分子動力學模擬是一種研究分子體系結構與性質的重要方法，已被廣泛用于化學化工、生物醫藥、材料科學與工程、物理等學科領域。傳統實驗需要大量的人力物力而且耗時，而計算機模擬的方法省時省力，可以用來求解解析理論無法求解的問題，模擬實驗做起來困難或不可能做的條件，得到更貼近實際體系的結果。LAMMPS分子動力學程序是一款開源而免費的軟件，可以模擬成千上萬甚至幾百萬個原子、分子，常用于模擬液體中的粒子，固體和汽體的系綜，也可以采用不同的力場和邊界條件來模擬全原子，聚合物，生物，金屬，粒狀和粗料化體系。

為全力做好秋季開學疫情防控工作，各地和學校按照“最大限度復學、最嚴標準防控”原則全面推進恢復正常教育教學秩序，各級教育主管部門也將繼續通過開展網絡教學銜接高校師生開學后教學科研工作。應新老客戶的培訓需求，北京軟研國際信息技術研究院特舉辦““LAMMPS分子動力學技術與應用”線上實戰培訓，本次培訓由互動派（北京）教育科技有限公司具體承辦，通過本次培訓，能夠了解LAMMPS是什么？能干什么？怎么用？以及如何從簡單的例子開始學起，走通整個模擬流程，做出能夠發表的結果，具體事宜通知如下：

一、時間地點： （非工作日9：00-17：00，工作日19：00-21：00） 

2020年10月11日—10月12日   在線直播

2020年10月17日—10月18日   在線直播

二、報名費用：

每人￥3300元（含報名費、培訓費、資料費、證書費）

優惠一：9月21號之前報名匯款可享受優惠 200元（名額有限）；

優惠二：同一單位同時參加2人及以上可享受每人200元學費優惠；；

費用提供正規發 票及蓋有公章的紙質通知文件；如需開具會議費的單位請聯系招生老師要會議邀請函；

 

三、培訓特色：

1、本次課程共計20小時，采用非工作日上午和下午各三小時、工作日晚上兩個小時教學，全部線上實訓教學方式；小班授課，對知識進行由淺入深，層層遞進，系統講解；配合案例解析邊講邊練，讓學員能運用模擬軟件針對每個技術點進行上機操作；通過認真閱讀文獻中分子動力學的描述，能夠編寫in文件，以復現文獻的結果，在此基礎上開展自己的研究；在線學習后對學員提煉出的問題提供專業指導，從而更好地滿足學員不同方面的論文及實際科研需求；

2、課堂上建立專屬班級交流平臺，學員學完后可以繼續在班級群與老師同學交流問題，鞏固學習內容。

四、培訓課表：

“LAMMPS分子動力學模擬技術與應用”專題線上培訓

課  程	內   容
第一天 上午 LAMMPS基礎	1  分子動力學模擬入門理論——掌握LAMMPS的in文件中各命令的意義 1.1系綜理論 1.2主要算法介紹 1.3積分步長的選取 1.4溫度和壓力控制 1.5周期性邊界條件 1.6分子動力學模擬流程
第一天 下午 LAMMPS入門學習	2  LAMMPS入門操作基礎 2.1 Linux命令入門基礎——掌握運行LAMMPS常用的Linux命令 2.2 LAMMPS中一些安裝包的介紹——為以后創建自己體系進行選擇性安裝 2.3 LAMMPS的linux版串行和并行及GPU版編譯安裝——掌握LAMMPS的編譯方法，針對自己體系編譯可執行文件。 2.4 LAMMPS的in文件結構格式，基本語法及常用命令講解、data文件格式。 2.5 LAMMPS實例講解。 : 實例操作：在linux系統編譯安裝自己的LAMMPS可執行程序，并運行一個例子。
第二天 上午 Lammps的建模1	3   LAMMPS建模——掌握基本操作流程 3.1  LAMMPS各種參數計算 3.1.1 顆粒模擬 3.1.2 可視化快照 3.1.3 彈性常數模擬 3.1.4 計算熱導率 3.1.5 計算粘度 3.1.6 計算均方位移 3.1.7 計算徑向分布函數 3.1.8 計算擴散系數 3.1.9 計算能量數據 3.1.10 Lammps常見錯誤及解決途徑 : 實例操作：學員結合自己的科研方向，選擇運行契合自己研究方向的例子 3.2  lattice命令語法學習及建模實操（金屬、合金等晶體建模）       3.3  packmol 建模語法學習及建模實操（含多種分子成分的模擬體系建模） : 實例操作：把上述實操模型轉換成lammps的data文件
第二天 下午 Lammps的建模2	4   LAMMPS建模——掌握基本操作流程 4.1  根據分子結構繪制小分子模型、多個模型的合并處理，添加力場及使用msi2lmp.exe工作得到data文件  4.2  VMD、OVITO建模學習及實操（用于建模\模型及軌跡文件顯示分析處理等） : 實例操作：把上述實操模型轉換成lammps的data文件
第三天  從examples的簡單例子學起	5   通過examples中的例子，理解要模擬對象的物理意義 5.1  運行examples\flow 兩個簡單例子并做可視化處理 : 練習與思考：  5-1 把二維couette流動擴展成三維，并輸出流體的速度和密度分布 5-2 把二維poiseuille流動擴展成三維，并輸出流體的速度和密度分布 5-3 建立三維管道內的poiseuille流動 5-4 進行石墨烯通道內的Couette流動和Poiseuille流動模擬 5-5 調節通道表面電荷性質、親疏水性質，分析其對流動性質的影響 5-6 模擬體系中水更改為KCl溶液 5.2  運行并理解examples\shear   到石墨烯、金屬鈦拉壓模擬 5.3  運行并理解examples\friction  到金屬/合金的摩擦模擬
第四天 理解并復現文獻內容1 環氧樹脂在二氧化硅表面吸附模擬(CVFF力場)	6 環氧樹脂在二氧化硅表面吸附吸能的影響     6.1 建立模擬體系的初始模型 6.2運行能量最小化及體系的預松弛 6.3壓縮盒子達到指定的密度（針對不同研究體系掌握壓縮方法的不同，并掌握判斷方法和依據） 6.4模擬步驟：包括能量最小化-NVT平衡-N PT平衡-對研究目標的性質進行長時間軌跡平衡-輸出研究所關心的性質。 6.5查看動態軌跡和特殊幀的圖片顯示(采用VMD軟件做出漂亮的圖片和視頻，學會用tcl腳本控制輸出) 6.6數據分析（origin軟件的使用） 6.6.1 MSD分析 6.6.2 計算RDF 6.6.3 計算密度分布
第四天  理解并復現文獻內容2 夾層結構(graphene/C60/graphene)摩擦性質模擬 （AIREBO力場）	7  夾層結構(graphene/C60/graphene)不同粗糙度條件下的摩擦性能研究（復雜模型采用多種建模方式組合而成） 7-1  建立夾層結構(graphene/C60/graphene)不同粗糙度的初始模型 7-2  夾層結構的應力-應變曲線性能研究 7-3  夾層結構摩擦性質研究

六、頒發證書：

參加相關培訓并通過考試的學員，可以獲得： 北京軟研國際信息技術研究院培訓中心頒發的《LAMMPS 分子動力學模擬技術與應用》專業技能結業證書。

七、聯系方式：

報名電話：18618288284                聯 系 人: 唐老師                                

報名郵箱：18611330667@163.com        報名QQ: 2720927402 微信：17800209174 

【注】開課前一周會務組統一通知；開課前一天會將直播鏈接及上機賬號發至您郵箱或微信。如未收到請及時電話咨詢！

注：

本次培訓案例模型皆為老師論文模型以及自建模型

十、培訓優勢

1、本次培訓采用最新版軟件

2、上課時采用騰訊會議直播，之前舉辦線下培訓，很多學員反映，投影儀畫質比較差以及部分學員座位距離課堂屏幕較遠看不清，大大降低了培訓質量，以及很多學員要從外地趕來舟車勞頓再加上差旅費比較高，再加上疫情影響很多學員不能外出，所以這次線上的培訓是最好的學習方法

3、授課采取面對面授課，通過微信群和老師連麥解決疑問，老師同步跟蹤每個學員，讓每個學員都能夠跟得上，學的好，包括自己科研中模型，論文問題，都可以請教老師

十一、培訓疑惑解答:

很多學員有疑惑我是初學者怎么辦，這個課程是否適合我?本單位已舉辦lammps培訓三年，參加培訓人員800余人，經統計參加培訓學員%80為初學者，%15為中級學者，%5為高級學者，培訓課程設計為初中級學者，所以請放心來學習我想學的不知道你們課程會不會涉及到以及看到培訓文件里面沒有，這個怎么辦?由于培訓文件只能一個大綱的簡介，如果學員有疑惑可以將想學的內容發于我四天的培訓課程能學到什么?四天二十個小時進行系統的培訓，讓學員能自己去獨立建立模型，以及建模模型時常遇到的問題應該怎么解決，直到后期能夠自己獨立建立自己論文或者項目的模型為什么四天課程不一起上呢?經過前期的線上培訓，采用2+2培訓，讓學員有充足的時間去消化吸收解疑，并且很多學員平時比較忙，沒有那么多的時間，我們就把培訓放在周末，不耽誤工作日的時間，讓學員的學習效果達到最好