下。

S構(gòu)型甲基環(huán)氧乙烷比旋光度計(jì)算的輸入文件:

R構(gòu)型甲基環(huán)氧乙烷比旋光度計(jì)算的輸入文件:

如果上一步優(yōu)化步驟已經(jīng)保存了check文件，比如opt.chk,則可以簡化為下面的輸入文件：

3、Gaussview查看結(jié)果：

利用GaussView查看分子的比旋光度，我們以S構(gòu)型甲基環(huán)氧乙烷比旋光度計(jì)算結(jié)果為例，步驟如下：

1、GaussView 6 | File | Open

打開文件：S-enantiomer-OR.log

2、GaussView 6 | Results | ORD

在Results下拉菜單中點(diǎn)擊ORD選項(xiàng)，將顯示不同入射波長下的比旋光度。用鼠標(biāo)點(diǎn)擊圖中的點(diǎn)，在下方將顯示指定波長下比旋光度。

4. 從Gaussian輸出文件查看

除了用GaussView查看外，還可以直接從輸出文件里查看，找[Alpha]行就可以，比如下面這個(gè)樣子:

其中，[Alpha] ( 5893.0 A) = -366.99 deg就是[α]589.30=-366.99°的意思。

5、結(jié)果分析：

利用同樣的方法我們可以查看每個(gè)構(gòu)型在不同入射頻率下的的比旋光度，下表列出了所有計(jì)算和實(shí)驗(yàn)得到的比旋光度，可以看出在這個(gè)例子中，S構(gòu)型計(jì)算得到的比旋光度與實(shí)驗(yàn)測得的更為接近，因此我們認(rèn)為實(shí)驗(yàn)測量的分子為S構(gòu)型，這也與事實(shí)一致。

最后，有相關(guān)需求，歡迎通過公眾號“320科技工作室”與我們聯(lián)絡(luò)。