新藥研發周期越來越短,北鯤云超算平臺如何提高藥企競爭力?

隨著生物醫藥和高性能計算的迅猛發展、高通量手段的成熟,生物醫藥行業研究數據急劇膨脹,這些數據離不開高性能計算。高性能計算除了擁有超強的計算能力,還具備高速定制網絡、快速多級存儲、靈活的云平臺等特質,可以有效解決計算密集型、通信密集型、存儲密集型這三類生物醫藥大數據問題。除了高性能計算之外,近幾年興起的云計算,也可以達到形同的作用。近兩年在藥物研發領域初露鋒芒的北鯤云超算平臺,就取得了業內不少的好評。借助北鯤云超算平臺不僅可以加速藥物篩選和分子分析,使新藥的研發周期大幅縮短,并且在基因工程、藥物設計等領域發揮著越來越大的作用。

 

比如,從上世紀90年代開始“人類基因組計劃”、“生物芯片”等內容,人類第一次完整全基因組的測序花了13年,在高性能計算的加持下,這個時間如今已經降低到1天以內。還有近年來PD-1信號通路的發現,使得人類在戰勝癌癥的道路上更近了一大步、誘導多能干細胞iPSC技術和基因編輯技術!CRISPR(使得I型糖尿病有望得到根治)以及去年嚴重的疫情,更多的樣本集、更快的數據提煉,可以幫助更快的研發生產出疫苗;等眾多科研成果都證明了高性能計算在生物工程中的重要性。

 

云計算的興起還改變了科學家獲取算力、享受超算服務的方式,比如北鯤云超算平臺。不僅能夠幫助科研人員在云上搭建高性能集群系統,滿足藥物研發人員對高性能計算資源的需求。

 

除此之外,北鯤云超算平臺接入了規模龐大且靈活云上算力資源,研究人員可以根據自身研究項目的大小按需購買算力資源,不用擔心經費問題以及被算力規模限制了研發速度的問題。

 

我們知道,藥物研發是一個非常復雜的過程,因此也非常耗時,藥物篩選只是流程前期一個環節。例如,在研制疫苗時期,需要首先尋找跟蛋白病毒酶結合的小分子,由于存在不同種類或研究機構的配體(小分子)庫,配體(小分子)庫數量巨大,每個配體庫的配體數量成千上萬,甚至更大,通過實驗方式一一測試驗證顯然不能在短時間內找到合適的匹配藥物。只有通過計算機數值模擬進行篩選,對不同配體的結合效果進行打分,篩選結合模式合理的一些配體作為候選藥物,然后再進行實驗驗證,這樣才能夠有效加速藥物的研究進程。

 

北鯤云超算平臺提供的就是這樣一種服務,要實現藥物的高效率篩選,還需要我們前文提到的高通量手段,這也是北鯤云超算平臺為藥企提供的一站式解決方案之一。

 

 

 

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