最新冷凍電鏡(cryo-EM)圖像重構GPU工作站配置推薦2021v3

2021年7月8日 09:16
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（一）GPU計算卡升級換代

【GPU計算卡】已經升級換代，已經從RTX20系列升級到RTX30系列，可供選擇的高速GPU卡：RTX3070、RTX3080、RTX3090、RTX A6000，處理性能大幅提升，其算力大致如下：

No

型號

卡數

CUDA核數

FP32    (單位Tflops）

張量計算FP16(單位Tflops)

顯存帶寬GBs

顯存合計GB

1

A6000

8塊

86016

320

2496

768

384

2

RTX3090

8塊

83968

285

2280

936

192

3

A6000

7塊

75264

280

2184

768

336

4

RTX3090

7塊

73472

249

1995

936

168

5

A6000

6塊

64512

240

1872

768

288

6

RTX3080

8塊

69632

238

1904

760

80

7

A5000

8塊

65536

222

1728

768

192

8

RTX3090

6塊

62976

213

1710

936

144

9

A6000

5塊

53760

200

1560

768

240

10

RTX3080

6塊

52224

179

1428

760

60

11

RTX3090

5塊

52480

178

1425

936

120

12

A5000

6塊

49152

166

1302

768

144

13

A6000

4塊

43008

160

1248

768

192

14

RTX3080

5塊

43520

149

1190

760

50

15

RTX3090

4塊

41984

142

1140

936

96

16

RTX3080Ti

4塊

69632

136

1064

912

48

17

RTX3070

7塊

41216

142

1141

448

56

18

A5000

5塊

40960

139

1085

768

120

19

RTX3070

6塊

35328

122

978

448

48

20

RTX3080

4塊

34816

119

952

760

40

21

A5000

4塊

32768

111

868

768

96

22

RTX3090

3塊

41984

107

855

936

72

23

RTX3080Ti

3塊

34816

102

798

912

36

24

RTX3070

5塊

29440

102

815

448

40

25

RTX3080

3塊

34816

89

714

760

40

26

A5000

3塊

24576

83

651

768

72

27

RTX3070

4塊

23552

81

652

448

32

28

A6000

2塊

21504

80

624

768

96

29

RTX3090

2塊

20992

71

570

936

48

30

RTX3080Ti

2塊

20480

68

532

912

24

31

RTX3070

3塊

23552

61

489

448

24

32

RTX3080

2塊

17408

60

476

760

20

33

A5000

2塊

16384

55

432

768

48

34

RTX3070

2塊

11776

41

326

448

16

35

A6000

1塊

10752

40

312

768

48

36

RTX3090

1塊

10496

36

285

936

24

37

RTX3080Ti

1塊

10240

34

266

912

12

38

RTX3080

1塊

8704

30

238

760

10

39

A5000

1塊

8192

28

217

768

24

40

RTX3070

1塊

5888

20

163

448

8

 

另外，與以前的版本相比，【RELION 3.1】中的新功能允許更快、更自動化和更高分辨率的冷凍電鏡結構測定。

RTX3090處理能力的測試截圖：

最新冷凍電鏡(cryo-EM)圖像重構GPU工作站配置推薦2021v3的圖1

相關測試證明 RTX3090比上一代RTX2080ti，3D分類 加速40%，二維分類加速70%

數據來源：https://www.linuxvixion.com/blog/relion-fastest-ever-benchmark/




（二）UltraLAB冷凍電鏡計算設備機型介紹

西安坤隆計算機科技有限公司自2019年推出基于冷凍電鏡圖像重構工作站配置方案，至今已二年多，UltraLAB工作站將升級換代，推出新機型配置方案，其特點具有架構更新、計算速度更快、存儲容量更大。


第1類  UltraLAB GA300/GT410（服務器級）產品特點


最新冷凍電鏡(cryo-EM)圖像重構GPU工作站配置推薦2021v3的圖2
技術規格

NO

機型

GA300

GT410

1

CPU

Intel 11代高頻處理器

6核@4.8GHz

8核@4.8GHz

 

Intel10代至尊處理器

12核@4.5GHz

14核@4.4GHz

18核@4.2GHz

2

芯片組

Z590+PCH

X299+PCH

3

內存

DDR4 3200

最大128GB

DDR4 2933

最大256GB

4

GPU

最大2塊（雙/三槽卡）

雙PCIe 4.0 x8

最大2塊（三槽卡）

最大4塊(雙槽卡)

5

硬盤位

8個3.5寸

最大144TB

8個3.5寸

最大144TB

6

電源

2000W

2000W

特點：
【GA300機型】支持PCIe 4.0 x16，如果是雙卡，每個卡的接口PCIe 4.0 x8，相當于PCIe 3.0 x16
【GT410機型】最大特點是內存比GA300能提供更大容量內存



第2類 GT400P/GX630M（工作站級）產品特點
最新冷凍電鏡(cryo-EM)圖像重構GPU工作站配置推薦2021v3的圖3

技術規格

NO

機型

GT410P

GX630M

1

CPU

Intel10代至尊處理器

12核@4.5GHz

14核@4.4GHz

18核@4.2GHz

2顆Xeon 二代可擴展處理器

82xx/6200x/5200x系列

2

芯片組

X299+PCH

C621+PCH

3

內存

DDR4 3200

最大256GB

DDR4 2933/2666

最大1TB

4

GPU

最大4塊（雙/三槽卡）

四個PCIe 3.0 x8

最大6塊（三槽卡）

最大7塊(雙槽卡)

6個PCIe 3.0 x16（全速）

5

硬盤位

16個3.5寸

最大270TB

16個3.5寸

最大270TB

6

電源

雙2000W

雙2000W

7

噪音等級

靜音級

靜音級

特點：
GT410P機型 與其他品牌機器相比，這是市場上唯一可以支持4塊三槽GPU卡、最大270TB，同時靜音的工作站。
GX630M機型最大特點是目前市場上唯一支持6塊三槽GPU卡，全部PCIe x16，最大270TB存儲，還能整機保證靜音級。

（三）冷凍電鏡GPU工作站硬件配置推薦2021v3

NO

品牌與型號

配置規格

算力

FP32

Tflops

價格

求解能力

圖片分辨率參考

1

GA300 14864-24T2X

6核@4.8GHz / 64GB DDR4 /2*RTX3070 8GB/500GB M2.SSD系統盤 /2*14TB SATA企業級/塔式(1500w)/27寸-4K顯示器

41T

58500

200x200

2

GA300 148128-42T2X

8核@4.8GHz / 128GB DDR4 /2*RTX3080 10GB /1TB M2.SSD系統盤 / /3*14TB SATA企業級/塔式(2000w)/ 27寸-2K顯示器

60T

79990

360x360

3

GT410 145128-48T2T

12核@4.5GHz / 128GB DDR4 /2*RTX3090 24GB/1TB M2.SSD系統盤 /3*16TB SATA企業級/塔式(2000w)/ 27寸-4K顯示器

71T

99990

360x360

4

GT410P 144192-84T4X

14核@4.4GHz / 192GB DDR4 /4*RTX3080 10GB/2TB M2.SSD系統盤 /6*14TB SATA企業級/雙塔(2*2000w)/ 27寸-4K顯示器

119T

155000

360x360

最新冷凍電鏡(cryo-EM)圖像重構GPU工作站配置推薦2021v3的圖45

GT410P 144192-98T4T

14核@4.4GHz / 192GB DDR4 /4*RTX3090 24GB/480GB SSD/2TB M2.SSD系統盤 /98T并行存儲/雙塔(2*2000w)/ 27寸-4K顯示器

142T

185000

400x400

6

GX630M 234256-126T6X

2顆Xeon 金牌6226R（32核@3.4GHz ）/ 256GB DDR4 /6*RTX3080 /480GB SSD/2TB M2.SSD系統盤 /126TB并行存儲/雙塔(2*2000w)/ 27寸-4K顯示器

179T

229000

500x500

7

GX630M 234320-210T6T

2顆Xeon 金牌6226R（32核@3.4GHz ）/ 320GB DDR4 /6*RTX3090 /960GB SSD/2TB M2.SSD系統盤 /150TB并行存儲/雙塔(2*2000w)/ 27寸-4K顯示器

213T

283000

600x600

8

GX630M 234384-240T6E

2顆Xeon 金牌6226R（32核@3.4GHz ）/ 384GB DDR4 /6*A6000 48GB /960GB SSD/2TB M2.SSD系統盤 /240TB并行存儲/雙塔(2*2000w)/ 27寸-4K顯示器

240T

499900

600x600

 
關于RELION基準測試和計算機硬件資料  
https://www3.mrc-lmb.cam.ac.uk/relion/index.php/Benchmarks_%26_computer_hardware#Accelerated_RELION.2C_using_GPUs_or_CPU-vectorization

 

上述所有配置，代表最新硬件架構，同時保證是最完美，最快，如有不符，欲咨詢機器處理速度如何、技術咨詢、索取詳細技術方案，提供遠程測試，請聯系


UltraLAB圖形工作站供貨商：
西安坤隆計算機科技有限公司
國內知名高端定制圖形工作站廠家
業務電話：400-705-6800

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