目前計算生物學領域的研究主要集中在蛋白質行為的模擬、藥物分子的篩選、基因測序等方面。高性能計算在這些領域成功應用所取得的成果也是有目共睹的。北鯤云超算作為將云計算應用于生命科學領域的實踐者，在藥物篩選，及基因組解析方面的成功應用也得到了業內的廣泛認可。利用高性能計算進行虛擬藥物篩選目前已經成為西藥新藥開發的一條嶄新和重要的途徑，但對于中醫藥的研究卻始終沒有很大的進展。

盡管云計算能夠取代大部分高性能計算的功能，而且云計算為藥物研發提供基礎算力是一個備受業內人士看好的方向，但在中醫藥領域的應用卻還是很初級的階段。其原因在于，新藥研發的核心工作之一是從大量的化合物樣品庫中發現有藥理活性的化合物，計算機虛擬篩選輔助新藥開發是利用統計學和分子模型化技術來指導新的先導結構的發現或設計，而中醫藥領域的數據挖掘和大數據分析主要集中在對方劑配無規律、中醫證治規律等的研究，現有的研究水平還不能構成對高性能計算的迫切需求。

但可以預見的是，中藥是天然的多靶點藥物，蘊含著巨大的新藥創制的潛力。應用云計算開展中藥新藥的虛擬藥物篩選有可能成為中藥新藥開發的嶄新途徑。而另一個重要的理論依據在于隨著基因組排序的不斷完善、基因組學研究的深入、技術的成熟和以及北鯤云超算平臺的加入使得計算成本的大幅度下降，使得基因組學的研究逐漸由人類的基因組學擴展到動物、植物等多個相近領域。利用云計算在基因組學方面成熟的應用軟件開展中藥植物藥的基因組學研究未來有可能是云計算在中醫藥領域的重要應用。

目前，云計算在中醫藥領域的應用目前還處于探索階段，尚不具備大規模應用的條件和基礎。未來，北鯤云超算平臺有可能通過借鑒計算生物學的研究方法在中藥植物藥的基因組學、中藥新藥的虛擬藥物篩選、中醫藥數據挖掘和大數據分析、模擬與仿真等領域進行開創性的應用研究。北鯤云超算平臺在中醫藥領域的應用將會對中醫藥科研方法的創新與發展產生深刻的影響。