直通 Wolfram 研發(fā):Wolfram 化學(xué)概覽
Wolfram語言中的化學(xué)簡(jiǎn)史
ChemicalData -> Entity -> Molecule
化學(xué)表達(dá)式
ChemicalFormula
ChemicalReaction
MoleculeName
FindIsomers
分子可視化
原子和鍵合標(biāo)簽
新的繪圖功能
模式匹配
MoleculeMatchQ
MoleculeSubstructureCount, MoleculeContainsQ, MoleculeFreeQ
化學(xué)轉(zhuǎn)換
FeaturespacePlot
Wolfram化學(xué)資源
ChemicalData
"Chemical" 實(shí)體
從第10版開始,實(shí)體為Wolfram知識(shí)庫提供了一個(gè)統(tǒng)一的接口
擴(kuò)展了查詢多個(gè)實(shí)體或多個(gè)屬性的語法
Molecule:一個(gè)可計(jì)算的化學(xué)對(duì)象
第12版引入了Molecule,一個(gè)可計(jì)算的對(duì)象,可以代表任何單一的分子:
一個(gè)分子是由原子和鍵組成的:
分子屬性按需計(jì)算:
可以通過 MoleculeModify 輕松改變結(jié)構(gòu):
ChemicalFormula
-
一個(gè) "化學(xué) "實(shí)體代表一個(gè)在知識(shí)庫中具有記錄的單一化學(xué)物類,其具有完整的屬性,如熔點(diǎn)、比熱容等;
-
一個(gè)分子可以是任何化學(xué)結(jié)構(gòu),必須有指定的連通性;
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化學(xué)式(ChemicalFormula)只有一個(gè)原子類型及其系數(shù)的列表——它代表具有給定公式的任何(或所有)化學(xué)物類。
-
化學(xué)式有明確的分子質(zhì)量和電荷:
-
一個(gè)分子可以與一個(gè)給定的公式相匹配
ChemicalReaction
獲取反應(yīng)物或產(chǎn)物:
獲取產(chǎn)物的計(jì)數(shù):
顯示反應(yīng)式:
根據(jù)方程式串創(chuàng)建化學(xué)反應(yīng):
這里的輸入被解釋為化學(xué)式:
根據(jù) ReactionSMILES 字符串創(chuàng)建化學(xué)反應(yīng):
在這里,反應(yīng)的組成部分是分子對(duì)象:
使用 IUPAC 名稱創(chuàng)建分子。
使用繪圖主題來控制是否顯示氫或如何描述芳烴鍵。
MoleculePlot3D 有助于快速生成交互式繪圖,其繪圖主題對(duì)應(yīng)于常見情形。
通過參考原子索引來突出原子或鍵。
-
AtomLabels 和 BondLabels 是 MoleculePlot 和 MoleculePlot3D 的新選項(xiàng)。
范例:TNT 分子圖,按其氧化狀態(tài)標(biāo)記所有的碳原子和氮原子
MoleculeMatchQ
-
加入其他 Molecule 模式匹配函數(shù):
FindMoleculeSubstructure
MoleculeContainsQ
MoleculeFreeQ
MoleculeSubstructureCount
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找到在氧和氮之間有一個(gè)芳香鍵的異構(gòu)體,并將它們排列在最大的共同子結(jié)構(gòu)上
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本范例使用了 FindIsomers、MoleculeContainsQ、MoleculeMaximumCommonSubstructure 和 MoleculeAlign
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現(xiàn)在在三維空間中排列所有分子
計(jì)算 2300 毫克鈉所含的毫摩爾數(shù):
12.3 版本為分子對(duì)象引入了新的內(nèi)置特征提取器。
-
化學(xué)工具
Wolfram 函數(shù)資源庫——專業(yè)化學(xué)函數(shù)
Wolfram 數(shù)據(jù)資源庫——可計(jì)算化學(xué)數(shù)據(jù)組
-
計(jì)算器 減少認(rèn)知負(fù)荷,促進(jìn)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中更深層次的化學(xué)思維。
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