[lammps教程]OVITO繪制原子運動軌跡線

一區Script Materialia期刊:多主元素合金中的短程有序域擴散一文,研究了CrCoNi合金和MoNbTa合金中原子的擴散過程,文中有出現如下圖所示的原子運動軌跡線。這種原子運動軌跡線我們在研究擴散過程中常常會用到。

[lammps教程]OVITO繪制原子運動軌跡線的圖1

[lammps教程]OVITO繪制原子運動軌跡線的圖2

圖參考自:Bin Xing, Xinyi Wang, William J. Short-range order localizing diffusion in multi-principal element alloys,Scripta Materialia, 2022

本文將介紹如何利用OVITO軟件再現文章的不同顏色的原子的軌跡圖

1、打開OVITO界面并且導入數據文件

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2、選擇該原子模型的某一面,我選擇的視角為(left)

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3、開始將該原子面開始刪除為只包含一層原子的模型,先采用Expression selection,并且在Boolean expression中選擇Position.X <=1

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4、采用Invert selection 進行反向選擇

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5、采用Delete selected 將反選擇好的原子刪除掉,得到了只有一層原子面

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6、選擇Manual selection中的Pick對該原子表面的其中一個原子進行標定

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7,選擇Generate trajectory lines,選擇加載的原子軌跡為5000幀,加載完之后在Tracjectory display中修改軌跡的顏色以及線寬,如下

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得到該選定原子的5000幀之前的全部原子軌跡

8,若想得到其他原子不同顏色的軌跡,重復上述操作7,本次操作只選擇5種不同顏色的原子軌跡圖

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由于所選擇的原子并非在原子表面移動,所以,根據實際情況而定,這樣就初步得到3個不同顏色的原子軌跡

9、將這一層原子的顏色調整成一種顏色,(根據個人喜好來),然后調整原子的半徑大小

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最后,有相關需要歡迎通過公眾號“320科技工作室”與我們聯系

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